RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578334.5

TSPOAP1-AS1-202, TSPOAP1, SUPT4H1 and RNF43 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TSPOAP1-AS1, Length 956 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 PROB1E7EW31 1015 aa30.85■■■□□ 2.53
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 NBL1P41271 181 aa30.85■■■□□ 2.53
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 TMEM119Q4V9L6 283 aa30.85■■■□□ 2.53
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ARHGEF3Q9NR81 526 aa30.85■■■□□ 2.53
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 RTL10Q7L3V2 364 aa30.84■■■□□ 2.53
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CLDN3O15551 220 aa30.83■■■□□ 2.53
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ARPP19P56211 112 aa30.83■■■□□ 2.53
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 SLC8B1Q6J4K2 584 aa30.83■■■□□ 2.53
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 BICD1Q96G01 975 aa30.83■■■□□ 2.53
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP30.82■■■□□ 2.53
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ASCL5Q7RTU5 278 aa30.82■■■□□ 2.52
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 AK8Q96MA6 479 aa30.82■■■□□ 2.52
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 KCNH3Q9ULD8 1083 aa30.82■■■□□ 2.52
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP30.82■■■□□ 2.52
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 MCM4P33991 863 aa30.81■■■□□ 2.52
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 PTPN2P17706 415 aa30.76■■■□□ 2.51
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 SLC5A9Q2M3M2 681 aa30.76■■■□□ 2.51
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 MYCT1Q8N699 235 aa30.76■■■□□ 2.51
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 KIF12Q96FN5 646 aa30.76■■■□□ 2.51
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 SHDQ96IW2 340 aa30.76■■■□□ 2.51
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 FOXQ1Q9C009 403 aa30.76■■■□□ 2.51
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 FAM186AA6NE01 2351 aa30.75■■■□□ 2.51
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