RNA–Protein interactions for RNA: YDR457W

TOM1, Transcript of E3 ubiquitin ligase of the hect-domain class, yeast

Gene TOM1, Length 9,807 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TOM1	YDR457W	AIM45	Q12480	344 aa	Known RBP	2.53	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	PAR32	Q12515	295 aa	Known RBP	2.53	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	PAU9	Q3E770	120 aa		2.53	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	RPS22A	P0C0W1	130 aa	Known RBP	2.52	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	GAL3	P13045	520 aa		2.52	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	GOS1	P38736	223 aa		2.52	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	YER010C	P40011	234 aa		2.52	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	IRC7	P43623	340 aa		2.52	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	YDR387C	Q04162	555 aa		2.52	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	YPR084W	Q06821	456 aa		2.52	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	POL1	P13382	1468 aa		2.52	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	CDC36	P06100	191 aa	Predicted RBP	2.52	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	GDA1	P32621	518 aa		2.52	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	POP8	P38208	133 aa		2.52	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	EMC6	Q12431	108 aa		2.52	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	YEL076C-A	P0CX16	216 aa		2.52	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	YLR464W	P0CX17	216 aa		2.52	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	YCK1	P23291	538 aa		2.52	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	CTS1	P29029	562 aa		2.52	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	ASH1	P34233	588 aa		2.52	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	YEL076C	P39971	216 aa		2.52	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	SYS1	P41544	203 aa		2.52	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	ISR1	Q06098	443 aa	Known RBP	2.52	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	RKI1	Q12189	258 aa		2.52	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	CSR2	Q12734	1121 aa		2.52	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	ILV5	P06168	395 aa	Known RBP	2.52	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	SOP4	P39543	234 aa	Predicted RBP	2.52	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	OSW5	P40219	148 aa		2.52	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	FLX1	P40464	311 aa		2.52	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	MTQ1	P53944	314 aa		2.52	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	SEC13	Q04491	297 aa	Known RBP	2.52	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	PPT2	Q12036	173 aa		2.52	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	ADH1	P00330	348 aa	Known RBP	2.52	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	RPS13	P05756	151 aa	Known RBP	2.52	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	CPT1	P17898	393 aa		2.52	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	TAH1	P25638	111 aa	Predicted RBP	2.52	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	DMA1	P38823	416 aa		2.52	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	SPC25	P40014	221 aa		2.52	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	PTR3	P43606	678 aa		2.52	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	RPL30	P14120	105 aa	Known RBP	2.52	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	YCL002C	P25565	263 aa		2.52	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	YKL069W	P36088	180 aa		2.52	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	YEA4	P40004	342 aa		2.52	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	GPI2	P46961	280 aa		2.52	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	DIA3	P52290	468 aa		2.52	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	ANT1	Q06497	328 aa		2.52	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	TY3B-I	Q7LHG5	1498 aa	Known RBP	2.52	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	YBR220C	P38318	560 aa		2.52	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	VHS2	P40463	436 aa		2.52	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	NCS6	P53088	359 aa		2.52	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	YNR071C	P53757	342 aa		2.52	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	CUE4	Q04201	117 aa	Predicted RBP	2.52	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	YNR034W-A	Q3E841	98 aa		2.52	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	YBR209W	P38311	105 aa		2.51	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	SMD3	P43321	101 aa	Known RBP	2.51	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	SKI6	P46948	246 aa	Predicted RBP	2.51	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	DIC1	Q06143	298 aa		2.51	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	YPK9	Q12697	1472 aa		2.51	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	RPL26A	P05743	127 aa	Known RBP	2.51	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	CYT1	P07143	309 aa		2.51	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	CHS7	P38843	316 aa		2.51	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	RPL26B	P53221	127 aa	Known RBP	2.51	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	YFT2	Q06676	274 aa		2.51	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	YLR302C	O13544	120 aa		2.51	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	MDM10	P18409	493 aa		2.51	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	PRE5	P40302	234 aa	Known RBP	2.51	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	CUP9	P41817	306 aa		2.51	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	SGF73	P53165	657 aa		2.51	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	MRPL51	Q06090	140 aa	Predicted RBP	2.51	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	YDL177C	Q12257	170 aa		2.51	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	SAT4	P25333	603 aa	Known RBP	2.51	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	YMC1	P32331	307 aa		2.51	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	MTO1	P53070	669 aa		2.51	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	YGR079W	P53249	370 aa		2.51	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	STP4	Q07351	490 aa		2.51	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	YDL009C	Q12210	107 aa		2.51	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	GAS1	P22146	559 aa	Known RBP	2.51	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	BAP2	P38084	609 aa		2.51	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	GEP4	P38812	185 aa		2.51	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	MTC6	P38849	526 aa		2.51	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	TES1	P41903	349 aa	Known RBP	2.51	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	SMA2	Q04658	369 aa		2.51	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	YPR098C	Q06089	161 aa		2.51	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	PRM3	Q08931	133 aa		2.51	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	YMR030W-A	Q3E760	96 aa		2.51	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	COX5A	P00424	153 aa		2.51	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	CWP1	P28319	239 aa		2.51	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	VPS55	P47111	140 aa		2.51	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	INN1	P53901	409 aa		2.51	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	RSM28	Q03430	361 aa		2.51	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	SDS24	P38314	527 aa		2.51	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	YND1	P40009	630 aa		2.51	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	ATF1	P40353	525 aa		2.51	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	MPC1	P53157	130 aa	Known RBP	2.51	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	ATG5	Q12380	294 aa		2.51	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	RPL11A	P0C0W9	174 aa	Known RBP	2.51	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	HTD2	P38790	280 aa	Known RBP	2.51	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	GDS1	P41913	522 aa		2.51	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	MSY1	P48527	492 aa		2.51	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	NRG1	Q03125	231 aa		2.51	□□□□□ -2.01

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