RNA–Protein interactions for RNA: YOL054W

PSH1, Transcript of E3 ubiquitin ligase targeting centromere-binding protein Cse4p, yeast

Gene PSH1, Length 1,221 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PSH1	YOL054W	LAP3	Q01532	483 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.05	□□□□□ -1.6	not detected
PSH1	YOL054W	DXO1	Q06349	442 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PSH1	YOL054W	TMS1	Q12116	473 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PSH1	YOL054W	PRM4	Q12498	284 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PSH1	YOL054W	ADK1	P07170	222 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
PSH1	YOL054W	AQY1	P0CD91	305 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PSH1	YOL054W	PDX1	P16451	410 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PSH1	YOL054W	BUB3	P26449	341 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PSH1	YOL054W	PMT2	P31382	759 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PSH1	YOL054W	SRY1	P36007	326 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PSH1	YOL054W	SSO2	P39926	295 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PSH1	YOL054W	YEL057C	P39983	233 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PSH1	YOL054W	UTP25	P40498	721 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
PSH1	YOL054W	SFH5	P47008	294 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PSH1	YOL054W	CCC1	P47818	322 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PSH1	YOL054W	NRK1	P53915	240 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PSH1	YOL054W	TAZ1	Q06510	381 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PSH1	YOL054W	PFA4	Q12006	378 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PSH1	YOL054W	YRM1	Q12340	786 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PSH1	YOL054W	GAL4	P04386	881 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PSH1	YOL054W	PHO2	P07269	559 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PSH1	YOL054W	CHO1	P08456	276 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PSH1	YOL054W	PRB1	P09232	635 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PSH1	YOL054W	STE50	P25344	346 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PSH1	YOL054W	MGR1	P25573	417 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PSH1	YOL054W	PEX32	P38292	413 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PSH1	YOL054W	YPC1	P38298	316 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PSH1	YOL054W	SDS24	P38314	527 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PSH1	YOL054W	GCV3	P39726	170 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
PSH1	YOL054W	PAC2	P39937	518 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PSH1	YOL054W	MOB1	P40484	314 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PSH1	YOL054W	YIL024C	P40543	189 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PSH1	YOL054W	SYS1	P41544	203 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PSH1	YOL054W	TDA7	P53882	636 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
PSH1	YOL054W	GIM3	P53900	129 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PSH1	YOL054W	ODC1	Q03028	310 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PSH1	YOL054W	DPB4	Q04603	196 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
PSH1	YOL054W	NMA1	Q06178	401 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
PSH1	YOL054W	YLR352W	Q06479	807 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PSH1	YOL054W	GRC3	Q07845	632 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PSH1	YOL054W	BRX1	Q08235	291 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
PSH1	YOL054W	LEU9	Q12166	604 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
PSH1	YOL054W	MSL5	Q12186	476 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.03	□□□□□ -1.6	not detected
PSH1	YOL054W	GAL7	P08431	366 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PSH1	YOL054W	TIM12	P32830	109 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PSH1	YOL054W	RPS0A	P32905	252 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
PSH1	YOL054W	CHK1	P38147	527 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PSH1	YOL054W	MTC4	P38335	694 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
PSH1	YOL054W	LAG1	P38703	411 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PSH1	YOL054W	TRR2	P38816	342 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PSH1	YOL054W	ASP1	P38986	381 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
PSH1	YOL054W	PHO90	P39535	881 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PSH1	YOL054W	RPL10	P41805	221 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
PSH1	YOL054W	SNN1	P48232	102 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PSH1	YOL054W	RSM27	P53305	110 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PSH1	YOL054W	AQR1	P53943	586 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PSH1	YOL054W	RHO3	Q00245	231 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
PSH1	YOL054W	YPL113C	Q02961	396 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PSH1	YOL054W	SNX41	Q04053	625 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PSH1	YOL054W	CAC2	Q04199	468 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PSH1	YOL054W	SMA2	Q04658	369 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PSH1	YOL054W	RBS1	Q05672	457 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
PSH1	YOL054W	YPR091C	Q06833	770 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PSH1	YOL054W	YPL272C	Q08984	517 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PSH1	YOL054W	RDL1	Q12305	139 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
PSH1	YOL054W	EAF3	Q12432	401 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PSH1	YOL054W	RRI1	Q12468	440 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PSH1	YOL054W	LSO2	Q3E772	92 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
PSH1	YOL054W	TDH2	P00358	332 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
PSH1	YOL054W	MATALPHA1	P0CY06	175 aa		5.01	□□□□□ -1.61
PSH1	YOL054W	HMLALPHA1	P0CY07	175 aa		5.01	□□□□□ -1.61
PSH1	YOL054W	SPT15	P13393	240 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
PSH1	YOL054W	SEC22	P22214	214 aa		5.01	□□□□□ -1.61
PSH1	YOL054W	GPI12	P23797	304 aa		5.01	□□□□□ -1.61
PSH1	YOL054W	CPR4	P25334	318 aa		5.01	□□□□□ -1.61
PSH1	YOL054W	MDL1	P33310	695 aa		5.01	□□□□□ -1.61
PSH1	YOL054W	YKL162C	P36052	402 aa		5.01	□□□□□ -1.61
PSH1	YOL054W	YKL071W	P36086	256 aa		5.01	□□□□□ -1.61
PSH1	YOL054W	ANS1	P38832	159 aa		5.01	□□□□□ -1.61
PSH1	YOL054W	IKI1	P38874	309 aa		5.01	□□□□□ -1.61
PSH1	YOL054W	YIL060W	P40519	144 aa		5.01	□□□□□ -1.61
PSH1	YOL054W	SGN1	P40561	250 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.01	□□□□□ -1.61	not detected
PSH1	YOL054W	LYS20	P48570	428 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
PSH1	YOL054W	YGL159W	P53110	370 aa		5.01	□□□□□ -1.61
PSH1	YOL054W	YNR062C	P53748	327 aa		5.01	□□□□□ -1.61
PSH1	YOL054W	YML096W	Q04489	525 aa		5.01	□□□□□ -1.61
PSH1	YOL054W	NOC4	Q06512	552 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
PSH1	YOL054W	YPR172W	Q06608	200 aa		5.01	□□□□□ -1.61
PSH1	YOL054W	ISA2	Q12425	185 aa		5.01	□□□□□ -1.61
PSH1	YOL054W	VMA9	Q3E7B6	73 aa		5.01	□□□□□ -1.61
PSH1	YOL054W	PCC1	Q3E833	88 aa		5.01	□□□□□ -1.61
PSH1	YOL054W	TAD3	Q9URQ3	322 aa		5.01	□□□□□ -1.61
PSH1	YOL054W	ZRC1	P20107	442 aa		5	□□□□□ -1.61
PSH1	YOL054W	PBN1	P25580	416 aa		5	□□□□□ -1.61
PSH1	YOL054W	IMG1	P25626	169 aa		5	□□□□□ -1.61
PSH1	YOL054W	GPX1	P36014	167 aa		5	□□□□□ -1.61
PSH1	YOL054W	MRPL27	P36526	146 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
PSH1	YOL054W	ICS2	P38284	255 aa		5	□□□□□ -1.61
PSH1	YOL054W	MED6	P38782	295 aa		5	□□□□□ -1.61
PSH1	YOL054W	ELO1	P39540	310 aa		5	□□□□□ -1.61

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