RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546248.5

TRDN-205, Transcript of triadin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRDN, Length 1,179 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDN-205ENST00000546248 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 NIM1KQ8IY84 436 aa6.28□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 CNBD1Q8NA66 436 aa6.28□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 MIGA1Q8NAN2 632 aa6.28□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 ARRDC4Q8NCT1 418 aa6.28□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP6.28□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 STAG1Q8WVM7 1258 aa6.28□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 NINJ1Q92982 152 aa6.28□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 YIPF4Q9BSR8 244 aa6.28□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 NAPBQ9H115 298 aa6.28□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 GRPEL1Q9HAV7 217 aa6.28□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 CLDND1Q9NY35 253 aa6.28□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 RAI14Q9P0K7 980 aa6.28□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 ABCF2Q9UG63 623 aa6.28□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa6.28□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 CARMIL3Q8ND23 1372 aa6.28□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 NEDD4P46934 1319 aa6.27□□□□□ -1.41
TRDN-205ENST00000546248 NHSQ6T4R5 1651 aa6.27□□□□□ -1.41
TRDN-205ENST00000546248 B4E1Z4 1266 aa6.27□□□□□ -1.41
TRDN-205ENST00000546248 FIBPO43427 364 aa6.27□□□□□ -1.41
TRDN-205ENST00000546248 LAMTOR5O43504 91 aa6.27□□□□□ -1.41
TRDN-205ENST00000546248 BBOX1O75936 387 aa6.27□□□□□ -1.41
TRDN-205ENST00000546248 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
TRDN-205ENST00000546248 FSHBP01225 129 aa6.27□□□□□ -1.41
TRDN-205ENST00000546248 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa6.27□□□□□ -1.41
TRDN-205ENST00000546248 GTF2A2P52657 109 aa6.27□□□□□ -1.41
TRDN-205ENST00000546248 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
TRDN-205ENST00000546248 UBE2HP62256 183 aa6.27□□□□□ -1.41
TRDN-205ENST00000546248 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
TRDN-205ENST00000546248 MECOMQ03112 1051 aa6.27□□□□□ -1.41
TRDN-205ENST00000546248 TRDNQ13061 729 aa6.27□□□□□ -1.41
TRDN-205ENST00000546248 AKNAD1Q5T1N1 836 aa6.27□□□□□ -1.41
TRDN-205ENST00000546248 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
TRDN-205ENST00000546248 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa6.27□□□□□ -1.41
TRDN-205ENST00000546248 LRSAM1Q6UWE0 723 aa6.27□□□□□ -1.41
TRDN-205ENST00000546248 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa6.27□□□□□ -1.41
TRDN-205ENST00000546248 FAM184AQ8NB25 1140 aa6.27□□□□□ -1.41
TRDN-205ENST00000546248 SLC16A11Q8NCK7 471 aa6.27□□□□□ -1.41
TRDN-205ENST00000546248 SDR42E1Q8WUS8 393 aa6.27□□□□□ -1.41
TRDN-205ENST00000546248 CHMP4CQ96CF2 233 aa6.27□□□□□ -1.41
TRDN-205ENST00000546248 TMEM169Q96HH4 297 aa6.27□□□□□ -1.41
TRDN-205ENST00000546248 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
TRDN-205ENST00000546248 CRAMP1Q96RY5 1269 aa6.27□□□□□ -1.41
TRDN-205ENST00000546248 KCNJ15Q99712 375 aa6.27□□□□□ -1.41
TRDN-205ENST00000546248 ALG1Q9BT22 464 aa6.27□□□□□ -1.41
TRDN-205ENST00000546248 JAM3Q9BX67 310 aa6.27□□□□□ -1.41
TRDN-205ENST00000546248 PANK2Q9BZ23 570 aa6.27□□□□□ -1.41
TRDN-205ENST00000546248 LY9Q9HBG7 655 aa6.27□□□□□ -1.41
TRDN-205ENST00000546248 DTLQ9NZJ0 730 aa6.27□□□□□ -1.41
TRDN-205ENST00000546248 ANAPC4Q9UJX5 808 aa6.27□□□□□ -1.41
TRDN-205ENST00000546248 WASF3Q9UPY6 502 aa6.27□□□□□ -1.41
TRDN-205ENST00000546248 PLAAQ9Y263 795 aa6.27□□□□□ -1.41
TRDN-205ENST00000546248 SPEF2Q9C093 1822 aa6.27□□□□□ -1.41
TRDN-205ENST00000546248 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa6.26□□□□□ -1.41
TRDN-205ENST00000546248 TCRBV5S2A0A599 114 aa6.26□□□□□ -1.41
TRDN-205ENST00000546248 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa6.26□□□□□ -1.41
TRDN-205ENST00000546248 SOD2P04179 222 aa6.26□□□□□ -1.41
TRDN-205ENST00000546248 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
TRDN-205ENST00000546248 PRDX5P30044 214 aa6.26□□□□□ -1.41
TRDN-205ENST00000546248 LIFRP42702 1097 aa6.26□□□□□ -1.41
TRDN-205ENST00000546248 TDO2P48775 406 aa6.26□□□□□ -1.41
TRDN-205ENST00000546248 KRT85P78386 507 aa6.26□□□□□ -1.41
TRDN-205ENST00000546248 ST5P78524 1137 aa6.26□□□□□ -1.41
TRDN-205ENST00000546248 PPARAQ07869 468 aa6.26□□□□□ -1.41
TRDN-205ENST00000546248 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
TRDN-205ENST00000546248 ICAM4Q14773 271 aa6.26□□□□□ -1.41
TRDN-205ENST00000546248 KIZQ2M2Z5 673 aa6.26□□□□□ -1.41
TRDN-205ENST00000546248 CTR9Q6PD62 1173 aa6.26□□□□□ -1.41
TRDN-205ENST00000546248 TEPPQ6URK8 271 aa6.26□□□□□ -1.41
TRDN-205ENST00000546248 SPRED1Q7Z699 444 aa6.26□□□□□ -1.41
TRDN-205ENST00000546248 SGMS1Q86VZ5 419 aa6.26□□□□□ -1.41
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TRDN-205ENST00000546248 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
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TRDN-205ENST00000546248 NACAP1Q9BZK3 213 aa6.26□□□□□ -1.41
TRDN-205ENST00000546248 KRT23Q9C075 422 aa6.26□□□□□ -1.41
TRDN-205ENST00000546248 CDIP1Q9H305 208 aa6.26□□□□□ -1.41
TRDN-205ENST00000546248 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
TRDN-205ENST00000546248 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
TRDN-205ENST00000546248 RCOR1Q9UKL0 485 aa6.26□□□□□ -1.41
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TRDN-205ENST00000546248 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
TRDN-205ENST00000546248 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
TRDN-205ENST00000546248 XDHP47989 1333 aa6.25□□□□□ -1.41
TRDN-205ENST00000546248 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
TRDN-205ENST00000546248 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa6.25□□□□□ -1.41
TRDN-205ENST00000546248 SYCE3A1L190 88 aa6.25□□□□□ -1.41
TRDN-205ENST00000546248 GOLGA8BA8MQT2 603 aa6.25□□□□□ -1.41
TRDN-205ENST00000546248 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
TRDN-205ENST00000546248 HGSO14964 777 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
TRDN-205ENST00000546248 NPHP1O15259 732 aa6.25□□□□□ -1.41
TRDN-205ENST00000546248 TADA3O75528 432 aa6.25□□□□□ -1.41
TRDN-205ENST00000546248 LRG1P02750 347 aa6.25□□□□□ -1.41
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