RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416021.5

SH3BP4-204, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 593 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-204ENST00000416021 CNPP09543 421 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
SH3BP4-204ENST00000416021 SLFN14P0C7P3 912 aa23.01■■□□□ 1.27
SH3BP4-204ENST00000416021 SRGAP2BP0DMP2 458 aa23.01■■□□□ 1.27
SH3BP4-204ENST00000416021 CXCL8P10145 99 aa23.01■■□□□ 1.27
SH3BP4-204ENST00000416021 IL9P15248 144 aa23.01■■□□□ 1.27
SH3BP4-204ENST00000416021 PFKFB1P16118 471 aa23.01■■□□□ 1.27
SH3BP4-204ENST00000416021 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
SH3BP4-204ENST00000416021 KLRC2P26717 231 aa23.01■■□□□ 1.27
SH3BP4-204ENST00000416021 AFMP43652 599 aa23.01■■□□□ 1.27
SH3BP4-204ENST00000416021 GLUD2P49448 558 aa23.01■■□□□ 1.27
SH3BP4-204ENST00000416021 DSG1Q02413 1049 aa23.01■■□□□ 1.27
SH3BP4-204ENST00000416021 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
SH3BP4-204ENST00000416021 ALCAMQ13740 583 aa23.01■■□□□ 1.27
SH3BP4-204ENST00000416021 UPP1Q16831 310 aa23.01■■□□□ 1.27
SH3BP4-204ENST00000416021 TPRNQ4KMQ1 711 aa23.01■■□□□ 1.27
SH3BP4-204ENST00000416021 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa23.01■■□□□ 1.27
SH3BP4-204ENST00000416021 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
SH3BP4-204ENST00000416021 B3GALT6Q96L58 329 aa23.01■■□□□ 1.27
SH3BP4-204ENST00000416021 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
SH3BP4-204ENST00000416021 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa23.01■■□□□ 1.27
SH3BP4-204ENST00000416021 BLZF1Q9H2G9 400 aa23.01■■□□□ 1.27
SH3BP4-204ENST00000416021 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
SH3BP4-204ENST00000416021 GDPD2Q9HCC8 539 aa23.01■■□□□ 1.27
SH3BP4-204ENST00000416021 FAM50BQ9Y247 325 aa23.01■■□□□ 1.27
SH3BP4-204ENST00000416021 TTC26A0AVF1 554 aa23■■□□□ 1.27
SH3BP4-204ENST00000416021 LACTBL1A8MY62 500 aa23■■□□□ 1.27
SH3BP4-204ENST00000416021 MBTPS2O43462 519 aa23■■□□□ 1.27
SH3BP4-204ENST00000416021 CASP1P29466 404 aa23■■□□□ 1.27
SH3BP4-204ENST00000416021 POSTNQ15063 836 aa23■■□□□ 1.27
SH3BP4-204ENST00000416021 ANKRD54Q6NXT1 300 aa23■■□□□ 1.27
SH3BP4-204ENST00000416021 PPFIBP1Q86W92 1011 aa23■■□□□ 1.27
SH3BP4-204ENST00000416021 SLC22A17Q8WUG5 538 aa23■■□□□ 1.27
SH3BP4-204ENST00000416021 CASP10Q92851 521 aa23■■□□□ 1.27
SH3BP4-204ENST00000416021 HPS3Q969F9 1004 aa23■■□□□ 1.27
SH3BP4-204ENST00000416021 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
SH3BP4-204ENST00000416021 RXFP1Q9HBX9 757 aa23■■□□□ 1.27
SH3BP4-204ENST00000416021 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
SH3BP4-204ENST00000416021 HPSEQ9Y251 543 aa23■■□□□ 1.27
SH3BP4-204ENST00000416021 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP23■■□□□ 1.27
SH3BP4-204ENST00000416021 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
SH3BP4-204ENST00000416021 ADSSP30520 456 aa22.99■■□□□ 1.27
SH3BP4-204ENST00000416021 SPAG1Q07617 926 aa22.99■■□□□ 1.27
SH3BP4-204ENST00000416021 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
SH3BP4-204ENST00000416021 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
SH3BP4-204ENST00000416021 FAM171A1Q5VUB5 890 aa22.99■■□□□ 1.27
SH3BP4-204ENST00000416021 CD300LGQ6UXG3 332 aa22.99■■□□□ 1.27
SH3BP4-204ENST00000416021 CEP57Q86XR8 500 aa22.99■■□□□ 1.27
SH3BP4-204ENST00000416021 SYCP3Q8IZU3 236 aa22.99■■□□□ 1.27
SH3BP4-204ENST00000416021 POMGNT1Q8WZA1 660 aa22.99■■□□□ 1.27
SH3BP4-204ENST00000416021 PAGE5Q96GU1 130 aa22.99■■□□□ 1.27
SH3BP4-204ENST00000416021 USP25Q9UHP3 1055 aa22.99■■□□□ 1.27
SH3BP4-204ENST00000416021 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
SH3BP4-204ENST00000416021 MYH15Q9Y2K3 1946 aa22.99■■□□□ 1.27
SH3BP4-204ENST00000416021 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa22.98■■□□□ 1.27
SH3BP4-204ENST00000416021 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
SH3BP4-204ENST00000416021 ADRB2P07550 413 aa22.98■■□□□ 1.27
SH3BP4-204ENST00000416021 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
SH3BP4-204ENST00000416021 RPL9P32969 192 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
SH3BP4-204ENST00000416021 ACOT2P49753 483 aa22.98■■□□□ 1.27
SH3BP4-204ENST00000416021 PPP2R3AQ06190 1150 aa22.98■■□□□ 1.27
SH3BP4-204ENST00000416021 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
SH3BP4-204ENST00000416021 CUL4BQ13620 913 aa22.98■■□□□ 1.27
SH3BP4-204ENST00000416021 SYCE2Q6PIF2 218 aa22.98■■□□□ 1.27
SH3BP4-204ENST00000416021 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa22.98■■□□□ 1.27
SH3BP4-204ENST00000416021 UNC13DQ70J99 1090 aa22.98■■□□□ 1.27
SH3BP4-204ENST00000416021 GPR65Q8IYL9 337 aa22.98■■□□□ 1.27
SH3BP4-204ENST00000416021 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa22.98■■□□□ 1.27
SH3BP4-204ENST00000416021 SMRP1Q8NCR6 262 aa22.98■■□□□ 1.27
SH3BP4-204ENST00000416021 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
SH3BP4-204ENST00000416021 FAM212AQ96EL1 285 aa22.98■■□□□ 1.27
SH3BP4-204ENST00000416021 KIF12Q96FN5 646 aa22.98■■□□□ 1.27
SH3BP4-204ENST00000416021 TTPALQ9BTX7 342 aa22.98■■□□□ 1.27
SH3BP4-204ENST00000416021 S1PR5Q9H228 398 aa22.98■■□□□ 1.27
SH3BP4-204ENST00000416021 TMEM206Q9H813 350 aa22.98■■□□□ 1.27
SH3BP4-204ENST00000416021 MYH11P35749 1972 aa22.98■■□□□ 1.27
SH3BP4-204ENST00000416021 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa22.97■■□□□ 1.27
SH3BP4-204ENST00000416021 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa22.97■■□□□ 1.27
SH3BP4-204ENST00000416021 A0A1W2PQ27 194 aa22.97■■□□□ 1.27
SH3BP4-204ENST00000416021 A0A1W2PQ64 194 aa22.97■■□□□ 1.27
SH3BP4-204ENST00000416021 A0A1W2PQD8 194 aa22.97■■□□□ 1.27
SH3BP4-204ENST00000416021 PODXLO00592 558 aa22.97■■□□□ 1.27
SH3BP4-204ENST00000416021 TEX28O15482 410 aa22.97■■□□□ 1.27
SH3BP4-204ENST00000416021 EPCAMP16422 314 aa22.97■■□□□ 1.27
SH3BP4-204ENST00000416021 SYKP43405 635 aa22.97■■□□□ 1.27
SH3BP4-204ENST00000416021 CLCN4P51793 760 aa22.97■■□□□ 1.27
SH3BP4-204ENST00000416021 NDUFA8P51970 172 aa22.97■■□□□ 1.27
SH3BP4-204ENST00000416021 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
SH3BP4-204ENST00000416021 ZBTB6Q15916 424 aa22.97■■□□□ 1.27
SH3BP4-204ENST00000416021 CD302Q8IX05 232 aa22.97■■□□□ 1.27
SH3BP4-204ENST00000416021 GLIS3Q8NEA6 775 aa22.97■■□□□ 1.27
SH3BP4-204ENST00000416021 TSPAN18Q96SJ8 248 aa22.97■■□□□ 1.27
SH3BP4-204ENST00000416021 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa22.97■■□□□ 1.27
SH3BP4-204ENST00000416021 BRWD1Q9NSI6 2320 aa22.97■■□□□ 1.27
SH3BP4-204ENST00000416021 TRAPPC3O43617 180 aa22.96■■□□□ 1.27
SH3BP4-204ENST00000416021 RTP2Q5QGT7 225 aa22.96■■□□□ 1.27
SH3BP4-204ENST00000416021 FSIP1Q8NA03 581 aa22.96■■□□□ 1.27
SH3BP4-204ENST00000416021 C3orf58Q8NDZ4 430 aa22.96■■□□□ 1.27
SH3BP4-204ENST00000416021 APOL5Q9BWW9 433 aa22.96■■□□□ 1.27
SH3BP4-204ENST00000416021 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP22.96■■□□□ 1.27
SH3BP4-204ENST00000416021 FNIP2Q9P278 1114 aa22.96■■□□□ 1.27
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