RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567828.1

PPP4C-212, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, humanhuman

TSL 3

Gene PPP4C, Length 742 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4C-212ENST00000567828 FBXW11Q9UKB1 542 aa24.88■■□□□ 1.57
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PPP4C-212ENST00000567828 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
PPP4C-212ENST00000567828 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
PPP4C-212ENST00000567828 NHLH1Q02575 133 aa24.87■■□□□ 1.57
PPP4C-212ENST00000567828 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
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PPP4C-212ENST00000567828 CD300LGQ6UXG3 332 aa24.87■■□□□ 1.57
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PPP4C-212ENST00000567828 PRSS33Q8NF86 280 aa24.87■■□□□ 1.57
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PPP4C-212ENST00000567828 I3L4J1 428 aa24.86■■□□□ 1.57
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PPP4C-212ENST00000567828 SLC26A4O43511 780 aa24.86■■□□□ 1.57
PPP4C-212ENST00000567828 ZMYND10O75800 440 aa24.86■■□□□ 1.57
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PPP4C-212ENST00000567828 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP24.86■■□□□ 1.57
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PPP4C-212ENST00000567828 STAMQ92783 540 aa24.86■■□□□ 1.57
PPP4C-212ENST00000567828 REEP2Q9BRK0 252 aa24.86■■□□□ 1.57
PPP4C-212ENST00000567828 PRKD2Q9BZL6 878 aa24.86■■□□□ 1.57
PPP4C-212ENST00000567828 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa24.86■■□□□ 1.57
PPP4C-212ENST00000567828 TOM1L1O75674 476 aa24.85■■□□□ 1.57
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PPP4C-212ENST00000567828 KCNK12Q9HB15 430 aa24.85■■□□□ 1.57
PPP4C-212ENST00000567828 SLC38A7Q9NVC3 462 aa24.85■■□□□ 1.57
PPP4C-212ENST00000567828 CNTN3Q9P232 1028 aa24.85■■□□□ 1.57
PPP4C-212ENST00000567828 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
PPP4C-212ENST00000567828 KCNG1Q9UIX4 513 aa24.85■■□□□ 1.57
PPP4C-212ENST00000567828 PODXLO00592 558 aa24.84■■□□□ 1.57
PPP4C-212ENST00000567828 OR1D2P34982 312 aa24.84■■□□□ 1.57
PPP4C-212ENST00000567828 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP24.84■■□□□ 1.57
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PPP4C-212ENST00000567828 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
PPP4C-212ENST00000567828 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
PPP4C-212ENST00000567828 HAPLN2Q9GZV7 340 aa24.84■■□□□ 1.57
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PPP4C-212ENST00000567828 ODF2LQ9ULJ1 636 aa24.84■■□□□ 1.57
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PPP4C-212ENST00000567828 LIN9Q5TKA1 542 aa24.83■■□□□ 1.57
PPP4C-212ENST00000567828 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.57
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PPP4C-212ENST00000567828 CLIC4Q9Y696 253 aa24.83■■□□□ 1.57
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PPP4C-212ENST00000567828 TDGQ13569 410 aa24.82■■□□□ 1.56
PPP4C-212ENST00000567828 SLC10A6Q3KNW5 377 aa24.82■■□□□ 1.56
PPP4C-212ENST00000567828 PPM1LQ5SGD2 360 aa24.82■■□□□ 1.56
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PPP4C-212ENST00000567828 CLDN3O15551 220 aa24.81■■□□□ 1.56
PPP4C-212ENST00000567828 FAM13AO94988 1023 aa24.81■■□□□ 1.56
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PPP4C-212ENST00000567828 FAM173BQ6P4H8 233 aa24.81■■□□□ 1.56
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PPP4C-212ENST00000567828 SLC7A14Q8TBB6 771 aa24.81■■□□□ 1.56
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PPP4C-212ENST00000567828 CCL16O15467 120 aa24.8■■□□□ 1.56
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PPP4C-212ENST00000567828 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
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PPP4C-212ENST00000567828 NTHL1P78549 312 aa24.8■■□□□ 1.56
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PPP4C-212ENST00000567828 PTPAQ15257 358 aa24.8■■□□□ 1.56
PPP4C-212ENST00000567828 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
PPP4C-212ENST00000567828 ANKS3Q6ZW76 656 aa24.8■■□□□ 1.56
PPP4C-212ENST00000567828 USP49Q70CQ1 688 aa24.8■■□□□ 1.56
PPP4C-212ENST00000567828 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
PPP4C-212ENST00000567828 TMEM130Q8N3G9 435 aa24.8■■□□□ 1.56
PPP4C-212ENST00000567828 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
PPP4C-212ENST00000567828 EPSTI1Q96J88 318 aa24.8■■□□□ 1.56
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