RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484281.1

RAB18-205, Transcript of RAB18, member RAS oncogene family, human

TSL 3

Gene RAB18, Length 355 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RAB18-205	ENST00000484281	PCSK9	Q8NBP7	692 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281	RGS22	Q8NE09	1264 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281	NELL1	Q92832	810 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281	FCRL2	Q96LA5	508 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281	ZNF830	Q96NB3	372 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281	NEK1	Q96PY6	1258 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281	TINF2	Q9BSI4	451 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281	TRAIP	Q9BWF2	469 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281	ANKRD2	Q9GZV1	360 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281	POMK	Q9H5K3	350 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281	ANKMY1	Q9P2S6	941 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281	SUSD2	Q9UGT4	822 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281	NRBP1	Q9UHY1	535 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281	MSRB2	Q9Y3D2	182 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281	NEUROG3	Q9Y4Z2	214 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281	INSL6	Q9Y581	213 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281	PCDHGA2	Q9Y5H1	932 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281	USP9Y	O00507	2555 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281	RGS13	O14921	159 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281	TBC1D4	O60343	1298 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281	DUSP11	O75319	330 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281	PCCA	P05165	728 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281	ERCC3	P19447	782 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281	RFC2	P35250	354 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281	LIMS1	P48059	325 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281	IRX6	P78412	446 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281	CSTF1	Q05048	431 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281	SCAP	Q12770	1279 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281	CHAF1A	Q13111	956 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281	AXDND1	Q5T1B0	1012 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281	TMEM63B	Q5T3F8	832 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281	STPG1	Q5TH74	334 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281	RALGAPA1	Q6GYQ0	2036 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281	LBX2	Q6XYB7	198 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281	BNC2	Q6ZN30	1099 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281	MICAL3	Q7RTP6	2002 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281	TMC3	Q7Z5M5	1100 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281	MTERF4	Q7Z6M4	381 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281	LSR	Q86X29	649 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281	NUP43	Q8NFH3	380 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281	PLBD2	Q8NHP8	589 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281	ATRIP	Q8WXE1	791 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281	POLR3GL	Q9BT43	218 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281	ZNF768	Q9H5H4	540 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281	TBC1D17	Q9HA65	648 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281	DDX4	Q9NQI0	724 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281	ACSL6	Q9UKU0	697 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281	LRRK2	Q5S007	2527 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281	MYH3	P11055	1940 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281	KIAA1217	Q5T5P2	1943 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281	ZNFX1	Q9P2E3	1918 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281	CENPE	Q02224	2701 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281		A0A1W2PQ27	194 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281		A0A1W2PQ64	194 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281		A0A1W2PQC6	194 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281		A0A1W2PQD8	194 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281	FAM221A	A4D161	298 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281	PER2	O15055	1255 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281	NBN	O60934	754 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281	LRP3	O75074	770 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281	PRPF40A	O75400	957 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281	HTR3B	O95264	441 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281	SNAI1	O95863	264 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281	FSHB	P01225	129 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281	MMP1	P03956	469 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281	TNFRSF1A	P19438	455 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281	PTMS	P20962	102 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281	CTNNB1	P35222	781 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281	MAPKAPK2	P49137	400 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281	DMTN	Q08495	405 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281	CAMK2G	Q13555	558 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281	BBS9	Q3SYG4	887 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281	LAIR1	Q6GTX8	287 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281	SYCE2	Q6PIF2	218 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281	RPTN	Q6XPR3	784 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281	PHC3	Q8NDX5	983 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281	GATAD2B	Q8WXI9	593 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281	EAF1	Q96JC9	268 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281	SAMD11	Q96NU1	681 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281	CSTF2T	Q9H0L4	616 aa	Known RBP eCLIP	4.92	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281	TMOD4	Q9NZQ9	345 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281	FBXL21	Q9UKT6	434 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281	CA14	Q9ULX7	337 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281	DUSP12	Q9UNI6	340 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281	GPR55	Q9Y2T6	319 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281	LAS1L	Q9Y4W2	734 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281	MROH5	Q6ZUA9	1318 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281	NIPBL	Q6KC79	2804 aa	eCLIP	4.91	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281	C11orf97	A0A1B0GVM6	126 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281	C5orf67	F2Z3F1	127 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281	STRN	O43815	780 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281	CLSTN1	O94985	981 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281	KIF20A	O95235	890 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281	RET	P07949	1114 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281	KRT10	P13645	584 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281	IGFBP6	P24592	240 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281	TERF1	P54274	439 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281	ADAM17	P78536	824 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281	FOXO4	P98177	505 aa		4.91	□□□□□ -1.62

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