RNA–Protein interactions for RNA: YOR063W

RPL3, Transcript of Ribosomal 60S subunit protein L3, yeast

Gene RPL3, Length 1,164 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPL3	YOR063W	YLR112W	Q12130	139 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPL3	YOR063W	YOR214C	Q12282	236 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPL3	YOR063W	FAS1	P07149	2051 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RPL3	YOR063W	RPL20A	P0CX23	172 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RPL3	YOR063W	RPL20B	P0CX24	172 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RPL3	YOR063W	ERD2	P18414	219 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPL3	YOR063W	YEF1	P32622	495 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPL3	YOR063W	ZRT3	P34240	503 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPL3	YOR063W	FCY21	P40039	528 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPL3	YOR063W	YER079W	P40052	210 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RPL3	YOR063W	YIL086C	P40503	102 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPL3	YOR063W	IRC24	P40580	263 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPL3	YOR063W	PAM16	P42949	149 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPL3	YOR063W	YGL101W	P53144	215 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPL3	YOR063W	PCP1	P53259	346 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPL3	YOR063W	MKC7	P53379	596 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPL3	YOR063W	PCL9	Q12477	304 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPL3	YOR063W	DET1	Q99288	334 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RPL3	YOR063W	YEL009C-A	A0A023PZF2	135 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPL3	YOR063W	DPM1	P14020	267 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RPL3	YOR063W	STP22	P25604	385 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPL3	YOR063W	TIM12	P32830	109 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPL3	YOR063W	RSM22	P36056	628 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPL3	YOR063W	MRPL15	P36523	253 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPL3	YOR063W	IPI1	P38803	334 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RPL3	YOR063W	YNL208W	P40159	199 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RPL3	YOR063W	PFS2	P42841	465 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RPL3	YOR063W	QRI1	P43123	477 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RPL3	YOR063W	SNO3	P43544	222 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPL3	YOR063W	APS3	P47064	194 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPL3	YOR063W	YAE1	P47118	141 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RPL3	YOR063W	COS10	P52924	374 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPL3	YOR063W	MRH4	P53166	561 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPL3	YOR063W	MPA43	P53583	542 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RPL3	YOR063W	MNT4	P53745	580 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPL3	YOR063W	YNR062C	P53748	327 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPL3	YOR063W	SAM50	P53969	484 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPL3	YOR063W	SEC13	Q04491	297 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RPL3	YOR063W	SNT309	Q06091	175 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RPL3	YOR063W	YOR289W	Q12012	251 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RPL3	YOR063W	APC2	Q12440	853 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPL3	YOR063W	PSF1	Q12488	208 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPL3	YOR063W	KIN28	P06242	306 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPL3	YOR063W	SSA3	P09435	649 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RPL3	YOR063W	YSF3	P0C074	85 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RPL3	YOR063W	YPK2	P18961	677 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPL3	YOR063W	SPT14	P32363	452 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPL3	YOR063W	SRL3	P36167	246 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPL3	YOR063W	ATP3	P38077	311 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RPL3	YOR063W	VPS52	P39904	641 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPL3	YOR063W	ICE2	P40499	491 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPL3	YOR063W	RTS2	P40962	232 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPL3	YOR063W	GDS1	P41913	522 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPL3	YOR063W	SER2	P42941	309 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPL3	YOR063W	LOC1	P43586	204 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RPL3	YOR063W	YJR141W	P47172	347 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RPL3	YOR063W	YGL235W	P53071	178 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPL3	YOR063W	YGR067C	P53243	804 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPL3	YOR063W	RRN9	P53437	365 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPL3	YOR063W	NCE101	Q02820	53 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPL3	YOR063W	DML1	Q03652	475 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPL3	YOR063W	NUP53	Q03790	475 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPL3	YOR063W	URC2	Q04411	772 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPL3	YOR063W	PEX10	Q05568	337 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPL3	YOR063W	SYO1	Q07395	620 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPL3	YOR063W	RRG7	Q08774	242 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RPL3	YOR063W	RNH203	Q12338	110 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPL3	YOR063W	SIR2	P06700	562 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPL3	YOR063W	PHO80	P20052	293 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPL3	YOR063W	HSP30	P25619	332 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPL3	YOR063W	BUD23	P25627	275 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RPL3	YOR063W	HMX1	P32339	317 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPL3	YOR063W	PPZ2	P33329	710 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPL3	YOR063W	SPT10	P35208	640 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPL3	YOR063W	JEN1	P36035	616 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPL3	YOR063W	DTR1	P38125	572 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPL3	YOR063W	YBR137W	P38276	179 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPL3	YOR063W	NSG1	P38837	291 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPL3	YOR063W	YFR054C	P43622	192 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPL3	YOR063W	YHC3	P47040	408 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPL3	YOR063W	SEH1	P53011	349 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RPL3	YOR063W	YGL114W	P53134	725 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPL3	YOR063W	GPI15	P53961	229 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPL3	YOR063W	TIM11	P81449	96 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RPL3	YOR063W	MSS11	Q03825	758 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPL3	YOR063W	YMR315W	Q04869	349 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RPL3	YOR063W	YPR127W	Q06494	345 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPL3	YOR063W	TAZ1	Q06510	381 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPL3	YOR063W	YLR099W-A	Q3E798	87 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPL3	YOR063W	SUS1	Q6WNK7	96 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPL3	YOR063W	DYN1	P36022	4092 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPL3	YOR063W	YPT1	P01123	206 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RPL3	YOR063W	HNM1	P19807	563 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPL3	YOR063W	HXT2	P23585	541 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPL3	YOR063W	PRE7	P23724	241 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RPL3	YOR063W	PBN1	P25580	416 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPL3	YOR063W	FUN26	P31381	517 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPL3	YOR063W	ACH1	P32316	526 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPL3	YOR063W	YBR063C	P38083	404 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPL3	YOR063W	ATG18	P43601	500 aa		4.55	□□□□□ -1.68

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