RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000255198.2

ZBED3-201, Transcript of zinc finger BED-type containing 3, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZBED3, Length 6,172 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3-201ENST00000255198 SCFD1Q8WVM8 642 aa21.54■■□□□ 1.04
ZBED3-201ENST00000255198 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
ZBED3-201ENST00000255198 RAD18Q9NS91 495 aa21.54■■□□□ 1.04
ZBED3-201ENST00000255198 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa21.54■■□□□ 1.04
ZBED3-201ENST00000255198 GUCA1CO95843 209 aa21.54■■□□□ 1.04
ZBED3-201ENST00000255198 TCF3P15923 654 aa21.54■■□□□ 1.04
ZBED3-201ENST00000255198 HIC1Q14526 733 aa21.54■■□□□ 1.04
ZBED3-201ENST00000255198 CCDC22O60826 627 aa21.54■■□□□ 1.04
ZBED3-201ENST00000255198 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
ZBED3-201ENST00000255198 WDR72Q3MJ13 1102 aa21.54■■□□□ 1.04
ZBED3-201ENST00000255198 TMEM143Q96AN5 459 aa21.54■■□□□ 1.04
ZBED3-201ENST00000255198 SNX9Q9Y5X1 595 aa21.54■■□□□ 1.04
ZBED3-201ENST00000255198 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa21.54■■□□□ 1.04
ZBED3-201ENST00000255198 APOA1P02647 267 aa21.54■■□□□ 1.04
ZBED3-201ENST00000255198 INPP5AQ14642 412 aa21.54■■□□□ 1.04
ZBED3-201ENST00000255198 AGPAT1Q99943 283 aa21.54■■□□□ 1.04
ZBED3-201ENST00000255198 PRRG1O14668 218 aa21.54■■□□□ 1.04
ZBED3-201ENST00000255198 ETFBP38117 255 aa21.54■■□□□ 1.04
ZBED3-201ENST00000255198 CCDC142Q17RM4 750 aa21.54■■□□□ 1.04
ZBED3-201ENST00000255198 CLEC4FQ8N1N0 589 aa21.54■■□□□ 1.04
ZBED3-201ENST00000255198 FAM162AQ96A26 154 aa21.54■■□□□ 1.04
ZBED3-201ENST00000255198 TMEM106CQ9BVX2 250 aa21.54■■□□□ 1.04
ZBED3-201ENST00000255198 NDUFS3O75489 264 aa21.53■■□□□ 1.04
ZBED3-201ENST00000255198 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
ZBED3-201ENST00000255198 PGM1P36871 562 aa21.53■■□□□ 1.04
ZBED3-201ENST00000255198 PPP1R18Q6NYC8 613 aa21.53■■□□□ 1.04
ZBED3-201ENST00000255198 APOL5Q9BWW9 433 aa21.53■■□□□ 1.04
ZBED3-201ENST00000255198 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
ZBED3-201ENST00000255198 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
ZBED3-201ENST00000255198 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
ZBED3-201ENST00000255198 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
ZBED3-201ENST00000255198 MTMR2Q13614 643 aa21.53■■□□□ 1.04
ZBED3-201ENST00000255198 ARHGEF7Q14155 803 aa21.53■■□□□ 1.04
ZBED3-201ENST00000255198 PLD3Q8IV08 490 aa21.53■■□□□ 1.04
ZBED3-201ENST00000255198 DTX3LQ8TDB6 740 aa21.53■■□□□ 1.04
ZBED3-201ENST00000255198 ACOT2P49753 483 aa21.53■■□□□ 1.04
ZBED3-201ENST00000255198 IFNEQ86WN2 208 aa21.53■■□□□ 1.04
ZBED3-201ENST00000255198 C17orf80Q9BSJ5 609 aa21.53■■□□□ 1.04
ZBED3-201ENST00000255198 OSBPL10Q9BXB5 764 aa21.53■■□□□ 1.04
ZBED3-201ENST00000255198 LY9Q9HBG7 655 aa21.53■■□□□ 1.04
ZBED3-201ENST00000255198 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
ZBED3-201ENST00000255198 V9GYQ6 96 aa21.53■■□□□ 1.04
ZBED3-201ENST00000255198 GRID2IPA4D2P6 1211 aa21.53■■□□□ 1.04
ZBED3-201ENST00000255198 ZNF556Q9HAH1 456 aa21.53■■□□□ 1.04
ZBED3-201ENST00000255198 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa21.53■■□□□ 1.04
ZBED3-201ENST00000255198 H0Y626 953 aa21.53■■□□□ 1.04
ZBED3-201ENST00000255198 TEX33O43247 280 aa21.53■■□□□ 1.04
ZBED3-201ENST00000255198 TRIM16O95361 564 aa21.53■■□□□ 1.04
ZBED3-201ENST00000255198 PWP1Q13610 501 aa21.53■■□□□ 1.04
ZBED3-201ENST00000255198 CEP55Q53EZ4 464 aa21.53■■□□□ 1.04
ZBED3-201ENST00000255198 HAUS6Q7Z4H7 955 aa21.53■■□□□ 1.04
ZBED3-201ENST00000255198 PCDHB8Q9UN66 801 aa21.53■■□□□ 1.04
ZBED3-201ENST00000255198 IGSF1Q8N6C5 1336 aa21.52■■□□□ 1.04
ZBED3-201ENST00000255198 GRAP2O75791 330 aa21.52■■□□□ 1.04
ZBED3-201ENST00000255198 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
ZBED3-201ENST00000255198 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
ZBED3-201ENST00000255198 CDC27P30260 824 aa21.52■■□□□ 1.04
ZBED3-201ENST00000255198 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
ZBED3-201ENST00000255198 PTPRN2Q92932 1015 aa21.52■■□□□ 1.04
ZBED3-201ENST00000255198 AMACRQ9UHK6 382 aa21.52■■□□□ 1.04
ZBED3-201ENST00000255198 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
ZBED3-201ENST00000255198 APRTP07741 180 aa21.52■■□□□ 1.04
ZBED3-201ENST00000255198 SCP2P22307 547 aa21.52■■□□□ 1.04
ZBED3-201ENST00000255198 USP10Q14694 798 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
ZBED3-201ENST00000255198 P3H1Q32P28 736 aa21.52■■□□□ 1.04
ZBED3-201ENST00000255198 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
ZBED3-201ENST00000255198 PLEKHA8Q96JA3 519 aa21.52■■□□□ 1.04
ZBED3-201ENST00000255198 IL1RL2Q9HB29 575 aa21.52■■□□□ 1.04
ZBED3-201ENST00000255198 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
ZBED3-201ENST00000255198 GSNP06396 782 aa21.52■■□□□ 1.04
ZBED3-201ENST00000255198 SLC9A1P19634 815 aa21.52■■□□□ 1.04
ZBED3-201ENST00000255198 TRIM72Q6ZMU5 477 aa21.52■■□□□ 1.04
ZBED3-201ENST00000255198 PARP9Q8IXQ6 854 aa21.52■■□□□ 1.04
ZBED3-201ENST00000255198 KCTD17Q8N5Z5 321 aa21.52■■□□□ 1.04
ZBED3-201ENST00000255198 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
ZBED3-201ENST00000255198 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
ZBED3-201ENST00000255198 NPHS2Q9NP85 383 aa21.52■■□□□ 1.04
ZBED3-201ENST00000255198 BARHL2Q9NY43 387 aa21.52■■□□□ 1.04
ZBED3-201ENST00000255198 TCP11X1B4DZS4 312 aa21.52■■□□□ 1.03
ZBED3-201ENST00000255198 MAP3K7CLP57077 242 aa21.52■■□□□ 1.03
ZBED3-201ENST00000255198 TWF1Q12792 350 aa21.52■■□□□ 1.03
ZBED3-201ENST00000255198 EHD2Q9NZN4 543 aa21.52■■□□□ 1.03
ZBED3-201ENST00000255198 ADAM21Q9UKJ8 722 aa21.52■■□□□ 1.03
ZBED3-201ENST00000255198 ASB14A6NK59 587 aa21.51■■□□□ 1.03
ZBED3-201ENST00000255198 RPS6KA4O75676 772 aa21.51■■□□□ 1.03
ZBED3-201ENST00000255198 LVRNQ6Q4G3 990 aa21.51■■□□□ 1.03
ZBED3-201ENST00000255198 HPS3Q969F9 1004 aa21.51■■□□□ 1.03
ZBED3-201ENST00000255198 TASP1Q9H6P5 420 aa21.51■■□□□ 1.03
ZBED3-201ENST00000255198 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
ZBED3-201ENST00000255198 FAM118BQ9BPY3 351 aa21.51■■□□□ 1.03
ZBED3-201ENST00000255198 TRABDQ9H4I3 376 aa21.51■■□□□ 1.03
ZBED3-201ENST00000255198 NPM3O75607 178 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
ZBED3-201ENST00000255198 TAP1Q03518 808 aa21.51■■□□□ 1.03
ZBED3-201ENST00000255198 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
ZBED3-201ENST00000255198 MS4A14Q96JA4 679 aa21.51■■□□□ 1.03
ZBED3-201ENST00000255198 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
ZBED3-201ENST00000255198 PKD2L2Q9NZM6 624 aa21.51■■□□□ 1.03
ZBED3-201ENST00000255198 FAM187AA6NFU0 413 aa21.51■■□□□ 1.03
ZBED3-201ENST00000255198 KBTBD13C9JR72 458 aa21.51■■□□□ 1.03
ZBED3-201ENST00000255198 UBXN8O00124 270 aa21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.3 ms