RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000229307.8

NANOG-201, Transcript of Nanog homeobox, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NANOG, Length 5,183 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOG-201ENST00000229307 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
NANOG-201ENST00000229307 PTPROQ16827 1216 aa8.49□□□□□ -1.05
NANOG-201ENST00000229307 ANKS4BQ8N8V4 417 aa8.49□□□□□ -1.05
NANOG-201ENST00000229307 GDAP1Q8TB36 358 aa8.49□□□□□ -1.05
NANOG-201ENST00000229307 C11orf70Q9BRQ4 267 aa8.49□□□□□ -1.05
NANOG-201ENST00000229307 ANAPC7Q9UJX3 599 aa8.49□□□□□ -1.05
NANOG-201ENST00000229307 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa8.49□□□□□ -1.05
NANOG-201ENST00000229307 PAMP19021 973 aa8.49□□□□□ -1.05
NANOG-201ENST00000229307 CASP1P29466 404 aa8.49□□□□□ -1.05
NANOG-201ENST00000229307 FMO5P49326 533 aa8.49□□□□□ -1.05
NANOG-201ENST00000229307 HSD17B4P51659 736 aa8.49□□□□□ -1.05
NANOG-201ENST00000229307 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
NANOG-201ENST00000229307 BEX3Q00994 111 aa8.49□□□□□ -1.05
NANOG-201ENST00000229307 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
NANOG-201ENST00000229307 CTXN3Q4LDR2 81 aa8.49□□□□□ -1.05
NANOG-201ENST00000229307 FYB2Q5VWT5 728 aa8.49□□□□□ -1.05
NANOG-201ENST00000229307 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa8.49□□□□□ -1.05
NANOG-201ENST00000229307 PASD1Q8IV76 773 aa8.49□□□□□ -1.05
NANOG-201ENST00000229307 ADSSL1Q8N142 457 aa8.49□□□□□ -1.05
NANOG-201ENST00000229307 IFT43Q96FT9 208 aa8.49□□□□□ -1.05
NANOG-201ENST00000229307 TTC25Q96NG3 672 aa8.49□□□□□ -1.05
NANOG-201ENST00000229307 DESI2Q9BSY9 194 aa8.49□□□□□ -1.05
NANOG-201ENST00000229307 NRBP1Q9UHY1 535 aa8.49□□□□□ -1.05
NANOG-201ENST00000229307 ROBO3Q96MS0 1386 aa8.49□□□□□ -1.05
NANOG-201ENST00000229307 PAPPAQ13219 1627 aa8.49□□□□□ -1.05
NANOG-201ENST00000229307 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
NANOG-201ENST00000229307 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
NANOG-201ENST00000229307 TLR2O60603 784 aa8.49□□□□□ -1.05
NANOG-201ENST00000229307 XYLBO75191 536 aa8.49□□□□□ -1.05
NANOG-201ENST00000229307 MED24O75448 989 aa8.49□□□□□ -1.05
NANOG-201ENST00000229307 HLA-DRAP01903 254 aa8.49□□□□□ -1.05
NANOG-201ENST00000229307 SLC2A3P11169 496 aa8.49□□□□□ -1.05
NANOG-201ENST00000229307 KRT15P19012 456 aa8.49□□□□□ -1.05
NANOG-201ENST00000229307 NPTX2P47972 431 aa8.49□□□□□ -1.05
NANOG-201ENST00000229307 HARS2P49590 506 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
NANOG-201ENST00000229307 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
NANOG-201ENST00000229307 MXRA7P84157 204 aa8.49□□□□□ -1.05
NANOG-201ENST00000229307 MYBPC2Q14324 1141 aa8.49□□□□□ -1.05
NANOG-201ENST00000229307 ACCSLQ4AC99 568 aa8.49□□□□□ -1.05
NANOG-201ENST00000229307 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
NANOG-201ENST00000229307 LBX2Q6XYB7 198 aa8.49□□□□□ -1.05
NANOG-201ENST00000229307 ZNF677Q86XU0 584 aa8.49□□□□□ -1.05
NANOG-201ENST00000229307 SPIRE2Q8WWL2 714 aa8.49□□□□□ -1.05
NANOG-201ENST00000229307 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
NANOG-201ENST00000229307 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
NANOG-201ENST00000229307 MAGEB5Q9BZ81 275 aa8.49□□□□□ -1.05
NANOG-201ENST00000229307 APEX2Q9UBZ4 518 aa8.49□□□□□ -1.05
NANOG-201ENST00000229307 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
NANOG-201ENST00000229307 CASZ1Q86V15 1759 aa8.49□□□□□ -1.05
NANOG-201ENST00000229307 MAP3K7O43318 606 aa8.49□□□□□ -1.05
NANOG-201ENST00000229307 ECEL1O95672 775 aa8.49□□□□□ -1.05
NANOG-201ENST00000229307 CPP00450 1065 aa8.49□□□□□ -1.05
NANOG-201ENST00000229307 GHRP10912 638 aa8.49□□□□□ -1.05
NANOG-201ENST00000229307 EFHC1Q5JVL4 640 aa8.49□□□□□ -1.05
NANOG-201ENST00000229307 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
NANOG-201ENST00000229307 ANKRD40Q6AI12 368 aa8.49□□□□□ -1.05
NANOG-201ENST00000229307 PARD3BQ8TEW8 1205 aa8.49□□□□□ -1.05
NANOG-201ENST00000229307 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
NANOG-201ENST00000229307 C18orf8Q96DM3 657 aa8.49□□□□□ -1.05
NANOG-201ENST00000229307 C12orf42Q96LP6 360 aa8.49□□□□□ -1.05
NANOG-201ENST00000229307 UROC1Q96N76 676 aa8.49□□□□□ -1.05
NANOG-201ENST00000229307 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa8.49□□□□□ -1.05
NANOG-201ENST00000229307 TMEM51Q9NW97 253 aa8.49□□□□□ -1.05
NANOG-201ENST00000229307 FAM170AA1A519 330 aa8.48□□□□□ -1.05
NANOG-201ENST00000229307 I3L4J1 428 aa8.48□□□□□ -1.05
NANOG-201ENST00000229307 DYNC1I1O14576 645 aa8.48□□□□□ -1.05
NANOG-201ENST00000229307 MFAP3LO75121 409 aa8.48□□□□□ -1.05
NANOG-201ENST00000229307 NOP14P78316 857 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
NANOG-201ENST00000229307 NME3Q13232 169 aa8.48□□□□□ -1.05
NANOG-201ENST00000229307 MTA1Q13330 715 aa8.48□□□□□ -1.05
NANOG-201ENST00000229307 PTPAQ15257 358 aa8.48□□□□□ -1.05
NANOG-201ENST00000229307 CXCL17Q6UXB2 119 aa8.48□□□□□ -1.05
NANOG-201ENST00000229307 UCMAQ8WVF2 138 aa8.48□□□□□ -1.05
NANOG-201ENST00000229307 RUSC1Q9BVN2 902 aa8.48□□□□□ -1.05
NANOG-201ENST00000229307 STK33Q9BYT3 514 aa8.48□□□□□ -1.05
NANOG-201ENST00000229307 PRDM4Q9UKN5 801 aa8.48□□□□□ -1.05
NANOG-201ENST00000229307 IPPQ9Y573 584 aa8.48□□□□□ -1.05
NANOG-201ENST00000229307 COL1A2P08123 1366 aa8.48□□□□□ -1.05
NANOG-201ENST00000229307 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
NANOG-201ENST00000229307 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
NANOG-201ENST00000229307 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
NANOG-201ENST00000229307 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
NANOG-201ENST00000229307 SULT1E1P49888 294 aa8.48□□□□□ -1.05
NANOG-201ENST00000229307 DYNLT1P63172 113 aa8.48□□□□□ -1.05
NANOG-201ENST00000229307 GRB10Q13322 594 aa8.48□□□□□ -1.05
NANOG-201ENST00000229307 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP8.48□□□□□ -1.05
NANOG-201ENST00000229307 KRT33BQ14525 404 aa8.48□□□□□ -1.05
NANOG-201ENST00000229307 DUSP28Q4G0W2 176 aa8.48□□□□□ -1.05
NANOG-201ENST00000229307 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
NANOG-201ENST00000229307 HHATQ5VTY9 493 aa8.48□□□□□ -1.05
NANOG-201ENST00000229307 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
NANOG-201ENST00000229307 FAM114A2Q9NRY5 505 aa8.48□□□□□ -1.05
NANOG-201ENST00000229307 ITGA11Q9UKX5 1188 aa8.48□□□□□ -1.05
NANOG-201ENST00000229307 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa8.48□□□□□ -1.05
NANOG-201ENST00000229307 TAF6LQ9Y6J9 622 aa8.48□□□□□ -1.05
NANOG-201ENST00000229307 MOXD2PA6NHM9 499 aa8.48□□□□□ -1.05
NANOG-201ENST00000229307 C2CD2LO14523 706 aa8.48□□□□□ -1.05
NANOG-201ENST00000229307 NDUFA10O95299 355 aa8.48□□□□□ -1.05
NANOG-201ENST00000229307 ITGB3P05106 788 aa8.48□□□□□ -1.05
NANOG-201ENST00000229307 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa8.48□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.2 ms