RNA–Protein interactions for RNA: YJL019W

MPS3, Transcript of Nuclear envelope protein, yeast

Gene MPS3, Length 2,049 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MPS3	YJL019W	YPL272C	Q08984	517 aa		4.17	□□□□□ -1.74
MPS3	YJL019W	YCT1	Q12235	531 aa		4.17	□□□□□ -1.74
MPS3	YJL019W	GLO4	Q12320	285 aa		4.17	□□□□□ -1.74
MPS3	YJL019W	YDR262W	Q12331	272 aa		4.17	□□□□□ -1.74
MPS3	YJL019W	RPS13	P05756	151 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
MPS3	YJL019W	QCR2	P07257	368 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MPS3	YJL019W	SNF5	P18480	905 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MPS3	YJL019W	NUP1	P20676	1076 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MPS3	YJL019W	TRS65	P32893	560 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MPS3	YJL019W	MIA40	P36046	403 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MPS3	YJL019W	FAT1	P38225	669 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MPS3	YJL019W	AIM3	P38266	947 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
MPS3	YJL019W	NOP16	P40007	231 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
MPS3	YJL019W	YIL067C	P40514	678 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MPS3	YJL019W	FAF1	P40546	346 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
MPS3	YJL019W	BUD8	P41698	603 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MPS3	YJL019W	ASK10	P48361	1146 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MPS3	YJL019W	SLX9	P53251	210 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
MPS3	YJL019W	VPS62	P53285	467 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MPS3	YJL019W	PBP1	P53297	722 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
MPS3	YJL019W	SKO1	Q02100	647 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MPS3	YJL019W	YDC1	Q02896	317 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MPS3	YJL019W	NRG1	Q03125	231 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MPS3	YJL019W	YML096W	Q04489	525 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MPS3	YJL019W	PFA4	Q12006	378 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MPS3	YJL019W	SRL2	Q12020	392 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MPS3	YJL019W	MCT1	Q12283	360 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MPS3	YJL019W	ERG27	Q12452	347 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
MPS3	YJL019W	TMA17	Q12513	150 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MPS3	YJL019W	YIL002W-A	Q3E7Z5	69 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MPS3	YJL019W	YLR358C	O13565	187 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MPS3	YJL019W	SGA1	P08019	549 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MPS3	YJL019W	OLE1	P21147	510 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
MPS3	YJL019W	SEC62	P21825	274 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MPS3	YJL019W	PRO1	P32264	428 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MPS3	YJL019W	AFR1	P33304	620 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MPS3	YJL019W	PAD1	P33751	242 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.16	□□□□□ -1.74	not detected
MPS3	YJL019W	MRPL15	P36523	253 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MPS3	YJL019W	UMP1	P38293	148 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MPS3	YJL019W	SLZ1	P40167	298 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MPS3	YJL019W	MOB2	P43563	287 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MPS3	YJL019W	BNS1	P50084	137 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MPS3	YJL019W	RMD9	P53140	646 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
MPS3	YJL019W	YNR066C	P53752	436 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MPS3	YJL019W	ALG9	P53868	555 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
MPS3	YJL019W	ASM4	Q05166	528 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MPS3	YJL019W	YOR352W	Q08816	343 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MPS3	YJL019W	YOR015W	Q12169	119 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MPS3	YJL019W	FYV7	Q12247	151 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MPS3	YJL019W	HMS1	Q12398	434 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MPS3	YJL019W	CDC28	P00546	298 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
MPS3	YJL019W	TRP4	P07285	380 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
MPS3	YJL019W	MET3	P08536	511 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MPS3	YJL019W	PAU19	P0CE85	124 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MPS3	YJL019W	PAU21	P0CE86	164 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MPS3	YJL019W	PAU22	P0CE87	164 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MPS3	YJL019W	CTA1	P15202	515 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MPS3	YJL019W	PAU3	P25610	124 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MPS3	YJL019W	EHD3	P28817	500 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MPS3	YJL019W	ARO4	P32449	370 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
MPS3	YJL019W	EHT1	P38295	451 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MPS3	YJL019W	NAS2	P40555	220 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MPS3	YJL019W	PHS1	P40857	217 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MPS3	YJL019W	GPP1	P41277	250 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
MPS3	YJL019W	TPC1	P53257	314 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MPS3	YJL019W	YAP1802	P53309	568 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MPS3	YJL019W	TEX1	P53851	422 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
MPS3	YJL019W	VPS28	Q02767	242 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MPS3	YJL019W	TMA10	Q06177	86 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MPS3	YJL019W	TDA6	Q06466	467 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MPS3	YJL019W	COQ10	Q08058	207 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MPS3	YJL019W	NPC2	Q12408	173 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MPS3	YJL019W	SET6	Q12529	373 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MPS3	YJL019W	YNR034W-A	Q3E841	98 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MPS3	YJL019W	YIL134C-A	Q45U18	67 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MPS3	YJL019W	TOM1	Q03280	3268 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MPS3	YJL019W	GDH1	P07262	454 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
MPS3	YJL019W	RIP1	P08067	215 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MPS3	YJL019W	RPL20A	P0CX23	172 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
MPS3	YJL019W	RPL20B	P0CX24	172 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
MPS3	YJL019W	SPT15	P13393	240 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
MPS3	YJL019W	STE18	P18852	110 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MPS3	YJL019W	VMA16	P23968	213 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MPS3	YJL019W	STP22	P25604	385 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MPS3	YJL019W	MRPL11	P36521	249 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
MPS3	YJL019W	ARC40	P38328	384 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
MPS3	YJL019W	PTC7	P38797	343 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MPS3	YJL019W	WSS1	P38838	269 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MPS3	YJL019W	ERJ5	P43613	295 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
MPS3	YJL019W	PMT3	P47190	753 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MPS3	YJL019W	YGR066C	P53242	292 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MPS3	YJL019W	MPP6	P53725	186 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
MPS3	YJL019W	THI74	Q04083	370 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MPS3	YJL019W	IZH2	Q12442	317 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MPS3	YJL019W	ERP4	Q12450	207 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MPS3	YJL019W	MPD2	Q99316	277 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MPS3	YJL019W	UBA3	Q99344	299 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MPS3	YJL019W	Q0182	Q9ZZW1	134 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MPS3	YJL019W	RFA3	P26755	122 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
MPS3	YJL019W	NRP1	P32770	719 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.14	□□□□□ -1.75	not detected

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 65.4 ms