RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425184.5

RBM39-210, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 3

Gene RBM39, Length 526 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-210ENST00000425184 ELANEP08246 267 aa5.06□□□□□ -1.6
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RBM39-210ENST00000425184 CCND1P24385 295 aa5.06□□□□□ -1.6
RBM39-210ENST00000425184 HSD11B2P80365 405 aa5.06□□□□□ -1.6
RBM39-210ENST00000425184 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP5.06□□□□□ -1.6
RBM39-210ENST00000425184 PTPN21Q16825 1174 aa5.06□□□□□ -1.6
RBM39-210ENST00000425184 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa5.06□□□□□ -1.6
RBM39-210ENST00000425184 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
RBM39-210ENST00000425184 PPP4R3AQ6IN85 833 aa5.06□□□□□ -1.6
RBM39-210ENST00000425184 FAM43AQ8N2R8 423 aa5.06□□□□□ -1.6
RBM39-210ENST00000425184 RNF31Q96EP0 1072 aa5.06□□□□□ -1.6
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RBM39-210ENST00000425184 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
RBM39-210ENST00000425184 KCNE5Q9UJ90 142 aa5.06□□□□□ -1.6
RBM39-210ENST00000425184 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa5.06□□□□□ -1.6
RBM39-210ENST00000425184 IPPQ9Y573 584 aa5.06□□□□□ -1.6
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RBM39-210ENST00000425184 CCDC154A6NI56 674 aa5.05□□□□□ -1.6
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RBM39-210ENST00000425184 NUP133Q8WUM0 1156 aa5.05□□□□□ -1.6
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RBM39-210ENST00000425184 GALNT9Q9HCQ5 603 aa5.05□□□□□ -1.6
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RBM39-210ENST00000425184 USP25Q9UHP3 1055 aa5.05□□□□□ -1.6
RBM39-210ENST00000425184 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
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RBM39-210ENST00000425184 AATKQ6ZMQ8 1374 aa5.04□□□□□ -1.6
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RBM39-210ENST00000425184 NOMO3P69849 1222 aa5.04□□□□□ -1.6
RBM39-210ENST00000425184 COL10A1Q03692 680 aa5.04□□□□□ -1.6
RBM39-210ENST00000425184 IL10RAQ13651 578 aa5.04□□□□□ -1.6
RBM39-210ENST00000425184 UAP1L1Q3KQV9 507 aa5.04□□□□□ -1.6
RBM39-210ENST00000425184 C3orf36Q3SXR2 165 aa5.04□□□□□ -1.6
RBM39-210ENST00000425184 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
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RBM39-210ENST00000425184 PNKPQ96T60 521 aa5.04□□□□□ -1.6
RBM39-210ENST00000425184 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
RBM39-210ENST00000425184 TMEM74BQ9NUR3 256 aa5.04□□□□□ -1.6
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RBM39-210ENST00000425184 ABCC10Q5T3U5 1492 aa5.04□□□□□ -1.6
RBM39-210ENST00000425184 SHROOM2Q13796 1616 aa5.04□□□□□ -1.6
RBM39-210ENST00000425184 KIF13AQ9H1H9 1805 aa5.04□□□□□ -1.6
RBM39-210ENST00000425184 OVOL3O00110 214 aa5.03□□□□□ -1.6
RBM39-210ENST00000425184 GRM6O15303 877 aa5.03□□□□□ -1.6
RBM39-210ENST00000425184 LMNAP02545 664 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
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RBM39-210ENST00000425184 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
RBM39-210ENST00000425184 BMP5P22003 454 aa5.03□□□□□ -1.6
RBM39-210ENST00000425184 FDXRP22570 491 aa5.03□□□□□ -1.6
RBM39-210ENST00000425184 EDNRBP24530 442 aa5.03□□□□□ -1.6
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RBM39-210ENST00000425184 TBCCD1Q9NVR7 557 aa5.03□□□□□ -1.6
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RBM39-210ENST00000425184 SEC24CP53992 1094 aa5.02□□□□□ -1.61
RBM39-210ENST00000425184 SLFN5Q08AF3 891 aa5.02□□□□□ -1.61
RBM39-210ENST00000425184 ODF1Q14990 250 aa5.02□□□□□ -1.61
RBM39-210ENST00000425184 GPR149Q86SP6 731 aa5.02□□□□□ -1.61
RBM39-210ENST00000425184 TTC7BQ86TV6 843 aa5.02□□□□□ -1.61
RBM39-210ENST00000425184 COLGALT2Q8IYK4 626 aa5.02□□□□□ -1.61
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RBM39-210ENST00000425184 KAT5Q92993 513 aa5.02□□□□□ -1.61
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