RNA–Protein interactions for RNA: YMR179W

SPT21, Transcript of Protein with a role in transcriptional silencing, yeast

Gene SPT21, Length 2,277 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SPT21	YMR179W	TPO4	Q12256	659 aa		0.93	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	GEP5	Q12393	293 aa		0.93	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	NCB2	Q92317	146 aa		0.93	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	YPL229W	Q99395	206 aa		0.93	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	YDR157W	A0A023PZE8	133 aa		0.92	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	RAD10	P06838	210 aa		0.92	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	SPT3	P06844	337 aa		0.92	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	MET2	P08465	486 aa		0.92	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	MCM22	P47167	239 aa		0.92	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	YJR149W	P47177	404 aa		0.92	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	TOS8	P53147	276 aa		0.92	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	ALG13	P53178	202 aa		0.92	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	MSA1	Q08471	629 aa		0.92	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	AGC1	Q12482	902 aa		0.92	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	SIR4	P11978	1358 aa		0.92	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	JIP3	O13555	125 aa		0.92	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	YLR462W	O13556	202 aa		0.92	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	RPL28	P02406	149 aa	Known RBP	0.92	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	SEC22	P22214	214 aa		0.92	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	RCN1	P36054	211 aa		0.92	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	MSA2	P36157	363 aa		0.92	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	YEL075C	P39972	122 aa		0.92	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	YER084W	P40057	128 aa		0.92	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	PIR5	P46999	287 aa		0.92	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	NUP57	P48837	541 aa		0.92	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	CWC23	P52868	283 aa	Predicted RBP	0.92	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	MGA1	P53050	456 aa		0.92	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	NSA1	P53136	463 aa	Predicted RBP	0.92	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	FYV6	P53913	173 aa		0.92	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	MRPS17	Q03246	237 aa	Predicted RBP	0.92	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	YDR114C	Q04597	100 aa		0.92	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	YOR268C	Q08734	132 aa		0.92	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	DCN1	Q12395	269 aa		0.92	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	YHR139C-A	O13536	103 aa		0.91	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	IPP1	P00817	287 aa	Known RBP	0.91	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	SGA1	P08019	549 aa		0.91	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	URA6	P15700	204 aa		0.91	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	KRE1	P17260	313 aa		0.91	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	ERG24	P32462	438 aa	Known RBP	0.91	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	PRX1	P34227	261 aa	Known RBP	0.91	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	SRY1	P36007	326 aa		0.91	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	COS8	P38723	381 aa		0.91	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	GON7	P46984	123 aa		0.91	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	YGL159W	P53110	370 aa		0.91	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	RSM10	Q03201	203 aa		0.91	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	FAR8	Q05040	523 aa		0.91	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	INM2	Q05533	292 aa		0.91	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	YPR172W	Q06608	200 aa		0.91	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	HEM25	Q07534	307 aa		0.91	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	RSA4	P25382	515 aa	Known RBP	0.91	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	MIG1	P27705	504 aa		0.91	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	TAF14	P35189	244 aa		0.91	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	PEX17	P40155	199 aa		0.91	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	RFC4	P40339	323 aa	Known RBP	0.91	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	CAT5	P41735	233 aa		0.91	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	OST2	P46964	130 aa		0.91	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	ADO1	P47143	340 aa	Known RBP	0.91	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	YJR141W	P47172	347 aa	Predicted RBP	0.91	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	BRR6	P53062	197 aa		0.91	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	YGL088W	P53151	121 aa		0.91	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	CUS2	P53830	285 aa	Predicted RBP	0.91	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	YMR226C	Q05016	267 aa	Known RBP	0.91	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	YLR030W	Q07967	263 aa		0.91	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	FEX1	Q08913	375 aa		0.91	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	YPL257W	Q08974	193 aa		0.91	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	FEX2	Q08991	375 aa		0.91	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	YRA1	Q12159	226 aa	Known RBP	0.91	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	JLP1	Q12358	412 aa		0.91	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	BBP1	Q12365	385 aa		0.91	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	HTL1	Q9URQ5	78 aa		0.91	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	COX5A	P00424	153 aa		0.9	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	CDC28	P00546	298 aa	Known RBP	0.9	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	MATALPHA2	P0CY08	210 aa		0.9	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	HMLALPHA2	P0CY09	210 aa		0.9	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	DPM1	P14020	267 aa	Known RBP	0.9	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	CBF1	P17106	351 aa		0.9	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	DBF2	P22204	572 aa		0.9	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	IDH1	P28834	360 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.9	□□□□□ -2.26	not detected
SPT21	YMR179W	YGP1	P38616	354 aa	Known RBP	0.9	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	YER188W	P40103	239 aa		0.9	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	HAM1	P47119	197 aa	Known RBP	0.9	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	ILM1	P47155	203 aa		0.9	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	RMR1	P53060	241 aa		0.9	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	GTR2	P53290	341 aa		0.9	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	ERV29	P53337	310 aa		0.9	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	SSQ1	Q05931	657 aa	Predicted RBP	0.9	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	GET4	Q12125	312 aa		0.9	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	HTB1	P02293	131 aa	Known RBP	0.9	□□□□□ -2.27
SPT21	YMR179W	HTB2	P02294	131 aa		0.9	□□□□□ -2.27
SPT21	YMR179W	RFA3	P26755	122 aa	Known RBP	0.9	□□□□□ -2.27
SPT21	YMR179W	RPF1	P38805	295 aa	Known RBP	0.9	□□□□□ -2.27
SPT21	YMR179W	IKI1	P38874	309 aa		0.9	□□□□□ -2.27
SPT21	YMR179W	TIF34	P40217	347 aa	Known RBP	0.9	□□□□□ -2.27
SPT21	YMR179W	SYF2	P53277	215 aa	Predicted RBP	0.9	□□□□□ -2.27
SPT21	YMR179W	SSU72	P53538	206 aa	Predicted RBP	0.9	□□□□□ -2.27
SPT21	YMR179W	GIM3	P53900	129 aa		0.9	□□□□□ -2.27
SPT21	YMR179W	GRH1	Q04410	372 aa	Known RBP	0.9	□□□□□ -2.27
SPT21	YMR179W	YML096W	Q04489	525 aa		0.9	□□□□□ -2.27
SPT21	YMR179W	NIP7	Q08962	181 aa	Known RBP	0.9	□□□□□ -2.27
SPT21	YMR179W	SAS5	Q99314	248 aa		0.9	□□□□□ -2.27

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