RNA–Protein interactions for RNA: YPR178W

PRP4, Transcript of Splicing factor, yeastyeast

Gene PRP4, Length 1,398 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PRP4YPR178W MRPL28P36527 147 aa9.17□□□□□ -0.94
PRP4YPR178W YBR292CP38357 123 aa9.17□□□□□ -0.94
PRP4YPR178W SUR2P38992 349 aa9.17□□□□□ -0.94
PRP4YPR178W YAL037WP39728 267 aa9.17□□□□□ -0.94
PRP4YPR178W GET2P40056 285 aa9.17□□□□□ -0.94
PRP4YPR178W FLX1P40464 311 aa9.17□□□□□ -0.94
PRP4YPR178W IKS1P47042 667 aa9.17□□□□□ -0.94
PRP4YPR178W ALG9P53868 555 aaKnown RBP9.17□□□□□ -0.94
PRP4YPR178W YDR415CQ04033 374 aaPredicted RBP9.17□□□□□ -0.94
PRP4YPR178W YLR456WQ06199 204 aa9.17□□□□□ -0.94
PRP4YPR178W CTR3Q06686 241 aa9.17□□□□□ -0.94
PRP4YPR178W THI73Q07904 523 aa9.17□□□□□ -0.94
PRP4YPR178W YOL073CQ08232 322 aa9.17□□□□□ -0.94
PRP4YPR178W MCP1Q12106 302 aa9.17□□□□□ -0.94
PRP4YPR178W RPB8P20436 146 aa9.16□□□□□ -0.94
PRP4YPR178W RFA1P22336 621 aaKnown RBP9.16□□□□□ -0.94
PRP4YPR178W EDS1P38073 919 aa9.16□□□□□ -0.94
PRP4YPR178W MRPS9P38120 278 aa9.16□□□□□ -0.94
PRP4YPR178W FAT1P38225 669 aa9.16□□□□□ -0.94
PRP4YPR178W LRO1P40345 661 aa9.16□□□□□ -0.94
PRP4YPR178W YIL108WP40483 696 aaKnown RBP9.16□□□□□ -0.94
PRP4YPR178W ASK10P48361 1146 aa9.16□□□□□ -0.94
PRP4YPR178W YGL262WP53054 175 aa9.16□□□□□ -0.94
PRP4YPR178W YNR066CP53752 436 aa9.16□□□□□ -0.94
PRP4YPR178W VPS28Q02767 242 aa9.16□□□□□ -0.94
PRP4YPR178W THI74Q04083 370 aa9.16□□□□□ -0.94
PRP4YPR178W AVO2Q04749 426 aa9.16□□□□□ -0.94
PRP4YPR178W ENB1Q08299 606 aa9.16□□□□□ -0.94
PRP4YPR178W UBA3Q99344 299 aa9.16□□□□□ -0.94
PRP4YPR178W MET3P08536 511 aa9.15□□□□□ -0.94
PRP4YPR178W MIR1P23641 311 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
PRP4YPR178W MEK1P24719 497 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.94
PRP4YPR178W SOL3P38858 249 aa9.15□□□□□ -0.94
PRP4YPR178W LYS1P38998 373 aaRIP-Chip data9.15□□□□□ -0.94not detected
PRP4YPR178W LSB3P43603 459 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
PRP4YPR178W BNS1P50084 137 aa9.15□□□□□ -0.94
PRP4YPR178W SAM50P53969 484 aa9.15□□□□□ -0.94
PRP4YPR178W ERG13P54839 491 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
PRP4YPR178W PET191Q02772 108 aa9.15□□□□□ -0.94
PRP4YPR178W BDS1Q08347 646 aa9.15□□□□□ -0.94
PRP4YPR178W SRO7Q12038 1033 aa9.15□□□□□ -0.94
PRP4YPR178W ERP4Q12450 207 aa9.15□□□□□ -0.94
PRP4YPR178W COA6Q3E846 104 aa9.15□□□□□ -0.94
PRP4YPR178W RPL1AP0CX43 217 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
PRP4YPR178W RPL1BP0CX44 217 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
PRP4YPR178W PTP1P25044 335 aa9.14□□□□□ -0.95
PRP4YPR178W YCR101CP25607 182 aa9.14□□□□□ -0.95
PRP4YPR178W FRM2P37261 193 aa9.14□□□□□ -0.95
PRP4YPR178W AIR1P40507 360 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
PRP4YPR178W PMT3P47190 753 aa9.14□□□□□ -0.95
PRP4YPR178W SKO1Q02100 647 aa9.14□□□□□ -0.95
PRP4YPR178W EKI1Q03764 534 aa9.14□□□□□ -0.95
PRP4YPR178W MHR1Q06630 226 aa9.14□□□□□ -0.95
PRP4YPR178W YOR015WQ12169 119 aa9.14□□□□□ -0.95
PRP4YPR178W CDC50P25656 391 aa9.13□□□□□ -0.95
PRP4YPR178W XBP1P40489 647 aa9.13□□□□□ -0.95
PRP4YPR178W PHS1P40857 217 aa9.13□□□□□ -0.95
PRP4YPR178W BRR6P53062 197 aa9.13□□□□□ -0.95
PRP4YPR178W YHM2Q04013 314 aa9.13□□□□□ -0.95
PRP4YPR178W ARR2Q06597 130 aa9.13□□□□□ -0.95
PRP4YPR178W YOR343CQ12484 108 aa9.13□□□□□ -0.95
PRP4YPR178W MPD2Q99316 277 aa9.13□□□□□ -0.95
PRP4YPR178W GDH1P07262 454 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
PRP4YPR178W PRE9P23638 258 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
PRP4YPR178W KRR1P25586 316 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
PRP4YPR178W WSS1P38838 269 aa9.12□□□□□ -0.95
PRP4YPR178W YHR180WP38868 163 aa9.12□□□□□ -0.95
PRP4YPR178W IRC24P40580 263 aa9.12□□□□□ -0.95
PRP4YPR178W YJR141WP47172 347 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
PRP4YPR178W SKP1P52286 194 aa9.12□□□□□ -0.95
PRP4YPR178W TEX1P53851 422 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
PRP4YPR178W RNH201P53942 307 aa9.12□□□□□ -0.95
PRP4YPR178W CYT2Q00873 224 aa9.12□□□□□ -0.95
PRP4YPR178W YDR387CQ04162 555 aa9.12□□□□□ -0.95
PRP4YPR178W SEN15Q04675 128 aa9.12□□□□□ -0.95
PRP4YPR178W YDR344CQ05510 147 aa9.12□□□□□ -0.95
PRP4YPR178W MSW1P04803 379 aa9.12□□□□□ -0.95
PRP4YPR178W TY1A-HP0C2I4 478 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
PRP4YPR178W PAU19P0CE85 124 aa9.12□□□□□ -0.95
PRP4YPR178W PAU21P0CE86 164 aa9.12□□□□□ -0.95
PRP4YPR178W PAU22P0CE87 164 aa9.12□□□□□ -0.95
PRP4YPR178W PAU3P25610 124 aa9.12□□□□□ -0.95
PRP4YPR178W PPA2P28239 310 aa9.12□□□□□ -0.95
PRP4YPR178W YJR011CP47086 261 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
PRP4YPR178W YDC1Q02896 317 aa9.12□□□□□ -0.95
PRP4YPR178W YPR174CQ06616 221 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
PRP4YPR178W TGS1Q12052 315 aa9.12□□□□□ -0.95
PRP4YPR178W IZH2Q12442 317 aa9.12□□□□□ -0.95
PRP4YPR178W AGA2P32781 87 aa9.11□□□□□ -0.95
PRP4YPR178W ARC40P38328 384 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
PRP4YPR178W SLM6P38343 150 aa9.11□□□□□ -0.95
PRP4YPR178W COQ5P49017 307 aa9.11□□□□□ -0.95
PRP4YPR178W YMR082CQ04276 118 aa9.11□□□□□ -0.95
PRP4YPR178W TDA6Q06466 467 aa9.11□□□□□ -0.95
PRP4YPR178W MIM1Q08176 113 aa9.11□□□□□ -0.95
PRP4YPR178W FUN14P18411 198 aa9.1□□□□□ -0.95
PRP4YPR178W SNF5P18480 905 aa9.1□□□□□ -0.95
PRP4YPR178W MAK32P23060 363 aa9.1□□□□□ -0.95
PRP4YPR178W OM14P38325 134 aa9.1□□□□□ -0.95
PRP4YPR178W MOB2P43563 287 aa9.1□□□□□ -0.95
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