RNA–Protein interactions for RNA: YLL013C

PUF3, Transcript of Protein of the mitochondrial outer surface, yeast

Gene PUF3, Length 2,640 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PUF3	YLL013C	PIC2	P40035	300 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PUF3	YLL013C	GNA1	P43577	159 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
PUF3	YLL013C	SCW11	P53189	542 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PUF3	YLL013C	RFM1	Q12192	310 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PUF3	YLL013C	NKP1	Q12493	238 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PUF3	YLL013C	YLR358C	O13565	187 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PUF3	YLL013C	GDH1	P07262	454 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
PUF3	YLL013C	RPS18A	P0CX55	146 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
PUF3	YLL013C	RPS18B	P0CX56	146 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
PUF3	YLL013C	VMA3	P25515	160 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PUF3	YLL013C	ISC10	P32645	267 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PUF3	YLL013C	MRPL36	P36531	177 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PUF3	YLL013C	PRS2	P38620	318 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
PUF3	YLL013C	PCL6	P40038	420 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PUF3	YLL013C	MID1	P41821	548 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PUF3	YLL013C	IMO32	P53219	342 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PUF3	YLL013C	ATG40	Q99325	256 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PUF3	YLL013C	ATP10	P18496	279 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PUF3	YLL013C	PET18	P25362	215 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PUF3	YLL013C	YJL218W	P40892	196 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
PUF3	YLL013C	YGL114W	P53134	725 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PUF3	YLL013C	OKP1	P53298	406 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PUF3	YLL013C	SPO19	Q03029	223 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PUF3	YLL013C	ECM18	Q04623	453 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PUF3	YLL013C	MDM36	Q06820	579 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PUF3	YLL013C	WHI5	Q12416	295 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PUF3	YLL013C	ARO4	P32449	370 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
PUF3	YLL013C	ZUO1	P32527	433 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
PUF3	YLL013C	ALG14	P38242	237 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PUF3	YLL013C	CCZ1	P38273	704 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PUF3	YLL013C	YPL108W	Q02872	168 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
PUF3	YLL013C	SRL4	Q03085	281 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PUF3	YLL013C	TDA1	Q03533	586 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PUF3	YLL013C	ARR2	Q06597	130 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PUF3	YLL013C	SRL1	Q08673	210 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PUF3	YLL013C	YCR101C	P25607	182 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PUF3	YLL013C	PEX4	P29340	183 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PUF3	YLL013C	YBR137W	P38276	179 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PUF3	YLL013C	GPI14	P47088	403 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
PUF3	YLL013C	BXI1	P48558	297 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PUF3	YLL013C	BUD25	P85052	153 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PUF3	YLL013C	MGR3	Q04472	501 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PUF3	YLL013C	VAM3	Q12241	283 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PUF3	YLL013C	HIS3	P06633	220 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PUF3	YLL013C	RFA3	P26755	122 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
PUF3	YLL013C	YKL102C	P34249	101 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PUF3	YLL013C	SMB1	P40018	196 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
PUF3	YLL013C	RPL21A	Q02753	160 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
PUF3	YLL013C	RCF1	Q03713	159 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PUF3	YLL013C	HNT1	Q04344	158 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
PUF3	YLL013C	ADH6	Q04894	360 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
PUF3	YLL013C	RPL21B	Q12672	160 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
PUF3	YLL013C	ERG3	P32353	365 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PUF3	YLL013C	DAL3	P32459	195 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PUF3	YLL013C	VAM7	P32912	316 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PUF3	YLL013C	SOR1	P35497	357 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
PUF3	YLL013C	FMP23	P38231	175 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PUF3	YLL013C	SYS1	P41544	203 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PUF3	YLL013C	ATG18	P43601	500 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PUF3	YLL013C	TTI2	P47168	421 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PUF3	YLL013C	SKP1	P52286	194 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PUF3	YLL013C	SOR2	Q07786	357 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PUF3	YLL013C	CCS1	P40202	249 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
PUF3	YLL013C	HNT2	P49775	206 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PUF3	YLL013C	YGR045C	P53229	120 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PUF3	YLL013C	HSK3	P69852	69 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PUF3	YLL013C	YMR130W	Q04223	302 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PUF3	YLL013C	ODC2	Q99297	307 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PUF3	YLL013C	RPS31	P05759	152 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
PUF3	YLL013C	CDC34	P14682	295 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PUF3	YLL013C	ATG22	P25568	528 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PUF3	YLL013C	VMA5	P31412	392 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
PUF3	YLL013C	SWD2	P36104	329 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
PUF3	YLL013C	BNA1	P47096	177 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PUF3	YLL013C	YGR054W	P53235	642 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
PUF3	YLL013C	BBP1	Q12365	385 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PUF3	YLL013C	YLL053C	P0CD98	152 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PUF3	YLL013C	PAC2	P39937	518 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PUF3	YLL013C	BNA6	P43619	295 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PUF3	YLL013C	VHT1	P53241	593 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PUF3	YLL013C	ATG41	Q12048	136 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PUF3	YLL013C	RAX2	Q12465	1220 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PUF3	YLL013C	SUS1	Q6WNK7	96 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PUF3	YLL013C	ADH5	P38113	351 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
PUF3	YLL013C	FIG1	P38224	298 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PUF3	YLL013C	YDL186W	P48568	277 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PUF3	YLL013C	YGL262W	P53054	175 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PUF3	YLL013C	DYN1	P36022	4092 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PUF3	YLL013C	SWD3	P38123	315 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PUF3	YLL013C	GPX2	P38143	162 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PUF3	YLL013C	NTC20	P38302	140 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
PUF3	YLL013C	IES5	P40060	125 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PUF3	YLL013C	FIT1	Q04433	528 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PUF3	YLL013C	URA6	P15700	204 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PUF3	YLL013C	SUA7	P29055	345 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
PUF3	YLL013C	PRE4	P30657	266 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PUF3	YLL013C	HOM6	P31116	359 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
PUF3	YLL013C	GWT1	P47026	490 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PUF3	YLL013C	YGR042W	P53227	271 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PUF3	YLL013C	YDR179W-A	Q03983	463 aa		4.71	□□□□□ -1.66

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 26.3 ms