RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000598932.5

FCHO1-226, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 5

Gene FCHO1, Length 575 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-226ENST00000598932 SPIRE2Q8WWL2 714 aa15.41■□□□□ 0.06
FCHO1-226ENST00000598932 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa15.41■□□□□ 0.06
FCHO1-226ENST00000598932 SLC38A7Q9NVC3 462 aa15.41■□□□□ 0.06
FCHO1-226ENST00000598932 CNTN3Q9P232 1028 aa15.41■□□□□ 0.06
FCHO1-226ENST00000598932 DOCK6Q96HP0 2047 aa15.4■□□□□ 0.06
FCHO1-226ENST00000598932 ANHXE9PGG2 379 aa15.4■□□□□ 0.06
FCHO1-226ENST00000598932 GFRA3O60609 400 aa15.4■□□□□ 0.06
FCHO1-226ENST00000598932 TOM1L1O75674 476 aa15.4■□□□□ 0.06
FCHO1-226ENST00000598932 SRFP11831 508 aa15.4■□□□□ 0.06
FCHO1-226ENST00000598932 KCNE1P15382 129 aa15.4■□□□□ 0.06
FCHO1-226ENST00000598932 HOXA9P31269 272 aa15.4■□□□□ 0.06
FCHO1-226ENST00000598932 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP15.4■□□□□ 0.06
FCHO1-226ENST00000598932 SMTNP53814 917 aa15.4■□□□□ 0.06
FCHO1-226ENST00000598932 ARPP19P56211 112 aa15.4■□□□□ 0.06
FCHO1-226ENST00000598932 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP15.4■□□□□ 0.06
FCHO1-226ENST00000598932 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP15.4■□□□□ 0.06
FCHO1-226ENST00000598932 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP15.4■□□□□ 0.06
FCHO1-226ENST00000598932 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP15.4■□□□□ 0.06
FCHO1-226ENST00000598932 PARM1Q6UWI2 310 aa15.4■□□□□ 0.06
FCHO1-226ENST00000598932 ANKS3Q6ZW76 656 aa15.4■□□□□ 0.06
FCHO1-226ENST00000598932 LRRC15Q8TF66 581 aa15.4■□□□□ 0.06
FCHO1-226ENST00000598932 FGF14Q92915 247 aa15.4■□□□□ 0.06
FCHO1-226ENST00000598932 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP15.4■□□□□ 0.06
FCHO1-226ENST00000598932 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP15.4■□□□□ 0.06
FCHO1-226ENST00000598932 WNT16Q9UBV4 365 aa15.4■□□□□ 0.06
FCHO1-226ENST00000598932 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa15.4■□□□□ 0.06
FCHO1-226ENST00000598932 CDH7Q9ULB5 785 aa15.4■□□□□ 0.06
FCHO1-226ENST00000598932 BACE2Q9Y5Z0 518 aa15.4■□□□□ 0.06
FCHO1-226ENST00000598932 MYH11P35749 1972 aa15.39■□□□□ 0.05
FCHO1-226ENST00000598932 TRAK2O60296 914 aa15.39■□□□□ 0.05
FCHO1-226ENST00000598932 RFX1P22670 979 aa15.39■□□□□ 0.05
FCHO1-226ENST00000598932 ROR1Q01973 937 aa15.39■□□□□ 0.05
FCHO1-226ENST00000598932 GRIN1Q05586 938 aa15.39■□□□□ 0.05
FCHO1-226ENST00000598932 SPAG1Q07617 926 aa15.39■□□□□ 0.05
FCHO1-226ENST00000598932 SLC10A6Q3KNW5 377 aa15.39■□□□□ 0.05
FCHO1-226ENST00000598932 ARSHQ5FYA8 562 aa15.39■□□□□ 0.05
FCHO1-226ENST00000598932 GPBP1Q86WP2 473 aa15.39■□□□□ 0.05
FCHO1-226ENST00000598932 ING5Q8WYH8 240 aa15.39■□□□□ 0.05
FCHO1-226ENST00000598932 FGF13Q92913 245 aa15.39■□□□□ 0.05
FCHO1-226ENST00000598932 NXPE3Q969Y0 559 aa15.39■□□□□ 0.05
FCHO1-226ENST00000598932 BICD1Q96G01 975 aa15.39■□□□□ 0.05
FCHO1-226ENST00000598932 REEP2Q9BRK0 252 aa15.39■□□□□ 0.05
FCHO1-226ENST00000598932 HAPLN2Q9GZV7 340 aa15.39■□□□□ 0.05
FCHO1-226ENST00000598932 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP15.39■□□□□ 0.05
FCHO1-226ENST00000598932 ZDHHC9Q9Y397 364 aa15.39■□□□□ 0.05
FCHO1-226ENST00000598932 NUB1Q9Y5A7 615 aa15.39■□□□□ 0.05
FCHO1-226ENST00000598932 CACNA1HO95180 2353 aa15.39■□□□□ 0.05
FCHO1-226ENST00000598932 CITO14578 2027 aa15.38■□□□□ 0.05
FCHO1-226ENST00000598932 VPS13AQ96RL7 3174 aa15.38■□□□□ 0.05
FCHO1-226ENST00000598932 CLDN3O15551 220 aa15.38■□□□□ 0.05
FCHO1-226ENST00000598932 CXCL8P10145 99 aa15.38■□□□□ 0.05
FCHO1-226ENST00000598932 NCKAP1LP55160 1127 aa15.38■□□□□ 0.05
FCHO1-226ENST00000598932 MCL1Q07820 350 aa15.38■□□□□ 0.05
FCHO1-226ENST00000598932 UVSSAQ2YD98 709 aa15.38■□□□□ 0.05
FCHO1-226ENST00000598932 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
FCHO1-226ENST00000598932 ZPBP2Q6X784 338 aa15.38■□□□□ 0.05
FCHO1-226ENST00000598932 CCDC105Q8IYK2 499 aa15.38■□□□□ 0.05
FCHO1-226ENST00000598932 CALML4Q96GE6 196 aa15.38■□□□□ 0.05
FCHO1-226ENST00000598932 RTP3Q9BQQ7 232 aa15.38■□□□□ 0.05
FCHO1-226ENST00000598932 TBC1D17Q9HA65 648 aa15.38■□□□□ 0.05
FCHO1-226ENST00000598932 KCND2Q9NZV8 630 aa15.38■□□□□ 0.05
FCHO1-226ENST00000598932 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
FCHO1-226ENST00000598932 WDR27A2RRH5 827 aa15.37■□□□□ 0.05
FCHO1-226ENST00000598932 PRRG1O14668 218 aa15.37■□□□□ 0.05
FCHO1-226ENST00000598932 MBD3O95983 291 aa15.37■□□□□ 0.05
FCHO1-226ENST00000598932 F13A1P00488 732 aa15.37■□□□□ 0.05
FCHO1-226ENST00000598932 POU2F2P09086 479 aa15.37■□□□□ 0.05
FCHO1-226ENST00000598932 PLCG1P19174 1290 aa15.37■□□□□ 0.05
FCHO1-226ENST00000598932 RPL9P32969 192 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
FCHO1-226ENST00000598932 UBA7P41226 1012 aa15.37■□□□□ 0.05
FCHO1-226ENST00000598932 TNFSF9P41273 254 aa15.37■□□□□ 0.05
FCHO1-226ENST00000598932 KARSQ15046 597 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
FCHO1-226ENST00000598932 SLC8B1Q6J4K2 584 aa15.37■□□□□ 0.05
FCHO1-226ENST00000598932 HAUS6Q7Z4H7 955 aa15.37■□□□□ 0.05
FCHO1-226ENST00000598932 FRMD5Q7Z6J6 570 aa15.37■□□□□ 0.05
FCHO1-226ENST00000598932 NPAS3Q8IXF0 933 aa15.37■□□□□ 0.05
FCHO1-226ENST00000598932 KCTD17Q8N5Z5 321 aa15.37■□□□□ 0.05
FCHO1-226ENST00000598932 DTWD2Q8NBA8 298 aa15.37■□□□□ 0.05
FCHO1-226ENST00000598932 RASSF8Q8NHQ8 419 aa15.37■□□□□ 0.05
FCHO1-226ENST00000598932 AK8Q96MA6 479 aa15.37■□□□□ 0.05
FCHO1-226ENST00000598932 KXD1Q9BQD3 176 aa15.37■□□□□ 0.05
FCHO1-226ENST00000598932 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
FCHO1-226ENST00000598932 ARHGEF3Q9NR81 526 aa15.37■□□□□ 0.05
FCHO1-226ENST00000598932 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa15.37■□□□□ 0.05
FCHO1-226ENST00000598932 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
FCHO1-226ENST00000598932 COL4A3Q01955 1670 aa15.37■□□□□ 0.05
FCHO1-226ENST00000598932 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
FCHO1-226ENST00000598932 MYH15Q9Y2K3 1946 aa15.37■□□□□ 0.05
FCHO1-226ENST00000598932 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
FCHO1-226ENST00000598932 K7ENM7 598 aa15.36■□□□□ 0.05
FCHO1-226ENST00000598932 SYN3O14994 580 aa15.36■□□□□ 0.05
FCHO1-226ENST00000598932 FAM13AO94988 1023 aa15.36■□□□□ 0.05
FCHO1-226ENST00000598932 KRT18P05783 430 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
FCHO1-226ENST00000598932 RHOP08100 348 aa15.36■□□□□ 0.05
FCHO1-226ENST00000598932 LIG4P49917 911 aa15.36■□□□□ 0.05
FCHO1-226ENST00000598932 GPC5P78333 572 aa15.36■□□□□ 0.05
FCHO1-226ENST00000598932 PKP1Q13835 747 aa15.36■□□□□ 0.05
FCHO1-226ENST00000598932 MCM6Q14566 821 aa15.36■□□□□ 0.05
FCHO1-226ENST00000598932 GSE1Q14687 1217 aa15.36■□□□□ 0.05
FCHO1-226ENST00000598932 ANGPT1Q15389 498 aa15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.4 ms