RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261266.9

PTPRB-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 6,110 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-201ENST00000261266 KIF12Q96FN5 646 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRB-201ENST00000261266 FOPNLQ96NB1 174 aa9.53□□□□□ -0.88
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PTPRB-201ENST00000261266 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
PTPRB-201ENST00000261266 SNX24Q9Y343 169 aa9.53□□□□□ -0.88
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PTPRB-201ENST00000261266 H7C4K7 107 aa9.53□□□□□ -0.88
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PTPRB-201ENST00000261266 KIF19Q2TAC6 998 aa9.52□□□□□ -0.88
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PTPRB-201ENST00000261266 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
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PTPRB-201ENST00000261266 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
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PTPRB-201ENST00000261266 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
PTPRB-201ENST00000261266 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
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PTPRB-201ENST00000261266 C1orf228Q6PIY5 440 aa9.52□□□□□ -0.89
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PTPRB-201ENST00000261266 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
PTPRB-201ENST00000261266 NUDCD3Q8IVD9 361 aa9.52□□□□□ -0.89
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PTPRB-201ENST00000261266 ZNF235Q14590 738 aa9.51□□□□□ -0.89
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PTPRB-201ENST00000261266 BRD8Q9H0E9 1235 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRB-201ENST00000261266 ERAP1Q9NZ08 941 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRB-201ENST00000261266 SNX5Q9Y5X3 404 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRB-201ENST00000261266 NDUFB10O96000 172 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRB-201ENST00000261266 IL10P22301 178 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRB-201ENST00000261266 HADHAP40939 763 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRB-201ENST00000261266 GTF2H3Q13889 308 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRB-201ENST00000261266 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
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