RNA–Protein interactions for RNA: YHR139C

SPS100, Transcript of Protein required for spore wall maturation, yeast

Gene SPS100, Length 981 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SPS100	YHR139C	UTP15	Q04305	513 aa	Known RBP	7.41	□□□□□ -1.22
SPS100	YHR139C	PIN3	Q06449	215 aa		7.41	□□□□□ -1.22
SPS100	YHR139C	YLR031W	Q07978	186 aa		7.41	□□□□□ -1.22
SPS100	YHR139C	EAF3	Q12432	401 aa		7.41	□□□□□ -1.22
SPS100	YHR139C	YML003W	P0CF16	290 aa		7.4	□□□□□ -1.22
SPS100	YHR139C	PET54	P10834	293 aa		7.4	□□□□□ -1.22
SPS100	YHR139C	MNS1	P32906	549 aa		7.4	□□□□□ -1.22
SPS100	YHR139C	YER121W	P40076	114 aa		7.4	□□□□□ -1.22
SPS100	YHR139C	MID1	P41821	548 aa		7.4	□□□□□ -1.22
SPS100	YHR139C	TAF4	P50105	388 aa		7.4	□□□□□ -1.22
SPS100	YHR139C	SKP1	P52286	194 aa		7.4	□□□□□ -1.22
SPS100	YHR139C	ARO8	P53090	500 aa	Known RBP	7.4	□□□□□ -1.22
SPS100	YHR139C	PHO92	Q06390	306 aa		7.4	□□□□□ -1.22
SPS100	YHR139C	YOR186W	Q08560	144 aa		7.4	□□□□□ -1.22
SPS100	YHR139C	FSH3	Q99369	266 aa		7.4	□□□□□ -1.22
SPS100	YHR139C	TDH2	P00358	332 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
SPS100	YHR139C	RPS31	P05759	152 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
SPS100	YHR139C	PEX4	P29340	183 aa		7.39	□□□□□ -1.23
SPS100	YHR139C	YOX1	P34161	385 aa		7.39	□□□□□ -1.23
SPS100	YHR139C	YKE4	P40544	346 aa		7.39	□□□□□ -1.23
SPS100	YHR139C	TY1A-MR1	Q04215	440 aa		7.39	□□□□□ -1.23
SPS100	YHR139C	YMR254C	Q04838	102 aa		7.39	□□□□□ -1.23
SPS100	YHR139C	FCY22	Q12119	530 aa		7.39	□□□□□ -1.23
SPS100	YHR139C	YLR108C	Q12259	485 aa		7.39	□□□□□ -1.23
SPS100	YHR139C	RFA1	P22336	621 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
SPS100	YHR139C	RIB7	P33312	244 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SPS100	YHR139C	RPS0B	P46654	252 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
SPS100	YHR139C	MSE1	P48525	536 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SPS100	YHR139C	RPA14	P50106	137 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SPS100	YHR139C	GIM3	P53900	129 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SPS100	YHR139C	YNL046W	P53956	172 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SPS100	YHR139C	TMC1	Q08422	150 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
SPS100	YHR139C	MPD1	Q12404	318 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
SPS100	YHR139C	YBL029C-A	Q3E756	94 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SPS100	YHR139C	RPL39	P04650	51 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SPS100	YHR139C	SPS2	P08459	502 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SPS100	YHR139C	PET122	P10355	254 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SPS100	YHR139C	YCR101C	P25607	182 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SPS100	YHR139C	IMP1	P28627	190 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SPS100	YHR139C	LNP1	P38878	278 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SPS100	YHR139C	RMD6	P39975	231 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SPS100	YHR139C	MRX5	P47007	382 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SPS100	YHR139C	GWT1	P47026	490 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SPS100	YHR139C	RSM27	P53305	110 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SPS100	YHR139C	YPL067C	Q02754	198 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SPS100	YHR139C	TY1A-DR2	Q03964	440 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
SPS100	YHR139C	GMC1	Q04399	608 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SPS100	YHR139C	GRC3	Q07845	632 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SPS100	YHR139C	WSC3	Q12215	556 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SPS100	YHR139C	BPH1	P25356	2167 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SPS100	YHR139C	AAC1	P04710	309 aa		7.36	□□□□□ -1.23
SPS100	YHR139C	YLL053C	P0CD98	152 aa		7.36	□□□□□ -1.23
SPS100	YHR139C	CDC23	P16522	626 aa		7.36	□□□□□ -1.23
SPS100	YHR139C	IFM1	P25038	676 aa		7.36	□□□□□ -1.23
SPS100	YHR139C	YCP4	P25349	247 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
SPS100	YHR139C	ERG3	P32353	365 aa		7.36	□□□□□ -1.23
SPS100	YHR139C	AGA2	P32781	87 aa		7.36	□□□□□ -1.23
SPS100	YHR139C	FIG1	P38224	298 aa		7.36	□□□□□ -1.23
SPS100	YHR139C	PRS2	P38620	318 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
SPS100	YHR139C	GLR1	P41921	483 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
SPS100	YHR139C	GON7	P46984	123 aa		7.36	□□□□□ -1.23
SPS100	YHR139C	BNA2	P47125	453 aa		7.36	□□□□□ -1.23
SPS100	YHR139C	PEF1	P53238	335 aa		7.36	□□□□□ -1.23
SPS100	YHR139C	PRM15	Q03262	622 aa		7.36	□□□□□ -1.23
SPS100	YHR139C	YDR114C	Q04597	100 aa		7.36	□□□□□ -1.23
SPS100	YHR139C	RNA14	P25298	677 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
SPS100	YHR139C	MRPL27	P36526	146 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
SPS100	YHR139C	YBR242W	P38331	238 aa		7.35	□□□□□ -1.23
SPS100	YHR139C	CCS1	P40202	249 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
SPS100	YHR139C	SBH2	P52871	88 aa		7.35	□□□□□ -1.23
SPS100	YHR139C	ARG5,6	Q01217	863 aa		7.35	□□□□□ -1.23
SPS100	YHR139C	YML018C	Q03730	393 aa		7.35	□□□□□ -1.23
SPS100	YHR139C	UPS1	Q05776	175 aa		7.35	□□□□□ -1.23
SPS100	YHR139C	ENV7	Q12003	364 aa		7.35	□□□□□ -1.23
SPS100	YHR139C	WHI5	Q12416	295 aa		7.35	□□□□□ -1.23
SPS100	YHR139C	RDI1	Q12434	202 aa		7.35	□□□□□ -1.23
SPS100	YHR139C	ATG40	Q99325	256 aa		7.35	□□□□□ -1.23
SPS100	YHR139C	MRPL3	P36516	390 aa		7.34	□□□□□ -1.23
SPS100	YHR139C	OSH7	P38755	437 aa		7.34	□□□□□ -1.23
SPS100	YHR139C	CTR2	P38865	189 aa		7.34	□□□□□ -1.23
SPS100	YHR139C	SLM1	P40485	686 aa		7.34	□□□□□ -1.23
SPS100	YHR139C	YIL012W	P40551	113 aa		7.34	□□□□□ -1.23
SPS100	YHR139C	YJR011C	P47086	261 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
SPS100	YHR139C	TEX1	P53851	422 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
SPS100	YHR139C	SNA4	Q07549	140 aa		7.34	□□□□□ -1.23
SPS100	YHR139C	YOR385W	Q08909	290 aa		7.34	□□□□□ -1.23
SPS100	YHR139C	SPO24	Q3E752	67 aa		7.34	□□□□□ -1.23
SPS100	YHR139C	OCH1	P31755	480 aa		7.33	□□□□□ -1.24
SPS100	YHR139C	FMT1	P32785	401 aa		7.33	□□□□□ -1.24
SPS100	YHR139C	EDS1	P38073	919 aa		7.33	□□□□□ -1.24
SPS100	YHR139C	SWD3	P38123	315 aa		7.33	□□□□□ -1.24
SPS100	YHR139C	YHL044W	P38727	235 aa		7.33	□□□□□ -1.24
SPS100	YHR139C	SGN1	P40561	250 aa	Known RBP RIP-Chip data	7.33	□□□□□ -1.24	not detected
SPS100	YHR139C	HNT2	P49775	206 aa		7.33	□□□□□ -1.24
SPS100	YHR139C	ALG9	P53868	555 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
SPS100	YHR139C	CAC2	Q04199	468 aa		7.33	□□□□□ -1.24
SPS100	YHR139C	LIP2	Q06005	328 aa		7.33	□□□□□ -1.24
SPS100	YHR139C	PET20	Q99373	253 aa		7.33	□□□□□ -1.24
SPS100	YHR139C	URA3	P03962	267 aa		7.32	□□□□□ -1.24
SPS100	YHR139C	RAD52	P06778	471 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24

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