RNA–Protein interactions for RNA: YLR165C

PUS5, Transcript of Pseudouridine synthase, yeast

Gene PUS5, Length 765 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PUS5	YLR165C	PRE6	P40303	254 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PUS5	YLR165C	COS4	P43542	379 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PUS5	YLR165C	RAD17	P48581	401 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PUS5	YLR165C	RSM27	P53305	110 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PUS5	YLR165C	YPL039W	Q03080	316 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PUS5	YLR165C	RRP40	Q08285	240 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PUS5	YLR165C	YPL264C	Q08980	353 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PUS5	YLR165C	YPS3	Q12303	508 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PUS5	YLR165C	IES3	Q12345	250 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PUS5	YLR165C	YLR462W	O13556	202 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PUS5	YLR165C	YAK1	P14680	807 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PUS5	YLR165C	SSO1	P32867	290 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PUS5	YLR165C	UBC6	P33296	250 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PUS5	YLR165C	DRE2	P36152	348 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PUS5	YLR165C	URA8	P38627	578 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PUS5	YLR165C	YEL075C	P39972	122 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PUS5	YLR165C	ERG28	P40030	148 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PUS5	YLR165C	YER189W	P40104	122 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PUS5	YLR165C	RIO1	Q12196	484 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PUS5	YLR165C	YBL008W-A	Q3E821	79 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PUS5	YLR165C	YHB1	P39676	399 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PUS5	YLR165C	CPR7	P47103	393 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PUS5	YLR165C	NIF3	P53081	288 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PUS5	YLR165C	HST4	P53688	370 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PUS5	YLR165C	SSQ1	Q05931	657 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PUS5	YLR165C	YKL183C-A	Q3E765	70 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PUS5	YLR165C	YEL009C-A	A0A023PZF2	135 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PUS5	YLR165C	GDH2	P33327	1092 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PUS5	YLR165C	TVP38	P36164	337 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PUS5	YLR165C	TRM7	P38238	310 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PUS5	YLR165C	HMF1	P40037	129 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PUS5	YLR165C	MRH4	P53166	561 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PUS5	YLR165C	MRPS17	Q03246	237 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PUS5	YLR165C	GOT1	Q03554	138 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PUS5	YLR165C	YDR124W	Q04608	324 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PUS5	YLR165C	YDR278C	Q05612	105 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PUS5	YLR165C	CDC123	Q05791	360 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PUS5	YLR165C	DPB2	P24482	689 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PUS5	YLR165C	SUR2	P38992	349 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PUS5	YLR165C	YNL194C	P40169	301 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PUS5	YLR165C	YDR222W	Q04925	415 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PUS5	YLR165C	SEI1	Q06058	285 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PUS5	YLR165C	IES4	Q08561	116 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PUS5	YLR165C	NTF2	P33331	125 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PUS5	YLR165C	SSH1	P38353	490 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PUS5	YLR165C	YMR144W	P40214	342 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PUS5	YLR165C	TRM9	P49957	279 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUS5	YLR165C	MIC26	P50087	233 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUS5	YLR165C	GIM3	P53900	129 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUS5	YLR165C	YMR226C	Q05016	267 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PUS5	YLR165C	SYC1	Q08553	188 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PUS5	YLR165C	YBL112C	Q3E7Y4	105 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUS5	YLR165C	ISD11	Q6Q560	94 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUS5	YLR165C	JIP3	O13555	125 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PUS5	YLR165C	CBF1	P17106	351 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PUS5	YLR165C	SMX2	P40204	77 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PUS5	YLR165C	YJL028W	P47062	111 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PUS5	YLR165C	TLG1	Q03322	224 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PUS5	YLR165C	YOL019W	Q08157	551 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PUS5	YLR165C	YOR186W	Q08560	144 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PUS5	YLR165C	YPL225W	Q08971	146 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PUS5	YLR165C	PRR2	Q12310	699 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PUS5	YLR165C	BCY1	P07278	416 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PUS5	YLR165C	YOL163W	P0CF20	169 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PUS5	YLR165C	YFR045W	P43617	309 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PUS5	YLR165C	HEM25	Q07534	307 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PUS5	YLR165C	SLD7	Q08457	257 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PUS5	YLR165C	GET4	Q12125	312 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PUS5	YLR165C	YRA1	Q12159	226 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PUS5	YLR165C	YPR011C	Q12251	326 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PUS5	YLR165C	RPL28	P02406	149 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PUS5	YLR165C	TEM1	P38987	245 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUS5	YLR165C	RFC4	P40339	323 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PUS5	YLR165C	YIR035C	P40579	254 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUS5	YLR165C	NSA1	P53136	463 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PUS5	YLR165C	YGL034C	P53186	121 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUS5	YLR165C	RPL22B	P56628	122 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PUS5	YLR165C	YMR321C	Q04898	105 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUS5	YLR165C	ATG38	Q05789	226 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PUS5	YLR165C	ABP140	Q08641	628 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PUS5	YLR165C	FKS1	P38631	1876 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PUS5	YLR165C	SNA3	P14359	133 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PUS5	YLR165C	RME1	P32338	300 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PUS5	YLR165C	ECO1	P43605	281 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PUS5	YLR165C	MCM22	P47167	239 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PUS5	YLR165C	CWC23	P52868	283 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PUS5	YLR165C	CUS2	P53830	285 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PUS5	YLR165C	ALG9	P53868	555 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PUS5	YLR165C	EMI1	Q04406	187 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PUS5	YLR165C	SMT3	Q12306	101 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PUS5	YLR165C	PST1	Q12355	444 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PUS5	YLR165C	DCN1	Q12395	269 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PUS5	YLR165C	CMD1	P06787	147 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PUS5	YLR165C	AST1	P35183	429 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PUS5	YLR165C	POP4	P38336	279 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PUS5	YLR165C	OST3	P48439	350 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PUS5	YLR165C	ALG13	P53178	202 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PUS5	YLR165C	FYV6	P53913	173 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PUS5	YLR165C	YNL046W	P53956	172 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PUS5	YLR165C	FAR8	Q05040	523 aa		4.86	□□□□□ -1.63

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