RNA–Protein interactions for RNA: YOL054W

PSH1, Transcript of E3 ubiquitin ligase targeting centromere-binding protein Cse4p, yeast

Gene PSH1, Length 1,221 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PSH1	YOL054W	LSM8	P47093	109 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PSH1	YOL054W	OKP1	P53298	406 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PSH1	YOL054W	NCE101	Q02820	53 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PSH1	YOL054W	EST3	Q03096	181 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PSH1	YOL054W	HNT1	Q04344	158 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PSH1	YOL054W	MRX8	Q05473	314 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PSH1	YOL054W	SYM1	Q06563	197 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PSH1	YOL054W	BER1	Q06688	274 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PSH1	YOL054W	CMC2	Q3E7A4	109 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PSH1	YOL054W	PET20	Q99373	253 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PSH1	YOL054W	IRA2	P19158	3079 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSH1	YOL054W	NAM2	P11325	894 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSH1	YOL054W	TIP1	P27654	210 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PSH1	YOL054W	COS9	P36034	407 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSH1	YOL054W	SRP102	P36057	244 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PSH1	YOL054W	SHG1	P38337	142 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSH1	YOL054W	BXI1	P48558	297 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSH1	YOL054W	COQ5	P49017	307 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSH1	YOL054W	UBP8	P50102	471 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSH1	YOL054W	ATP23	P53722	227 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSH1	YOL054W	APJ1	P53940	528 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSH1	YOL054W	YCL001W-A	P87012	153 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSH1	YOL054W	YMR279C	Q03263	540 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSH1	YOL054W	HRT1	Q08273	121 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSH1	YOL054W	RDR1	Q08904	546 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSH1	YOL054W	TPI1	P00942	248 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PSH1	YOL054W	OPI3	P05375	206 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PSH1	YOL054W	RPS14A	P06367	137 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PSH1	YOL054W	PET494	P07390	489 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PSH1	YOL054W	RPL20A	P0CX23	172 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PSH1	YOL054W	RPL20B	P0CX24	172 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PSH1	YOL054W	ERV15	P38312	142 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PSH1	YOL054W	GPI16	P38875	610 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PSH1	YOL054W	RPS14B	P39516	138 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PSH1	YOL054W	RPL13B	P40212	199 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PSH1	YOL054W	YIR035C	P40579	254 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PSH1	YOL054W	AGX1	P43567	385 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PSH1	YOL054W	PEX25	Q02969	394 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PSH1	YOL054W	SNO1	Q03144	224 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PSH1	YOL054W	BNA7	Q04066	261 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PSH1	YOL054W	MDM30	Q05930	598 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PSH1	YOL054W	HEM25	Q07534	307 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PSH1	YOL054W	BSC6	Q08280	497 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PSH1	YOL054W	MCP1	Q12106	302 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PSH1	YOL054W	YPR063C	Q12160	140 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PSH1	YOL054W	RPL13A	Q12690	199 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PSH1	YOL054W	YER145C-A	A0A023PYF4	145 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PSH1	YOL054W	CTA1	P15202	515 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PSH1	YOL054W	RPL32	P38061	130 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PSH1	YOL054W	ATG8	P38182	117 aa	RIP-Chip data	4.93	□□□□□ -1.62	not detected
PSH1	YOL054W	POP8	P38208	133 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PSH1	YOL054W	SSH1	P38353	490 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PSH1	YOL054W	RMD6	P39975	231 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PSH1	YOL054W	SPC25	P40014	221 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PSH1	YOL054W	DLS1	P40366	167 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PSH1	YOL054W	YIL067C	P40514	678 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PSH1	YOL054W	ADO1	P47143	340 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PSH1	YOL054W	SOL1	P50278	321 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PSH1	YOL054W	AAH1	P53909	347 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PSH1	YOL054W	ERG13	P54839	491 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PSH1	YOL054W	RSM23	Q01163	450 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PSH1	YOL054W	EGD1	Q02642	157 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PSH1	YOL054W	SCP1	Q08873	200 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PSH1	YOL054W	FCF2	Q12035	217 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PSH1	YOL054W	MCT1	Q12283	360 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PSH1	YOL054W	DGK1	Q12382	290 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PSH1	YOL054W	RPB8	P20436	146 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSH1	YOL054W	MIA40	P36046	403 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSH1	YOL054W	UMP1	P38293	148 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSH1	YOL054W	NAS2	P40555	220 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSH1	YOL054W	NSE4	P43124	402 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSH1	YOL054W	ERJ5	P43613	295 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PSH1	YOL054W	RMD9	P53140	646 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PSH1	YOL054W	TIM21	P53220	239 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSH1	YOL054W	YML018C	Q03730	393 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSH1	YOL054W	RVB1	Q03940	463 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PSH1	YOL054W	FIT1	Q04433	528 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSH1	YOL054W	YPR174C	Q06616	221 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PSH1	YOL054W	RRT7	Q07829	113 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSH1	YOL054W	SRL2	Q12020	392 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSH1	YOL054W	VAM3	Q12241	283 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSH1	YOL054W	YDR262W	Q12331	272 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSH1	YOL054W	YPR145C-A	Q2V2P0	78 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSH1	YOL054W	YLR146W-A	Q2V2P1	62 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSH1	YOL054W	MEX67	Q99257	599 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PSH1	YOL054W	CDC7	P06243	507 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PSH1	YOL054W	QCR2	P07257	368 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PSH1	YOL054W	CPR2	P23285	205 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PSH1	YOL054W	MEK1	P24719	497 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PSH1	YOL054W	RFA3	P26755	122 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PSH1	YOL054W	VMA5	P31412	392 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PSH1	YOL054W	ARO4	P32449	370 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PSH1	YOL054W	RML2	P32611	393 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PSH1	YOL054W	NRP1	P32770	719 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.91	□□□□□ -1.62	not detected
PSH1	YOL054W	CLB6	P32943	380 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PSH1	YOL054W	SEN34	P39707	275 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PSH1	YOL054W	LTP1	P40347	161 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PSH1	YOL054W	SSN8	P47821	323 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PSH1	YOL054W	UFD1	P53044	361 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PSH1	YOL054W	RHO5	P53879	331 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 22 ms