RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635899.1

CREBBP-215, Transcript of CREB binding protein, human

TSL 5

Gene CREBBP, Length 100 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CREBBP-215	ENST00000635899	CSTF1	Q05048	431 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CREBBP-215	ENST00000635899	DMP1	Q13316	513 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CREBBP-215	ENST00000635899	ORC2	Q13416	577 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CREBBP-215	ENST00000635899	RAB33A	Q14088	237 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CREBBP-215	ENST00000635899	NOLC1	Q14978	699 aa	Known RBP eCLIP	4.92	□□□□□ -1.62
CREBBP-215	ENST00000635899	ZNF174	Q15697	407 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CREBBP-215	ENST00000635899	ECM1	Q16610	540 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CREBBP-215	ENST00000635899	UPP1	Q16831	310 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CREBBP-215	ENST00000635899	VARS2	Q5ST30	1063 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CREBBP-215	ENST00000635899	ZNF280D	Q6N043	979 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CREBBP-215	ENST00000635899	TSSK4	Q6SA08	328 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CREBBP-215	ENST00000635899	RSPO2	Q6UXX9	243 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CREBBP-215	ENST00000635899	PDZD4	Q76G19	769 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CREBBP-215	ENST00000635899	MAML2	Q8IZL2	1156 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CREBBP-215	ENST00000635899	ABCA7	Q8IZY2	2146 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CREBBP-215	ENST00000635899	ELMOD1	Q8N336	334 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CREBBP-215	ENST00000635899	DCLK2	Q8N568	766 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CREBBP-215	ENST00000635899	RUBCN	Q92622	972 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CREBBP-215	ENST00000635899	KIFAP3	Q92845	792 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CREBBP-215	ENST00000635899	MCRS1	Q96EZ8	462 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CREBBP-215	ENST00000635899	NACC1	Q96RE7	527 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CREBBP-215	ENST00000635899	CORO1B	Q9BR76	489 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CREBBP-215	ENST00000635899	CYP4F11	Q9HBI6	524 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CREBBP-215	ENST00000635899	POLD4	Q9HCU8	107 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CREBBP-215	ENST00000635899	TOPORS	Q9NS56	1045 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CREBBP-215	ENST00000635899	TUBGCP4	Q9UGJ1	667 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CREBBP-215	ENST00000635899	NOL7	Q9UMY1	257 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CREBBP-215	ENST00000635899	TNFSF13B	Q9Y275	285 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CREBBP-215	ENST00000635899	MTF2	Q9Y483	593 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CREBBP-215	ENST00000635899	NUB1	Q9Y5A7	615 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CREBBP-215	ENST00000635899	INSL5	Q9Y5Q6	135 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CREBBP-215	ENST00000635899	MAP1B	P46821	2468 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CREBBP-215	ENST00000635899	CACNA1B	Q00975	2339 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CREBBP-215	ENST00000635899	NCAN	O14594	1321 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CREBBP-215	ENST00000635899	FAM170B	A6NMN3	283 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CREBBP-215	ENST00000635899	PP2D1	A8MPX8	630 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CREBBP-215	ENST00000635899		E9PMD0	336 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CREBBP-215	ENST00000635899		K7ERI5	159 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CREBBP-215	ENST00000635899	SYN3	O14994	580 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CREBBP-215	ENST00000635899	SLC16A4	O15374	487 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CREBBP-215	ENST00000635899	ECI2	O75521	394 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CREBBP-215	ENST00000635899	MYL4	P12829	197 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CREBBP-215	ENST00000635899	XRCC6	P12956	609 aa	Known RBP eCLIP	4.91	□□□□□ -1.62
CREBBP-215	ENST00000635899	MUT	P22033	750 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CREBBP-215	ENST00000635899	FCAR	P24071	287 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CREBBP-215	ENST00000635899	CCR2	P41597	374 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CREBBP-215	ENST00000635899	MATR3	P43243	847 aa	Known RBP eCLIP	4.91	□□□□□ -1.62
CREBBP-215	ENST00000635899	NPTX2	P47972	431 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CREBBP-215	ENST00000635899	FXR2	P51116	673 aa	Known RBP eCLIP	4.91	□□□□□ -1.62
CREBBP-215	ENST00000635899	RAD51AP2	Q09MP3	1159 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CREBBP-215	ENST00000635899	TWF1	Q12792	350 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CREBBP-215	ENST00000635899	PUM1	Q14671	1186 aa	Known RBP eCLIP	4.91	□□□□□ -1.62
CREBBP-215	ENST00000635899	ZRSR1	Q15695	479 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CREBBP-215	ENST00000635899	LPAL2	Q16609	132 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CREBBP-215	ENST00000635899	ZNF528	Q3MIS6	628 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CREBBP-215	ENST00000635899	CTXN3	Q4LDR2	81 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CREBBP-215	ENST00000635899	SEZ6	Q53EL9	994 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CREBBP-215	ENST00000635899	SLC44A4	Q53GD3	710 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CREBBP-215	ENST00000635899	ZBTB41	Q5SVQ8	909 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CREBBP-215	ENST00000635899	NT5DC1	Q5TFE4	455 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CREBBP-215	ENST00000635899	MPZL3	Q6UWV2	235 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CREBBP-215	ENST00000635899	ZNF852	Q6ZMS4	543 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CREBBP-215	ENST00000635899	TAS1R3	Q7RTX0	852 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CREBBP-215	ENST00000635899	TMEM130	Q8N3G9	435 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CREBBP-215	ENST00000635899	FAM184A	Q8NB25	1140 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CREBBP-215	ENST00000635899	SUMF1	Q8NBK3	374 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CREBBP-215	ENST00000635899	DNASE1L2	Q92874	299 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CREBBP-215	ENST00000635899	SECISBP2L	Q93073	1101 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CREBBP-215	ENST00000635899	C18orf25	Q96B23	403 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CREBBP-215	ENST00000635899	ELSPBP1	Q96BH3	223 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CREBBP-215	ENST00000635899	TCEAL4	Q96EI5	215 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CREBBP-215	ENST00000635899	DRC1	Q96MC2	740 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CREBBP-215	ENST00000635899	ZMAT2	Q96NC0	199 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CREBBP-215	ENST00000635899	DDX23	Q9BUQ8	820 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CREBBP-215	ENST00000635899	RUSC1	Q9BVN2	902 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CREBBP-215	ENST00000635899	TARS2	Q9BW92	718 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CREBBP-215	ENST00000635899	MRPL4	Q9BYD3	311 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CREBBP-215	ENST00000635899	RAB34	Q9BZG1	259 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CREBBP-215	ENST00000635899	PLA2G2F	Q9BZM2	168 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CREBBP-215	ENST00000635899	FOXP1	Q9H334	677 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CREBBP-215	ENST00000635899	SLITRK6	Q9H5Y7	841 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CREBBP-215	ENST00000635899	BRD9	Q9H8M2	597 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CREBBP-215	ENST00000635899	KMT5A	Q9NQR1	393 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CREBBP-215	ENST00000635899	PRMT8	Q9NR22	394 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CREBBP-215	ENST00000635899	ASAH2	Q9NR71	780 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CREBBP-215	ENST00000635899	SLC38A7	Q9NVC3	462 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CREBBP-215	ENST00000635899	CNTN3	Q9P232	1028 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CREBBP-215	ENST00000635899	LRWD1	Q9UFC0	647 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CREBBP-215	ENST00000635899	GMEB2	Q9UKD1	530 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CREBBP-215	ENST00000635899	FBXO4	Q9UKT5	387 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CREBBP-215	ENST00000635899	CDV3	Q9UKY7	258 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CREBBP-215	ENST00000635899	KCNH3	Q9ULD8	1083 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CREBBP-215	ENST00000635899	USP18	Q9UMW8	372 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CREBBP-215	ENST00000635899	KIAA1024	Q9UPX6	916 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CREBBP-215	ENST00000635899	MRPS17	Q9Y2R5	130 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CREBBP-215	ENST00000635899	YIPF1	Q9Y548	306 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CREBBP-215	ENST00000635899	PCDHGA2	Q9Y5H1	932 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CREBBP-215	ENST00000635899	BACE2	Q9Y5Z0	518 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CREBBP-215	ENST00000635899	CKAP5	Q14008	2032 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CREBBP-215	ENST00000635899	ZNF292	O60281	2723 aa		4.9	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.1 ms