RNA–Protein interactions for RNA: Q0144

Q0144, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene Q0144, Length 330 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
Q0144Q0144 RCE1Q03530 315 aa-0.26□□□□□ -2.45
Q0144Q0144 SIP3P38717 1229 aa-0.27□□□□□ -2.45
Q0144Q0144 ARO8P53090 500 aaKnown RBP-0.27□□□□□ -2.45
Q0144Q0144 ALG11P53954 548 aaKnown RBP-0.27□□□□□ -2.45
Q0144Q0144 YET1P35723 206 aa-0.28□□□□□ -2.45
Q0144Q0144 YNR077CP53758 84 aa-0.28□□□□□ -2.45
Q0144Q0144 SNZ2P53824 298 aa-0.28□□□□□ -2.45
Q0144Q0144 OST6Q03723 332 aa-0.28□□□□□ -2.45
Q0144Q0144 FMP16Q12497 93 aa-0.28□□□□□ -2.45
Q0144Q0144 SGE1P33335 543 aa-0.29□□□□□ -2.46
Q0144Q0144 YBR063CP38083 404 aa-0.29□□□□□ -2.46
Q0144Q0144 FLX1P40464 311 aa-0.29□□□□□ -2.46
Q0144Q0144 YNL046WP53956 172 aa-0.29□□□□□ -2.46
Q0144Q0144 GOS1P38736 223 aa-0.3□□□□□ -2.46
Q0144Q0144 YPR098CQ06089 161 aa-0.3□□□□□ -2.46
Q0144Q0144 TRM12Q04235 462 aa-0.31□□□□□ -2.46
Q0144Q0144 YHL042WP38729 150 aa-0.32□□□□□ -2.46
Q0144Q0144 KNH1P50112 268 aa-0.32□□□□□ -2.46
Q0144Q0144 GAS3Q03655 524 aa-0.32□□□□□ -2.46
Q0144Q0144 PSF1Q12488 208 aa-0.32□□□□□ -2.46
Q0144Q0144 MRPS28P21771 286 aa-0.33□□□□□ -2.46
Q0144Q0144 MRPL40P36534 297 aa-0.33□□□□□ -2.46
Q0144Q0144 SSQ1Q05931 657 aaPredicted RBP-0.33□□□□□ -2.46
Q0144Q0144 STP22P25604 385 aa-0.34□□□□□ -2.46
Q0144Q0144 BLI1P35727 113 aa-0.34□□□□□ -2.46
Q0144Q0144 SMB1P40018 196 aaKnown RBP-0.34□□□□□ -2.46
Q0144Q0144 CWC27Q02770 301 aa-0.34□□□□□ -2.46
Q0144Q0144 SSK22P25390 1331 aaPredicted RBP-0.35□□□□□ -2.46
Q0144Q0144 YBR209WP38311 105 aa-0.35□□□□□ -2.47
Q0144Q0144 PRS2P38620 318 aaKnown RBP-0.35□□□□□ -2.47
Q0144Q0144 MDY2Q12285 212 aa-0.35□□□□□ -2.47
Q0144Q0144 PEX17P40155 199 aa-0.36□□□□□ -2.47
Q0144Q0144 CAT5P41735 233 aa-0.36□□□□□ -2.47
Q0144Q0144 YBR096WP38256 230 aa-0.37□□□□□ -2.47
Q0144Q0144 ILM1P47155 203 aa-0.37□□□□□ -2.47
Q0144Q0144 KAP114P53067 1004 aa-0.37□□□□□ -2.47
Q0144Q0144 YOR029WQ12243 111 aa-0.37□□□□□ -2.47
Q0144Q0144 HOM6P31116 359 aaKnown RBP-0.38□□□□□ -2.47
Q0144Q0144 UGX2P32772 223 aa-0.38□□□□□ -2.47
Q0144Q0144 OPY1P38271 328 aa-0.39□□□□□ -2.47
Q0144Q0144 REX3Q12090 404 aa-0.39□□□□□ -2.47
Q0144Q0144 TPM1P17536 199 aaKnown RBP-0.4□□□□□ -2.47
Q0144Q0144 ERD2P18414 219 aa-0.4□□□□□ -2.47
Q0144Q0144 UMP1P38293 148 aa-0.4□□□□□ -2.47
Q0144Q0144 ABF2Q02486 183 aa-0.4□□□□□ -2.47
Q0144Q0144 YEA4P40004 342 aa-0.41□□□□□ -2.48
Q0144Q0144 YML096WQ04489 525 aa-0.41□□□□□ -2.48
Q0144Q0144 RPS5P26783 225 aaKnown RBP-0.42□□□□□ -2.48
Q0144Q0144 YNL247WP53852 767 aaKnown RBP-0.42□□□□□ -2.48
Q0144Q0144 TUS1Q06412 1307 aa-0.43□□□□□ -2.48
Q0144Q0144 REP2P03872 296 aa-0.44□□□□□ -2.48
Q0144Q0144 RHO3Q00245 231 aaKnown RBP-0.44□□□□□ -2.48
Q0144Q0144 YHR007C-AQ07074 71 aa-0.44□□□□□ -2.48
Q0144Q0144 MRP1P10662 321 aaKnown RBP-0.45□□□□□ -2.48
Q0144Q0144 YNL010WP53981 241 aaKnown RBP-0.45□□□□□ -2.48
Q0144Q0144 DIG2Q03373 323 aaKnown RBP-0.45□□□□□ -2.48
Q0144Q0144 YDR209CQ03480 137 aa-0.45□□□□□ -2.48
Q0144Q0144 YPR170W-BP0C5R9 85 aa-0.46□□□□□ -2.48
Q0144Q0144 SNC2P33328 115 aa-0.46□□□□□ -2.48
Q0144Q0144 USE1P53146 245 aa-0.46□□□□□ -2.48
Q0144Q0144 YHR127WP38833 243 aaKnown RBP-0.47□□□□□ -2.48
Q0144Q0144 SEI1Q06058 285 aa-0.47□□□□□ -2.48
Q0144Q0144 FSF1Q12029 327 aaKnown RBP-0.47□□□□□ -2.48
Q0144Q0144 YLR413WQ06689 675 aa-0.48□□□□□ -2.49
Q0144Q0144 ATG40Q99325 256 aa-0.48□□□□□ -2.49
Q0144Q0144 YPL229WQ99395 206 aa-0.48□□□□□ -2.49
Q0144Q0144 FMP49A0A023PZB3 126 aa-0.49□□□□□ -2.49
Q0144Q0144 SED1Q01589 338 aa-0.49□□□□□ -2.49
Q0144Q0144 SIR2P06700 562 aa-0.5□□□□□ -2.49
Q0144Q0144 HYR1P40581 163 aaKnown RBP-0.5□□□□□ -2.49
Q0144Q0144 GLG2P47011 380 aa-0.5□□□□□ -2.49
Q0144Q0144 YIL002W-AQ3E7Z5 69 aa-0.5□□□□□ -2.49
Q0144Q0144 COX2P00410 251 aa-0.51□□□□□ -2.49
Q0144Q0144 STF1P01098 86 aa-0.51□□□□□ -2.49
Q0144Q0144 RIB1P38066 345 aa-0.51□□□□□ -2.49
Q0144Q0144 YDR248CQ03786 193 aa-0.51□□□□□ -2.49
Q0144Q0144 ADH6Q04894 360 aaKnown RBP-0.51□□□□□ -2.49
Q0144Q0144 SNU23Q12368 194 aaPredicted RBP-0.51□□□□□ -2.49
Q0144Q0144 BFR1P38934 470 aaKnown RBP RIP-Chip data-0.52□□□□□ -2.49not detected
Q0144Q0144 YMD8Q03697 442 aa-0.52□□□□□ -2.49
Q0144Q0144 YLR236CA0A023PZG4 107 aa-0.53□□□□□ -2.49
Q0144Q0144 YMR144WP40214 342 aaKnown RBP-0.53□□□□□ -2.49
Q0144Q0144 SNZ1Q03148 297 aa-0.53□□□□□ -2.49
Q0144Q0144 SEC11P15367 167 aa-0.54□□□□□ -2.5
Q0144Q0144 EAF6P47128 113 aa-0.54□□□□□ -2.5
Q0144Q0144 CDC36P06100 191 aaPredicted RBP-0.55□□□□□ -2.5
Q0144Q0144 SHE2P36068 246 aaKnown RBP RIP-Chip data-0.55□□□□□ -2.5not detected
Q0144Q0144 MRPL17P36528 281 aa-0.55□□□□□ -2.5
Q0144Q0144 IRC22P40006 225 aa-0.55□□□□□ -2.5
Q0144Q0144 CUE4Q04201 117 aaPredicted RBP-0.55□□□□□ -2.5
Q0144Q0144 YMR252CQ04814 134 aa-0.55□□□□□ -2.5
Q0144Q0144 DAL82P21705 255 aa-0.56□□□□□ -2.5
Q0144Q0144 YCL042WP25572 119 aa-0.56□□□□□ -2.5
Q0144Q0144 URA8P38627 578 aaPredicted RBP-0.56□□□□□ -2.5
Q0144Q0144 YFH7P43591 353 aa-0.56□□□□□ -2.5
Q0144Q0144 SWP1Q02795 286 aa-0.56□□□□□ -2.5
Q0144Q0144 GPM2Q12008 311 aa-0.56□□□□□ -2.5
Q0144Q0144 TSC3Q3E790 80 aa-0.56□□□□□ -2.5
Q0144Q0144 DID2P69771 204 aa-0.57□□□□□ -2.5
Q0144Q0144 ATG22P25568 528 aa-0.58□□□□□ -2.5
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 49.1 ms