RNA–Protein interactions for RNA: tW(CCA)K

tW(CCA)K, Transcript of Tryptophan tRNA (tRNA-Trp), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tW(CCA)K, Length 72 nt, Biotype tRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tW(CCA)KtW(CCA)K DIT1P21623 536 aa2.11□□□□□ -2.07
tW(CCA)KtW(CCA)K TOM40P23644 387 aaKnown RBP2.11□□□□□ -2.07
tW(CCA)KtW(CCA)K PRE7P23724 241 aaKnown RBP2.11□□□□□ -2.07
tW(CCA)KtW(CCA)K YCR101CP25607 182 aa2.11□□□□□ -2.07
tW(CCA)KtW(CCA)K YCR061WP25639 631 aa2.11□□□□□ -2.07
tW(CCA)KtW(CCA)K SUA7P29055 345 aaPredicted RBP2.11□□□□□ -2.07
tW(CCA)KtW(CCA)K VMA5P31412 392 aaKnown RBP2.11□□□□□ -2.07
tW(CCA)KtW(CCA)K VMA6P32366 345 aaKnown RBP2.11□□□□□ -2.07
tW(CCA)KtW(CCA)K RNP1P32385 249 aa2.11□□□□□ -2.07
tW(CCA)KtW(CCA)K REC104P33323 182 aa2.11□□□□□ -2.07
tW(CCA)KtW(CCA)K CBT1P36038 271 aaPredicted RBP2.11□□□□□ -2.07
tW(CCA)KtW(CCA)K SHE2P36068 246 aaKnown RBP RIP-Chip data2.11□□□□□ -2.07not detected
tW(CCA)KtW(CCA)K PMU1P36069 295 aa2.11□□□□□ -2.07
tW(CCA)KtW(CCA)K NTC20P38302 140 aaPredicted RBP2.11□□□□□ -2.07
tW(CCA)KtW(CCA)K SOL3P38858 249 aa2.11□□□□□ -2.07
tW(CCA)KtW(CCA)K NOP16P40007 231 aaKnown RBP2.11□□□□□ -2.07
tW(CCA)KtW(CCA)K YIL060WP40519 144 aa2.11□□□□□ -2.07
tW(CCA)KtW(CCA)K RPA43P46669 326 aa2.11□□□□□ -2.07
tW(CCA)KtW(CCA)K HNT2P49775 206 aa2.11□□□□□ -2.07
tW(CCA)KtW(CCA)K RPL9BP51401 191 aaKnown RBP2.11□□□□□ -2.07
tW(CCA)KtW(CCA)K SKP1P52286 194 aa2.11□□□□□ -2.07
tW(CCA)KtW(CCA)K YIP1P53039 248 aa2.11□□□□□ -2.07
tW(CCA)KtW(CCA)K NGL2Q03264 515 aaKnown RBP2.11□□□□□ -2.07
tW(CCA)KtW(CCA)K MIX17Q03667 156 aa2.11□□□□□ -2.07
tW(CCA)KtW(CCA)K TSA2Q04120 196 aa2.11□□□□□ -2.07
tW(CCA)KtW(CCA)K SPG4Q04438 115 aa2.11□□□□□ -2.07
tW(CCA)KtW(CCA)K ECM18Q04623 453 aa2.11□□□□□ -2.07
tW(CCA)KtW(CCA)K GPN3Q06543 272 aa2.11□□□□□ -2.07
tW(CCA)KtW(CCA)K YFH1Q07540 174 aa2.11□□□□□ -2.07
tW(CCA)KtW(CCA)K ALG6Q12001 544 aaKnown RBP2.11□□□□□ -2.07
tW(CCA)KtW(CCA)K TGS1Q12052 315 aa2.11□□□□□ -2.07
tW(CCA)KtW(CCA)K BBP1Q12365 385 aa2.11□□□□□ -2.07
tW(CCA)KtW(CCA)K ILV5P06168 395 aaKnown RBP2.1□□□□□ -2.07
tW(CCA)KtW(CCA)K YHR212W-AP0CX91 67 aa2.1□□□□□ -2.07
tW(CCA)KtW(CCA)K CDC34P14682 295 aa2.1□□□□□ -2.07
tW(CCA)KtW(CCA)K BGL2P15703 313 aaKnown RBP2.1□□□□□ -2.07
tW(CCA)KtW(CCA)K RFA1P22336 621 aaKnown RBP2.1□□□□□ -2.07
tW(CCA)KtW(CCA)K RPL24BP24000 155 aaKnown RBP2.1□□□□□ -2.07
tW(CCA)KtW(CCA)K DPB2P24482 689 aaPredicted RBP2.1□□□□□ -2.07
tW(CCA)KtW(CCA)K RNA14P25298 677 aaKnown RBP2.1□□□□□ -2.07
tW(CCA)KtW(CCA)K ELO2P25358 347 aa2.1□□□□□ -2.07
tW(CCA)KtW(CCA)K COQ2P32378 372 aa2.1□□□□□ -2.07
tW(CCA)KtW(CCA)K RAD23P32628 398 aaKnown RBP2.1□□□□□ -2.07
tW(CCA)KtW(CCA)K AGA2P32781 87 aa2.1□□□□□ -2.07
tW(CCA)KtW(CCA)K CPR5P35176 225 aa2.1□□□□□ -2.07
tW(CCA)KtW(CCA)K SWD2P36104 329 aaPredicted RBP2.1□□□□□ -2.07
tW(CCA)KtW(CCA)K MRPL36P36531 177 aa2.1□□□□□ -2.07
tW(CCA)KtW(CCA)K YBR137WP38276 179 aa2.1□□□□□ -2.07
tW(CCA)KtW(CCA)K PAC2P39937 518 aa2.1□□□□□ -2.07
tW(CCA)KtW(CCA)K CCS1P40202 249 aaKnown RBP2.1□□□□□ -2.07
tW(CCA)KtW(CCA)K YFL054CP43549 646 aa2.1□□□□□ -2.07
tW(CCA)KtW(CCA)K YJR011CP47086 261 aaPredicted RBP2.1□□□□□ -2.07
tW(CCA)KtW(CCA)K YAE1P47118 141 aaPredicted RBP2.1□□□□□ -2.07
tW(CCA)KtW(CCA)K IMD3P50095 523 aaKnown RBP2.1□□□□□ -2.07
tW(CCA)KtW(CCA)K VHT1P53241 593 aa2.1□□□□□ -2.07
tW(CCA)KtW(CCA)K YMR181CQ03231 154 aa2.1□□□□□ -2.07
tW(CCA)KtW(CCA)K NEJ1Q06148 342 aa2.1□□□□□ -2.07
tW(CCA)KtW(CCA)K MCH1Q07376 486 aa2.1□□□□□ -2.07
tW(CCA)KtW(CCA)K DGK1Q12382 290 aa2.1□□□□□ -2.07
tW(CCA)KtW(CCA)K TFC7Q12415 435 aa2.1□□□□□ -2.07
tW(CCA)KtW(CCA)K YLR358CO13565 187 aa2.09□□□□□ -2.07
tW(CCA)KtW(CCA)K URA6P15700 204 aa2.09□□□□□ -2.07
tW(CCA)KtW(CCA)K RFA3P26755 122 aaKnown RBP2.09□□□□□ -2.07
tW(CCA)KtW(CCA)K INO2P26798 304 aa2.09□□□□□ -2.07
tW(CCA)KtW(CCA)K PEX4P29340 183 aa2.09□□□□□ -2.07
tW(CCA)KtW(CCA)K OCH1P31755 480 aa2.09□□□□□ -2.07
tW(CCA)KtW(CCA)K ERG2P32352 222 aa2.09□□□□□ -2.07
tW(CCA)KtW(CCA)K RPB7P34087 171 aa2.09□□□□□ -2.07
tW(CCA)KtW(CCA)K FLO10P36170 1169 aa2.09□□□□□ -2.07
tW(CCA)KtW(CCA)K YHK8P38776 514 aa2.09□□□□□ -2.07
tW(CCA)KtW(CCA)K RTT105P40063 208 aa2.09□□□□□ -2.07
tW(CCA)KtW(CCA)K PCL7P40186 285 aa2.09□□□□□ -2.07
tW(CCA)KtW(CCA)K SYS1P41544 203 aa2.09□□□□□ -2.07
tW(CCA)KtW(CCA)K GWT1P47026 490 aa2.09□□□□□ -2.07
tW(CCA)KtW(CCA)K VPS55P47111 140 aa2.09□□□□□ -2.07
tW(CCA)KtW(CCA)K ALG9P53868 555 aaKnown RBP2.09□□□□□ -2.07
tW(CCA)KtW(CCA)K HNT1Q04344 158 aaKnown RBP2.09□□□□□ -2.07
tW(CCA)KtW(CCA)K DAL4Q04895 635 aa2.09□□□□□ -2.07
tW(CCA)KtW(CCA)K MSC3Q05812 728 aa2.09□□□□□ -2.07
tW(CCA)KtW(CCA)K NOC4Q06512 552 aaPredicted RBP2.09□□□□□ -2.07
tW(CCA)KtW(CCA)K SOG2Q08817 791 aa2.09□□□□□ -2.07
tW(CCA)KtW(CCA)K INP53Q12271 1107 aa2.09□□□□□ -2.07
tW(CCA)KtW(CCA)K LAS17Q12446 633 aa2.09□□□□□ -2.07
tW(CCA)KtW(CCA)K NKP1Q12493 238 aa2.09□□□□□ -2.07
tW(CCA)KtW(CCA)K YJR112W-AQ3E743 109 aa2.09□□□□□ -2.07
tW(CCA)KtW(CCA)K HEM13P11353 328 aaKnown RBP2.08□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K CKA1P15790 372 aa2.08□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K PUP1P25043 261 aa2.08□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K LSB5P25369 354 aa2.08□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K ZUO1P32527 433 aaKnown RBP2.08□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K YRA2P36036 203 aaKnown RBP RIP-Chip data2.08□□□□□ -2.08not detected
tW(CCA)KtW(CCA)K YKR045CP36138 183 aa2.08□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K PRS4P38063 326 aaPredicted RBP2.08□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K ECM31P38122 312 aa2.08□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K PCL6P40038 420 aa2.08□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K SYG1P40528 902 aa2.08□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K MRPL49P40858 161 aaPredicted RBP2.08□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K YJL213WP40896 331 aa2.08□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K CAT5P41735 233 aa2.08□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K OTU1P43558 301 aa2.08□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 68.3 ms