RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539921.5

SNHG1-211, Transcript of small nucleolar RNA host gene 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SNHG1, Length 1,071 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG1-211ENST00000539921 TFAP2AP05549 437 aa6.5□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 HOXB7P09629 217 aa6.5□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 T-ENOLP0DO92 83 aa6.5□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 NAGAP17050 411 aa6.5□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 VCLP18206 1134 aa6.5□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 CD9P21926 228 aa6.5□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 PRKACBP22694 351 aa6.5□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 IL4RP24394 825 aa6.5□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 PRDX6P30041 224 aa6.5□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 SLC1A1P43005 524 aa6.5□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 KIF11P52732 1056 aa6.5□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 KRT76Q01546 638 aa6.5□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 RASSF7Q02833 373 aa6.5□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 MECOMQ03112 1051 aa6.5□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 UBXN1Q04323 297 aa6.5□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 CDK18Q07002 472 aa6.5□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 NAB2Q15742 525 aa6.5□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 ANO4Q32M45 955 aa6.5□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 CDONQ4KMG0 1287 aa6.5□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 DNAL1Q4LDG9 190 aa6.5□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 ACSBG2Q5FVE4 666 aa6.5□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 AKAP4Q5JQC9 854 aa6.5□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 SLC27A3Q5K4L6 730 aa6.5□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 CFAP70Q5T0N1 1121 aa6.5□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 AGAP9Q5VTM2 703 aa6.5□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa6.5□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 UGT2A3Q6UWM9 527 aa6.5□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 CCDC81Q6ZN84 652 aa6.5□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 CYB5R4Q7L1T6 521 aa6.5□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 MIGA2Q7L4E1 593 aa6.5□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 MAEAQ7L5Y9 396 aa6.5□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 WAPLQ7Z5K2 1190 aa6.5□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 ZNF410Q86VK4 478 aa6.5□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 ZNF34Q8IZ26 560 aa6.5□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP6.5□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 CEP70Q8NHQ1 597 aa6.5□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa6.5□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 ERP27Q96DN0 273 aa6.5□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 EGLN2Q96KS0 407 aa6.5□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 YME1L1Q96TA2 773 aa6.5□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 MYD88Q99836 296 aa6.5□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 PHF20Q9BVI0 1012 aa6.5□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 MYLK2Q9H1R3 596 aa6.5□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa6.5□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 RIC8AQ9NPQ8 531 aa6.5□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 PAG1Q9NWQ8 432 aa6.5□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 SENP1Q9P0U3 644 aa6.5□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 RAB26Q9ULW5 256 aa6.5□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 MTMR7Q9Y216 660 aa6.5□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa6.5□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 LAMA4Q16363 1823 aa6.5□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 C4AP0C0L4 1744 aa6.5□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 C4BP0C0L5 1744 aa6.5□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 RGPD1P0DJD0 1748 aa6.5□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 MAP3K19Q56UN5 1328 aa6.5□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 DIP2BQ9P265 1576 aa6.49□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 KIF13AQ9H1H9 1805 aa6.49□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa6.49□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa6.49□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 FAM172BPA6NC97 362 aa6.49□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 GOLGA8OA6NCC3 632 aa6.49□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 TRIM64BA6NI03 449 aa6.49□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 DCDC2CA8MYV0 355 aa6.49□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 GOLGA8NF8WBI6 632 aa6.49□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 H0YJX3 145 aa6.49□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 GOLGA8RI6L899 631 aa6.49□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 XPOTO43592 962 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 SCO2O43819 266 aa6.49□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 ZPR1O75312 459 aa6.49□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 CIB2O75838 187 aa6.49□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 STAMBPO95630 424 aa6.49□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 KRT75O95678 551 aa6.49□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 CRYZL1O95825 349 aa6.49□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 CYP21A2P08686 494 aa6.49□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 CD48P09326 243 aa6.49□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 ZCCHC18P0CG32 403 aa6.49□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 P4HA1P13674 534 aa6.49□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 ETS2P15036 469 aa6.49□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 ANPEPP15144 967 aa6.49□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 ZNF23P17027 643 aa6.49□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 EPHB2P29323 1055 aa6.49□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 SLC5A2P31639 672 aa6.49□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 STAT2P52630 851 aa6.49□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 RCAN1P53805 252 aa6.49□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 NPEPPSP55786 919 aa6.49□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 ACTR3P61158 418 aa6.49□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 COG7P83436 770 aa6.49□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 IL9RQ01113 521 aa6.49□□□□□ -1.37
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