RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478279.5

APTX-222, Transcript of aprataxin, human

TSL 1 (best)

Gene APTX, Length 684 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
APTX-222	ENST00000478279	CHAD	O15335	359 aa		11.65	□□□□□ -0.54
APTX-222	ENST00000478279	EPN2	O95208	641 aa		11.65	□□□□□ -0.54
APTX-222	ENST00000478279	PRKCB	P05771	671 aa		11.65	□□□□□ -0.54
APTX-222	ENST00000478279	KPNA1	P52294	538 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
APTX-222	ENST00000478279	EPHA5	P54756	1037 aa		11.65	□□□□□ -0.54
APTX-222	ENST00000478279	DCAF4L1	Q3SXM0	396 aa		11.65	□□□□□ -0.54
APTX-222	ENST00000478279	WDR44	Q5JSH3	913 aa		11.65	□□□□□ -0.54
APTX-222	ENST00000478279	EEF1DP3	Q658K8	133 aa		11.65	□□□□□ -0.54
APTX-222	ENST00000478279		Q6ZS52	159 aa		11.65	□□□□□ -0.54
APTX-222	ENST00000478279	PIK3AP1	Q6ZUJ8	805 aa		11.65	□□□□□ -0.54
APTX-222	ENST00000478279	YAF2	Q8IY57	180 aa		11.65	□□□□□ -0.54
APTX-222	ENST00000478279	LEMD2	Q8NC56	503 aa		11.65	□□□□□ -0.54
APTX-222	ENST00000478279	C3orf58	Q8NDZ4	430 aa		11.65	□□□□□ -0.54
APTX-222	ENST00000478279	ZNF274	Q96GC6	653 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
APTX-222	ENST00000478279	LSM14B	Q9BX40	385 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
APTX-222	ENST00000478279	GPR88	Q9GZN0	384 aa		11.65	□□□□□ -0.54
APTX-222	ENST00000478279	GOLGA2P5	Q9HBQ8	144 aa		11.65	□□□□□ -0.54
APTX-222	ENST00000478279	C2orf42	Q9NWW7	574 aa		11.65	□□□□□ -0.54
APTX-222	ENST00000478279	USP20	Q9Y2K6	914 aa		11.65	□□□□□ -0.54
APTX-222	ENST00000478279		A0A087WWV3	80 aa		11.64	□□□□□ -0.55
APTX-222	ENST00000478279	MYBPHL	A2RUH7	354 aa		11.64	□□□□□ -0.55
APTX-222	ENST00000478279	SLC38A8	A6NNN8	435 aa		11.64	□□□□□ -0.55
APTX-222	ENST00000478279	SYN3	O14994	580 aa		11.64	□□□□□ -0.55
APTX-222	ENST00000478279	CDC45	O75419	566 aa		11.64	□□□□□ -0.55
APTX-222	ENST00000478279	EDN1	P05305	212 aa		11.64	□□□□□ -0.55
APTX-222	ENST00000478279	MYL4	P12829	197 aa		11.64	□□□□□ -0.55
APTX-222	ENST00000478279	GJA1	P17302	382 aa		11.64	□□□□□ -0.55
APTX-222	ENST00000478279	RAP1GAP	P47736	663 aa		11.64	□□□□□ -0.55
APTX-222	ENST00000478279	SOX9	P48436	509 aa		11.64	□□□□□ -0.55
APTX-222	ENST00000478279	FCHO2	Q0JRZ9	810 aa		11.64	□□□□□ -0.55
APTX-222	ENST00000478279	TOB2	Q14106	344 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
APTX-222	ENST00000478279	MRPL58	Q14197	206 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
APTX-222	ENST00000478279	TEAD2	Q15562	447 aa		11.64	□□□□□ -0.55
APTX-222	ENST00000478279	CCDC6	Q16204	474 aa		11.64	□□□□□ -0.55
APTX-222	ENST00000478279	TXNDC11	Q6PKC3	985 aa		11.64	□□□□□ -0.55
APTX-222	ENST00000478279	CACNA2D4	Q7Z3S7	1137 aa		11.64	□□□□□ -0.55
APTX-222	ENST00000478279	RALGPS2	Q86X27	583 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
APTX-222	ENST00000478279	SYNPO	Q8N3V7	929 aa		11.64	□□□□□ -0.55
APTX-222	ENST00000478279	OXER1	Q8TDS5	423 aa		11.64	□□□□□ -0.55
APTX-222	ENST00000478279	GAB3	Q8WWW8	586 aa		11.64	□□□□□ -0.55
APTX-222	ENST00000478279	RSPRY1	Q96DX4	576 aa		11.64	□□□□□ -0.55
APTX-222	ENST00000478279	CCDC113	Q9H0I3	377 aa		11.64	□□□□□ -0.55
APTX-222	ENST00000478279	ASAH2	Q9NR71	780 aa		11.64	□□□□□ -0.55
APTX-222	ENST00000478279	CEP72	Q9P209	647 aa		11.64	□□□□□ -0.55
APTX-222	ENST00000478279	AFF4	Q9UHB7	1163 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
APTX-222	ENST00000478279	FBXL5	Q9UKA1	691 aa		11.64	□□□□□ -0.55
APTX-222	ENST00000478279	ZMIZ1	Q9ULJ6	1067 aa		11.64	□□□□□ -0.55
APTX-222	ENST00000478279	MAFF	Q9ULX9	164 aa		11.64	□□□□□ -0.55
APTX-222	ENST00000478279	AKAP13	Q12802	2813 aa		11.64	□□□□□ -0.55
APTX-222	ENST00000478279	CCDC163	A0A0D9SF12	145 aa		11.63	□□□□□ -0.55
APTX-222	ENST00000478279	SMIM28	A0A1B0GU29	152 aa		11.63	□□□□□ -0.55
APTX-222	ENST00000478279	C1QTNF9B	B2RNN3	333 aa		11.63	□□□□□ -0.55
APTX-222	ENST00000478279	SPECC1L-ADORA2A	F8WAN1	911 aa		11.63	□□□□□ -0.55
APTX-222	ENST00000478279	C1QTNF9	P0C862	333 aa		11.63	□□□□□ -0.55
APTX-222	ENST00000478279	HOXB3	P14651	431 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
APTX-222	ENST00000478279	XBP1	P17861	261 aa		11.63	□□□□□ -0.55
APTX-222	ENST00000478279	ATP2B1	P20020	1258 aa		11.63	□□□□□ -0.55
APTX-222	ENST00000478279	HOXC13	P31276	330 aa		11.63	□□□□□ -0.55
APTX-222	ENST00000478279	CTH	P32929	405 aa		11.63	□□□□□ -0.55
APTX-222	ENST00000478279	NAMPT	P43490	491 aa		11.63	□□□□□ -0.55
APTX-222	ENST00000478279	SOX4	Q06945	474 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
APTX-222	ENST00000478279	TWF1	Q12792	350 aa		11.63	□□□□□ -0.55
APTX-222	ENST00000478279	CCIN	Q13939	588 aa		11.63	□□□□□ -0.55
APTX-222	ENST00000478279	CALCRL	Q16602	461 aa		11.63	□□□□□ -0.55
APTX-222	ENST00000478279	EARS2	Q5JPH6	523 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
APTX-222	ENST00000478279	PLA2G2C	Q5R387	149 aa		11.63	□□□□□ -0.55
APTX-222	ENST00000478279	UNQ6494/PRO21346	Q6UXR6	183 aa		11.63	□□□□□ -0.55
APTX-222	ENST00000478279	KDF1	Q8NAX2	398 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
APTX-222	ENST00000478279	SHKBP1	Q8TBC3	707 aa		11.63	□□□□□ -0.55
APTX-222	ENST00000478279	FAM200A	Q8TCP9	573 aa		11.63	□□□□□ -0.55
APTX-222	ENST00000478279	BSND	Q8WZ55	320 aa		11.63	□□□□□ -0.55
APTX-222	ENST00000478279	SLITRK6	Q9H5Y7	841 aa		11.63	□□□□□ -0.55
APTX-222	ENST00000478279	TTC12	Q9H892	705 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
APTX-222	ENST00000478279	PCDHGA5	Q9Y5G8	931 aa		11.63	□□□□□ -0.55
APTX-222	ENST00000478279	DMXL2	Q8TDJ6	3036 aa		11.63	□□□□□ -0.55
APTX-222	ENST00000478279	NBEA	Q8NFP9	2946 aa		11.63	□□□□□ -0.55
APTX-222	ENST00000478279	PODXL	O00592	558 aa		11.62	□□□□□ -0.55
APTX-222	ENST00000478279	RPP40	O75818	363 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
APTX-222	ENST00000478279	LIG1	P18858	919 aa		11.62	□□□□□ -0.55
APTX-222	ENST00000478279	ACAP1	Q15027	740 aa		11.62	□□□□□ -0.55
APTX-222	ENST00000478279	CTXN3	Q4LDR2	81 aa		11.62	□□□□□ -0.55
APTX-222	ENST00000478279	XKR4	Q5GH76	650 aa		11.62	□□□□□ -0.55
APTX-222	ENST00000478279	NT5DC1	Q5TFE4	455 aa		11.62	□□□□□ -0.55
APTX-222	ENST00000478279	ATF7IP2	Q5U623	682 aa		11.62	□□□□□ -0.55
APTX-222	ENST00000478279	PSAPL1	Q6NUJ1	521 aa		11.62	□□□□□ -0.55
APTX-222	ENST00000478279	ALKAL1	Q6UXT8	129 aa		11.62	□□□□□ -0.55
APTX-222	ENST00000478279	RUFY3	Q7L099	469 aa		11.62	□□□□□ -0.55
APTX-222	ENST00000478279	APBB1IP	Q7Z5R6	666 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
APTX-222	ENST00000478279	KBTBD6	Q86V97	674 aa		11.62	□□□□□ -0.55
APTX-222	ENST00000478279	DEPTOR	Q8TB45	409 aa		11.62	□□□□□ -0.55
APTX-222	ENST00000478279	VPS45	Q9NRW7	570 aa		11.62	□□□□□ -0.55
APTX-222	ENST00000478279	GJB4	Q9NTQ9	266 aa		11.62	□□□□□ -0.55
APTX-222	ENST00000478279	SLC38A7	Q9NVC3	462 aa		11.62	□□□□□ -0.55
APTX-222	ENST00000478279	SMG1	Q96Q15	3661 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
APTX-222	ENST00000478279	FAM205C	A6NFA0	338 aa		11.61	□□□□□ -0.55
APTX-222	ENST00000478279	EXTL3	O43909	919 aa		11.61	□□□□□ -0.55
APTX-222	ENST00000478279	AKAP3	O75969	853 aa		11.61	□□□□□ -0.55
APTX-222	ENST00000478279	CDKL5	O76039	1030 aa		11.61	□□□□□ -0.55
APTX-222	ENST00000478279	SPATA31C1	P0DKV0	1188 aa		11.61	□□□□□ -0.55
APTX-222	ENST00000478279	TXK	P42681	527 aa		11.61	□□□□□ -0.55

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