RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628904.2

PKP4-217, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PKP4, Length 3,856 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-217ENST00000628904 NT5DC3Q86UY8 548 aa8□□□□□ -1.13
PKP4-217ENST00000628904 MBOAT7Q96N66 472 aa8□□□□□ -1.13
PKP4-217ENST00000628904 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
PKP4-217ENST00000628904 LPIN3Q9BQK8 851 aa8□□□□□ -1.13
PKP4-217ENST00000628904 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
PKP4-217ENST00000628904 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
PKP4-217ENST00000628904 ANKEF1Q9NU02 776 aa8□□□□□ -1.13
PKP4-217ENST00000628904 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa8□□□□□ -1.13
PKP4-217ENST00000628904 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
PKP4-217ENST00000628904 SEPT10Q9P0V9 454 aa8□□□□□ -1.13
PKP4-217ENST00000628904 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
PKP4-217ENST00000628904 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa8□□□□□ -1.13
PKP4-217ENST00000628904 FZD9O00144 591 aa8□□□□□ -1.13
PKP4-217ENST00000628904 EBAG9O00559 213 aa8□□□□□ -1.13
PKP4-217ENST00000628904 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
PKP4-217ENST00000628904 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
PKP4-217ENST00000628904 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
PKP4-217ENST00000628904 BASP1P80723 227 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
PKP4-217ENST00000628904 DUOXA2Q1HG44 320 aa8□□□□□ -1.13
PKP4-217ENST00000628904 ANKMY2Q8IV38 441 aa8□□□□□ -1.13
PKP4-217ENST00000628904 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa8□□□□□ -1.13
PKP4-217ENST00000628904 PAF1Q8N7H5 531 aa8□□□□□ -1.13
PKP4-217ENST00000628904 MSANTD4Q8NCY6 345 aa8□□□□□ -1.13
PKP4-217ENST00000628904 FIZ1Q96SL8 496 aa8□□□□□ -1.13
PKP4-217ENST00000628904 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
PKP4-217ENST00000628904 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa8□□□□□ -1.13
PKP4-217ENST00000628904 TJP2Q9UDY2 1190 aa8□□□□□ -1.13
PKP4-217ENST00000628904 NRAPQ86VF7 1730 aa8□□□□□ -1.13
PKP4-217ENST00000628904 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
PKP4-217ENST00000628904 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
PKP4-217ENST00000628904 RTN2O75298 545 aa8□□□□□ -1.13
PKP4-217ENST00000628904 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
PKP4-217ENST00000628904 NRLP54845 237 aa8□□□□□ -1.13
PKP4-217ENST00000628904 PPFIA1Q13136 1202 aa8□□□□□ -1.13
PKP4-217ENST00000628904 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
PKP4-217ENST00000628904 SLC39A4Q6P5W5 647 aa8□□□□□ -1.13
PKP4-217ENST00000628904 ARMCX2Q7L311 632 aa8□□□□□ -1.13
PKP4-217ENST00000628904 HOOK3Q86VS8 718 aa8□□□□□ -1.13
PKP4-217ENST00000628904 CTAGE3PQ8IX95 158 aa8□□□□□ -1.13
PKP4-217ENST00000628904 C12orf29Q8N999 325 aa8□□□□□ -1.13
PKP4-217ENST00000628904 PBKQ96KB5 322 aa8□□□□□ -1.13
PKP4-217ENST00000628904 EDEM3Q9BZQ6 932 aa8□□□□□ -1.13
PKP4-217ENST00000628904 NEUROG2Q9H2A3 272 aa8□□□□□ -1.13
PKP4-217ENST00000628904 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
PKP4-217ENST00000628904 KCND1Q9NSA2 647 aa8□□□□□ -1.13
PKP4-217ENST00000628904 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
PKP4-217ENST00000628904 PFASO15067 1338 aa7.99□□□□□ -1.13
PKP4-217ENST00000628904 PTPRJQ12913 1337 aa7.99□□□□□ -1.13
PKP4-217ENST00000628904 FRMD3A2A2Y4 597 aa7.99□□□□□ -1.13
PKP4-217ENST00000628904 F8VP50 259 aa7.99□□□□□ -1.13
PKP4-217ENST00000628904 GOLGA8RI6L899 631 aa7.99□□□□□ -1.13
PKP4-217ENST00000628904 ECEL1O95672 775 aa7.99□□□□□ -1.13
PKP4-217ENST00000628904 ETS1P14921 441 aa7.99□□□□□ -1.13
PKP4-217ENST00000628904 KRT15P19012 456 aa7.99□□□□□ -1.13
PKP4-217ENST00000628904 IFT88Q13099 833 aa7.99□□□□□ -1.13
PKP4-217ENST00000628904 KYNUQ16719 465 aa7.99□□□□□ -1.13
PKP4-217ENST00000628904 CASC4Q6P4E1 433 aa7.99□□□□□ -1.13
PKP4-217ENST00000628904 RFX6Q8HWS3 928 aa7.99□□□□□ -1.13
PKP4-217ENST00000628904 RHOT2Q8IXI1 618 aa7.99□□□□□ -1.13
PKP4-217ENST00000628904 OR6J1Q8NGC5 347 aa7.99□□□□□ -1.13
PKP4-217ENST00000628904 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP7.99□□□□□ -1.13
PKP4-217ENST00000628904 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
PKP4-217ENST00000628904 ZNF516Q92618 1163 aa7.99□□□□□ -1.13
PKP4-217ENST00000628904 LRRC45Q96CN5 670 aa7.99□□□□□ -1.13
PKP4-217ENST00000628904 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
PKP4-217ENST00000628904 MKNK1Q9BUB5 465 aa7.99□□□□□ -1.13
PKP4-217ENST00000628904 CHST7Q9NS84 486 aa7.99□□□□□ -1.13
PKP4-217ENST00000628904 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
PKP4-217ENST00000628904 EXTL3O43909 919 aa7.99□□□□□ -1.13
PKP4-217ENST00000628904 NR1D1P20393 614 aa7.99□□□□□ -1.13
PKP4-217ENST00000628904 ATP4AP20648 1035 aa7.99□□□□□ -1.13
PKP4-217ENST00000628904 ACTN2P35609 894 aa7.99□□□□□ -1.13
PKP4-217ENST00000628904 ERFP50548 548 aa7.99□□□□□ -1.13
PKP4-217ENST00000628904 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
PKP4-217ENST00000628904 IRX4P78413 519 aa7.99□□□□□ -1.13
PKP4-217ENST00000628904 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
PKP4-217ENST00000628904 GTF2BQ00403 316 aa7.99□□□□□ -1.13
PKP4-217ENST00000628904 KRT17Q04695 432 aa7.99□□□□□ -1.13
PKP4-217ENST00000628904 SLC29A2Q14542 456 aa7.99□□□□□ -1.13
PKP4-217ENST00000628904 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
PKP4-217ENST00000628904 C1orf228Q6PIY5 440 aa7.99□□□□□ -1.13
PKP4-217ENST00000628904 ABHD15Q6UXT9 468 aa7.99□□□□□ -1.13
PKP4-217ENST00000628904 JAMLQ86YT9 394 aa7.99□□□□□ -1.13
PKP4-217ENST00000628904 MAP4K3Q8IVH8 894 aa7.99□□□□□ -1.13
PKP4-217ENST00000628904 CCDC89Q8N998 374 aa7.99□□□□□ -1.13
PKP4-217ENST00000628904 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa7.99□□□□□ -1.13
PKP4-217ENST00000628904 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
PKP4-217ENST00000628904 RAB17Q9H0T7 212 aa7.99□□□□□ -1.13
PKP4-217ENST00000628904 MINDY3Q9H8M7 445 aa7.99□□□□□ -1.13
PKP4-217ENST00000628904 PNMA2Q9UL42 364 aa7.99□□□□□ -1.13
PKP4-217ENST00000628904 E2F8A0AVK6 867 aa7.99□□□□□ -1.13
PKP4-217ENST00000628904 VGLL3A8MV65 326 aa7.99□□□□□ -1.13
PKP4-217ENST00000628904 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
PKP4-217ENST00000628904 TMEM253P0C7T8 217 aa7.99□□□□□ -1.13
PKP4-217ENST00000628904 MAPTP10636 758 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
PKP4-217ENST00000628904 LCP1P13796 627 aa7.99□□□□□ -1.13
PKP4-217ENST00000628904 ATF2P15336 505 aa7.99□□□□□ -1.13
PKP4-217ENST00000628904 TCF4P15884 667 aa7.99□□□□□ -1.13
PKP4-217ENST00000628904 ARPP19P56211 112 aa7.99□□□□□ -1.13
PKP4-217ENST00000628904 CCNA1P78396 465 aa7.99□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.2 ms