RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612229.4

PTPRT-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 11,285 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-209ENST00000612229 NFIBO00712 420 aa7.33□□□□□ -1.24
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PTPRT-209ENST00000612229 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
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PTPRT-209ENST00000612229 CROCCP3Q8IVE0 287 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 UBN2Q6ZU65 1347 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 ABL1P00519 1130 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 ITGAXP20702 1163 aa7.33□□□□□ -1.24
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PTPRT-209ENST00000612229 MAPKAPK2P49137 400 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 TUBA4AP68366 448 aa7.33□□□□□ -1.24
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PTPRT-209ENST00000612229 MTFR1Q15390 333 aa7.33□□□□□ -1.24
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PTPRT-209ENST00000612229 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 PSMD3O43242 534 aa7.33□□□□□ -1.24
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PTPRT-209ENST00000612229 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
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PTPRT-209ENST00000612229 FAR2Q96K12 515 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
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PTPRT-209ENST00000612229 CLCA2Q9UQC9 943 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 PDZK1P1A8MUH7 402 aa7.33□□□□□ -1.24
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PTPRT-209ENST00000612229 CYP4A11Q02928 519 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 PKN3Q6P5Z2 889 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 TBCKQ8TEA7 893 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 STOML2Q9UJZ1 356 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 SNX12Q9UMY4 172 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 ZHX2Q9Y6X8 837 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 SLC26A4O43511 780 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 GCP02774 474 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
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PTPRT-209ENST00000612229 LBRQ14739 615 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 RABGAP1LQ5R372 815 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 ARHGAP17Q68EM7 881 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 PADI6Q6TGC4 694 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 CCDC80Q76M96 950 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 SDR42E1Q8WUS8 393 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 MNTQ99583 582 aa7.32□□□□□ -1.24
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PTPRT-209ENST00000612229 CCDC166P0CW27 439 aa7.32□□□□□ -1.24
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PTPRT-209ENST00000612229 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 ASAP3Q8TDY4 903 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 ASZ1Q8WWH4 475 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 MICAL3Q7RTP6 2002 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 CFAP99D6REC4 459 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 CHN1P15882 459 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 CHMP1BQ7LBR1 199 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP7.32□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 ERN1O75460 977 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 AP1S1P61966 158 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 TCEAL5Q5H9L2 206 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 ARL8AQ96BM9 186 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 ZWILCHQ9H900 591 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 LRRC53A6NM62 1247 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP7.32□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 CYP4F11Q9HBI6 524 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 ATAD3AQ9NVI7 634 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 CDY2AQ9Y6F7 541 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 CDY1Q9Y6F8 540 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa7.32□□□□□ -1.24
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PTPRT-209ENST00000612229 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 TMC5Q6UXY8 1006 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 STAG2Q8N3U4 1231 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 PHACTR1Q9C0D0 580 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 NPHS2Q9NP85 383 aa7.32□□□□□ -1.24
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