RNA–Protein interactions for RNA: tW(CCA)J

tW(CCA)J, Transcript of Tryptophan tRNA (tRNA-Trp), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tW(CCA)J, Length 72 nt, Biotype tRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tW(CCA)JtW(CCA)J DIT1P21623 536 aa2.11□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J TOM40P23644 387 aaKnown RBP2.11□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J PRE7P23724 241 aaKnown RBP2.11□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J YCR101CP25607 182 aa2.11□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J YCR061WP25639 631 aa2.11□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J SUA7P29055 345 aaPredicted RBP2.11□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J VMA5P31412 392 aaKnown RBP2.11□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J VMA6P32366 345 aaKnown RBP2.11□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J RNP1P32385 249 aa2.11□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J REC104P33323 182 aa2.11□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J CBT1P36038 271 aaPredicted RBP2.11□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J SHE2P36068 246 aaKnown RBP RIP-Chip data2.11□□□□□ -2.07not detected
tW(CCA)JtW(CCA)J PMU1P36069 295 aa2.11□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J NTC20P38302 140 aaPredicted RBP2.11□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J SOL3P38858 249 aa2.11□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J NOP16P40007 231 aaKnown RBP2.11□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J YIL060WP40519 144 aa2.11□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J RPA43P46669 326 aa2.11□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J HNT2P49775 206 aa2.11□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J RPL9BP51401 191 aaKnown RBP2.11□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J SKP1P52286 194 aa2.11□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J YIP1P53039 248 aa2.11□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J NGL2Q03264 515 aaKnown RBP2.11□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J MIX17Q03667 156 aa2.11□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J TSA2Q04120 196 aa2.11□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J SPG4Q04438 115 aa2.11□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J ECM18Q04623 453 aa2.11□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J GPN3Q06543 272 aa2.11□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J YFH1Q07540 174 aa2.11□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J ALG6Q12001 544 aaKnown RBP2.11□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J TGS1Q12052 315 aa2.11□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J BBP1Q12365 385 aa2.11□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J ILV5P06168 395 aaKnown RBP2.1□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J YHR212W-AP0CX91 67 aa2.1□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J CDC34P14682 295 aa2.1□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J BGL2P15703 313 aaKnown RBP2.1□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J RFA1P22336 621 aaKnown RBP2.1□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J RPL24BP24000 155 aaKnown RBP2.1□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J DPB2P24482 689 aaPredicted RBP2.1□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J RNA14P25298 677 aaKnown RBP2.1□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J ELO2P25358 347 aa2.1□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J COQ2P32378 372 aa2.1□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J RAD23P32628 398 aaKnown RBP2.1□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J AGA2P32781 87 aa2.1□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J CPR5P35176 225 aa2.1□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J SWD2P36104 329 aaPredicted RBP2.1□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J MRPL36P36531 177 aa2.1□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J YBR137WP38276 179 aa2.1□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J PAC2P39937 518 aa2.1□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J CCS1P40202 249 aaKnown RBP2.1□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J YFL054CP43549 646 aa2.1□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J YJR011CP47086 261 aaPredicted RBP2.1□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J YAE1P47118 141 aaPredicted RBP2.1□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J IMD3P50095 523 aaKnown RBP2.1□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J VHT1P53241 593 aa2.1□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J YMR181CQ03231 154 aa2.1□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J NEJ1Q06148 342 aa2.1□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J MCH1Q07376 486 aa2.1□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J DGK1Q12382 290 aa2.1□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J TFC7Q12415 435 aa2.1□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J YLR358CO13565 187 aa2.09□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J URA6P15700 204 aa2.09□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J RFA3P26755 122 aaKnown RBP2.09□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J INO2P26798 304 aa2.09□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J PEX4P29340 183 aa2.09□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J OCH1P31755 480 aa2.09□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J ERG2P32352 222 aa2.09□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J RPB7P34087 171 aa2.09□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J FLO10P36170 1169 aa2.09□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J YHK8P38776 514 aa2.09□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J RTT105P40063 208 aa2.09□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J PCL7P40186 285 aa2.09□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J SYS1P41544 203 aa2.09□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J GWT1P47026 490 aa2.09□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J VPS55P47111 140 aa2.09□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J ALG9P53868 555 aaKnown RBP2.09□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J HNT1Q04344 158 aaKnown RBP2.09□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J DAL4Q04895 635 aa2.09□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J MSC3Q05812 728 aa2.09□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J NOC4Q06512 552 aaPredicted RBP2.09□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J SOG2Q08817 791 aa2.09□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J INP53Q12271 1107 aa2.09□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J LAS17Q12446 633 aa2.09□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J NKP1Q12493 238 aa2.09□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J YJR112W-AQ3E743 109 aa2.09□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J HEM13P11353 328 aaKnown RBP2.08□□□□□ -2.08
tW(CCA)JtW(CCA)J CKA1P15790 372 aa2.08□□□□□ -2.08
tW(CCA)JtW(CCA)J PUP1P25043 261 aa2.08□□□□□ -2.08
tW(CCA)JtW(CCA)J LSB5P25369 354 aa2.08□□□□□ -2.08
tW(CCA)JtW(CCA)J ZUO1P32527 433 aaKnown RBP2.08□□□□□ -2.08
tW(CCA)JtW(CCA)J YRA2P36036 203 aaKnown RBP RIP-Chip data2.08□□□□□ -2.08not detected
tW(CCA)JtW(CCA)J YKR045CP36138 183 aa2.08□□□□□ -2.08
tW(CCA)JtW(CCA)J PRS4P38063 326 aaPredicted RBP2.08□□□□□ -2.08
tW(CCA)JtW(CCA)J ECM31P38122 312 aa2.08□□□□□ -2.08
tW(CCA)JtW(CCA)J PCL6P40038 420 aa2.08□□□□□ -2.08
tW(CCA)JtW(CCA)J SYG1P40528 902 aa2.08□□□□□ -2.08
tW(CCA)JtW(CCA)J MRPL49P40858 161 aaPredicted RBP2.08□□□□□ -2.08
tW(CCA)JtW(CCA)J YJL213WP40896 331 aa2.08□□□□□ -2.08
tW(CCA)JtW(CCA)J CAT5P41735 233 aa2.08□□□□□ -2.08
tW(CCA)JtW(CCA)J OTU1P43558 301 aa2.08□□□□□ -2.08
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