RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298838.10

PACSIN3-201, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PACSIN3, Length 1,843 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-201ENST00000298838 HES2Q9Y543 173 aa22.39■■□□□ 1.17
PACSIN3-201ENST00000298838 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
PACSIN3-201ENST00000298838 LRRC53A6NM62 1247 aa22.38■■□□□ 1.17
PACSIN3-201ENST00000298838 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
PACSIN3-201ENST00000298838 PHACTR2O75167 634 aa22.38■■□□□ 1.17
PACSIN3-201ENST00000298838 TNNC2P02585 160 aa22.38■■□□□ 1.17
PACSIN3-201ENST00000298838 CAPN2P17655 700 aa22.38■■□□□ 1.17
PACSIN3-201ENST00000298838 C1orf53Q5VUE5 145 aa22.38■■□□□ 1.17
PACSIN3-201ENST00000298838 SEMA4DQ92854 862 aa22.38■■□□□ 1.17
PACSIN3-201ENST00000298838 SPAG5Q96R06 1193 aa22.38■■□□□ 1.17
PACSIN3-201ENST00000298838 OSBPL7Q9BZF2 842 aa22.38■■□□□ 1.17
PACSIN3-201ENST00000298838 IPPQ9Y573 584 aa22.38■■□□□ 1.17
PACSIN3-201ENST00000298838 DCDC2CA8MYV0 355 aa22.38■■□□□ 1.17
PACSIN3-201ENST00000298838 PITPNM1O00562 1244 aa22.38■■□□□ 1.17
PACSIN3-201ENST00000298838 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP22.38■■□□□ 1.17
PACSIN3-201ENST00000298838 RAPGEF1Q13905 1077 aa22.38■■□□□ 1.17
PACSIN3-201ENST00000298838 JADE1Q6IE81 842 aa22.38■■□□□ 1.17
PACSIN3-201ENST00000298838 PDXDC1Q6P996 788 aa22.38■■□□□ 1.17
PACSIN3-201ENST00000298838 ZSCAN30Q86W11 494 aa22.38■■□□□ 1.17
PACSIN3-201ENST00000298838 NT5DC4Q86YG4 428 aa22.38■■□□□ 1.17
PACSIN3-201ENST00000298838 TMEM139Q8IV31 216 aa22.38■■□□□ 1.17
PACSIN3-201ENST00000298838 SNX27Q96L92 541 aa22.38■■□□□ 1.17
PACSIN3-201ENST00000298838 TOX2Q96NM4 488 aa22.38■■□□□ 1.17
PACSIN3-201ENST00000298838 PRDM10Q9NQV6 1147 aa22.38■■□□□ 1.17
PACSIN3-201ENST00000298838 PLAGL2Q9UPG8 496 aa22.38■■□□□ 1.17
PACSIN3-201ENST00000298838 LRRN2O75325 713 aa22.37■■□□□ 1.17
PACSIN3-201ENST00000298838 RECQL4O94761 1208 aa22.37■■□□□ 1.17
PACSIN3-201ENST00000298838 HLA-DRAP01903 254 aa22.37■■□□□ 1.17
PACSIN3-201ENST00000298838 NFICP08651 508 aa22.37■■□□□ 1.17
PACSIN3-201ENST00000298838 FECHP22830 423 aa22.37■■□□□ 1.17
PACSIN3-201ENST00000298838 IQCEQ6IPM2 695 aa22.37■■□□□ 1.17
PACSIN3-201ENST00000298838 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa22.37■■□□□ 1.17
PACSIN3-201ENST00000298838 GJB7Q6PEY0 223 aa22.37■■□□□ 1.17
PACSIN3-201ENST00000298838 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa22.37■■□□□ 1.17
PACSIN3-201ENST00000298838 NT5C1BQ96P26 610 aa22.37■■□□□ 1.17
PACSIN3-201ENST00000298838 APOL6Q9BWW8 343 aa22.37■■□□□ 1.17
PACSIN3-201ENST00000298838 FAM105AQ9NUU6 356 aa22.37■■□□□ 1.17
PACSIN3-201ENST00000298838 MYO6Q9UM54 1294 aa22.37■■□□□ 1.17
PACSIN3-201ENST00000298838 C2CD2Q9Y426 696 aa22.37■■□□□ 1.17
PACSIN3-201ENST00000298838 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa22.37■■□□□ 1.17
PACSIN3-201ENST00000298838 MBTPS1Q14703 1052 aa22.36■■□□□ 1.17
PACSIN3-201ENST00000298838 TMEM132DQ14C87 1099 aa22.36■■□□□ 1.17
PACSIN3-201ENST00000298838 TRIM60Q495X7 471 aa22.36■■□□□ 1.17
PACSIN3-201ENST00000298838 HACE1Q8IYU2 909 aa22.36■■□□□ 1.17
PACSIN3-201ENST00000298838 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
PACSIN3-201ENST00000298838 DNAJC12Q9UKB3 198 aa22.36■■□□□ 1.17
PACSIN3-201ENST00000298838 TRIP11Q15643 1979 aa22.36■■□□□ 1.17
PACSIN3-201ENST00000298838 ARHGAP6O43182 974 aa22.36■■□□□ 1.17
PACSIN3-201ENST00000298838 VNN1O95497 513 aa22.36■■□□□ 1.17
PACSIN3-201ENST00000298838 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
PACSIN3-201ENST00000298838 NCOA4Q13772 614 aa22.36■■□□□ 1.17
PACSIN3-201ENST00000298838 MEA1Q16626 185 aa22.36■■□□□ 1.17
PACSIN3-201ENST00000298838 WDR44Q5JSH3 913 aa22.36■■□□□ 1.17
PACSIN3-201ENST00000298838 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
PACSIN3-201ENST00000298838 TRAIPQ9BWF2 469 aa22.36■■□□□ 1.17
PACSIN3-201ENST00000298838 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
PACSIN3-201ENST00000298838 IMPG2Q9BZV3 1241 aa22.36■■□□□ 1.17
PACSIN3-201ENST00000298838 C11orf49Q9H6J7 331 aa22.36■■□□□ 1.17
PACSIN3-201ENST00000298838 C1orf112Q9NSG2 853 aa22.36■■□□□ 1.17
PACSIN3-201ENST00000298838 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
PACSIN3-201ENST00000298838 TANC1Q9C0D5 1861 aa22.35■■□□□ 1.17
PACSIN3-201ENST00000298838 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa22.35■■□□□ 1.17
PACSIN3-201ENST00000298838 AKAP5P24588 427 aa22.35■■□□□ 1.17
PACSIN3-201ENST00000298838 RAB27AP51159 221 aa22.35■■□□□ 1.17
PACSIN3-201ENST00000298838 TLE2Q04725 743 aa22.35■■□□□ 1.17
PACSIN3-201ENST00000298838 SFMBT2Q5VUG0 894 aa22.35■■□□□ 1.17
PACSIN3-201ENST00000298838 CYP26C1Q6V0L0 522 aa22.35■■□□□ 1.17
PACSIN3-201ENST00000298838 TMTC1Q8IUR5 882 aa22.35■■□□□ 1.17
PACSIN3-201ENST00000298838 STK33Q9BYT3 514 aa22.35■■□□□ 1.17
PACSIN3-201ENST00000298838 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
PACSIN3-201ENST00000298838 CNTN3Q9P232 1028 aa22.35■■□□□ 1.17
PACSIN3-201ENST00000298838 PARP2Q9UGN5 583 aa22.35■■□□□ 1.17
PACSIN3-201ENST00000298838 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
PACSIN3-201ENST00000298838 DERAQ9Y315 318 aa22.35■■□□□ 1.17
PACSIN3-201ENST00000298838 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
PACSIN3-201ENST00000298838 JAM2P57087 298 aa22.34■■□□□ 1.17
PACSIN3-201ENST00000298838 TRPC3Q13507 836 aa22.34■■□□□ 1.17
PACSIN3-201ENST00000298838 WDR59Q6PJI9 974 aa22.34■■□□□ 1.17
PACSIN3-201ENST00000298838 ARHGEF19Q8IW93 802 aa22.34■■□□□ 1.17
PACSIN3-201ENST00000298838 PPM1KQ8N3J5 372 aa22.34■■□□□ 1.17
PACSIN3-201ENST00000298838 KIF12Q96FN5 646 aa22.34■■□□□ 1.17
PACSIN3-201ENST00000298838 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
PACSIN3-201ENST00000298838 PI4K2AQ9BTU6 479 aa22.34■■□□□ 1.17
PACSIN3-201ENST00000298838 MCOLN1Q9GZU1 580 aa22.34■■□□□ 1.17
PACSIN3-201ENST00000298838 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP22.34■■□□□ 1.172e-6■■■■■ 96.1
PACSIN3-201ENST00000298838 PYCARDQ9ULZ3 195 aa22.34■■□□□ 1.17
PACSIN3-201ENST00000298838 CLSTN1O94985 981 aa22.34■■□□□ 1.17
PACSIN3-201ENST00000298838 MSNP26038 577 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
PACSIN3-201ENST00000298838 FAAP100Q0VG06 881 aa22.34■■□□□ 1.17
PACSIN3-201ENST00000298838 DSC3Q14574 896 aa22.34■■□□□ 1.17
PACSIN3-201ENST00000298838 ALKAL1Q6UXT8 129 aa22.34■■□□□ 1.17
PACSIN3-201ENST00000298838 FMNL3Q8IVF7 1028 aa22.34■■□□□ 1.17
PACSIN3-201ENST00000298838 FAM81BQ96LP2 452 aa22.34■■□□□ 1.17
PACSIN3-201ENST00000298838 RNF39Q9H2S5 420 aa22.34■■□□□ 1.17
PACSIN3-201ENST00000298838 HIPK3Q9H422 1215 aa22.34■■□□□ 1.17
PACSIN3-201ENST00000298838 F8VZ95 297 aa22.33■■□□□ 1.16
PACSIN3-201ENST00000298838 CDK17Q00537 523 aa22.33■■□□□ 1.16
PACSIN3-201ENST00000298838 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.16
PACSIN3-201ENST00000298838 C1orf127Q8N9H9 656 aa22.33■■□□□ 1.16
PACSIN3-201ENST00000298838 TSPAN18Q96SJ8 248 aa22.33■■□□□ 1.16
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