RNA–Protein interactions for RNA: YMR212C

EFR3, Transcript of Protein required for Stt4-containing PI kinase complex localization, yeast

Gene EFR3, Length 2,349 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
EFR3	YMR212C	AYR1	P40471	297 aa		0.85	□□□□□ -2.27
EFR3	YMR212C	YFR054C	P43622	192 aa		0.85	□□□□□ -2.27
EFR3	YMR212C	GLG2	P47011	380 aa		0.85	□□□□□ -2.27
EFR3	YMR212C	KAP114	P53067	1004 aa		0.85	□□□□□ -2.27
EFR3	YMR212C	Q0255	P03881	472 aa		0.84	□□□□□ -2.27
EFR3	YMR212C	RCN1	P36054	211 aa		0.84	□□□□□ -2.27
EFR3	YMR212C	MSA2	P36157	363 aa		0.84	□□□□□ -2.27
EFR3	YMR212C	PEX18	P38855	283 aa		0.84	□□□□□ -2.27
EFR3	YMR212C	COX20	Q04935	205 aa		0.84	□□□□□ -2.27
EFR3	YMR212C	YPL229W	Q99395	206 aa		0.84	□□□□□ -2.27
EFR3	YMR212C	SNZ3	P43545	298 aa		0.84	□□□□□ -2.28
EFR3	YMR212C	YJR012C	P47087	207 aa		0.84	□□□□□ -2.28
EFR3	YMR212C	SLD7	Q08457	257 aa		0.84	□□□□□ -2.28
EFR3	YMR212C	SNF8	Q12483	233 aa		0.84	□□□□□ -2.28
EFR3	YMR212C	HIS1	P00498	297 aa	Known RBP	0.83	□□□□□ -2.28
EFR3	YMR212C	CDC7	P06243	507 aa		0.83	□□□□□ -2.28
EFR3	YMR212C	JEN1	P36035	616 aa		0.83	□□□□□ -2.28
EFR3	YMR212C	DOG1	P38774	246 aa		0.83	□□□□□ -2.28
EFR3	YMR212C	YIL002W-A	Q3E7Z5	69 aa		0.83	□□□□□ -2.28
EFR3	YMR212C	SSK22	P25390	1331 aa	Predicted RBP	0.83	□□□□□ -2.28
EFR3	YMR212C	SCL1	P21243	252 aa	Known RBP	0.83	□□□□□ -2.28
EFR3	YMR212C	THO1	P40040	218 aa	Known RBP	0.83	□□□□□ -2.28
EFR3	YMR212C	MRH4	P53166	561 aa		0.83	□□□□□ -2.28
EFR3	YMR212C	YLR030W	Q07967	263 aa		0.83	□□□□□ -2.28
EFR3	YMR212C	BBP1	Q12365	385 aa		0.83	□□□□□ -2.28
EFR3	YMR212C	RAD3	P06839	778 aa		0.82	□□□□□ -2.28
EFR3	YMR212C	PUT1	P09368	476 aa		0.82	□□□□□ -2.28
EFR3	YMR212C	HOM6	P31116	359 aa	Known RBP	0.82	□□□□□ -2.28
EFR3	YMR212C	RPT5	P33297	434 aa	Known RBP	0.82	□□□□□ -2.28
EFR3	YMR212C	PRS2	P38620	318 aa	Known RBP	0.82	□□□□□ -2.28
EFR3	YMR212C	GOS1	P38736	223 aa		0.82	□□□□□ -2.28
EFR3	YMR212C	YHR125W	P38831	101 aa		0.82	□□□□□ -2.28
EFR3	YMR212C	RPL10	P41805	221 aa	Known RBP	0.82	□□□□□ -2.28
EFR3	YMR212C	YLR462W	O13556	202 aa		0.82	□□□□□ -2.28
EFR3	YMR212C	YEL075C	P39972	122 aa		0.82	□□□□□ -2.28
EFR3	YMR212C	YER189W	P40104	122 aa		0.82	□□□□□ -2.28
EFR3	YMR212C	YGL159W	P53110	370 aa		0.82	□□□□□ -2.28
EFR3	YMR212C	ALG11	P53954	548 aa	Known RBP	0.82	□□□□□ -2.28
EFR3	YMR212C	MRPS8	Q03799	155 aa		0.82	□□□□□ -2.28
EFR3	YMR212C	MHT1	Q12525	324 aa		0.82	□□□□□ -2.28
EFR3	YMR212C	BOL1	Q3E793	110 aa		0.82	□□□□□ -2.28
EFR3	YMR212C	MSF1	P08425	469 aa		0.81	□□□□□ -2.28
EFR3	YMR212C	YKR104W	P0CE69	306 aa		0.81	□□□□□ -2.28
EFR3	YMR212C	OM45	P16547	393 aa		0.81	□□□□□ -2.28
EFR3	YMR212C	MRPL37	P36532	105 aa		0.81	□□□□□ -2.28
EFR3	YMR212C	COS8	P38723	381 aa		0.81	□□□□□ -2.28
EFR3	YMR212C	MEP1	P40260	492 aa		0.81	□□□□□ -2.28
EFR3	YMR212C	ARC15	P40518	154 aa	RIP-Chip data	0.81	□□□□□ -2.28	not detected
EFR3	YMR212C	DAD3	P69850	94 aa		0.81	□□□□□ -2.28
EFR3	YMR212C	YOR186W	Q08560	144 aa		0.81	□□□□□ -2.28
EFR3	YMR212C	AKR2	Q12013	749 aa		0.81	□□□□□ -2.28
EFR3	YMR212C	YHR139C-A	O13536	103 aa		0.81	□□□□□ -2.28
EFR3	YMR212C	VPS3	P23643	1011 aa		0.81	□□□□□ -2.28
EFR3	YMR212C	RPS5	P26783	225 aa	Known RBP	0.81	□□□□□ -2.28
EFR3	YMR212C	MRX3	P38172	270 aa		0.81	□□□□□ -2.28
EFR3	YMR212C	SNZ2	P53824	298 aa		0.81	□□□□□ -2.28
EFR3	YMR212C	MSA1	Q08471	629 aa		0.81	□□□□□ -2.28
EFR3	YMR212C	RRP36	Q12481	300 aa	Predicted RBP	0.81	□□□□□ -2.28
EFR3	YMR212C	PEX4	P29340	183 aa		0.8	□□□□□ -2.28
EFR3	YMR212C	BIG1	P38813	335 aa		0.8	□□□□□ -2.28
EFR3	YMR212C	GLE2	P40066	365 aa		0.8	□□□□□ -2.28
EFR3	YMR212C	YNL046W	P53956	172 aa		0.8	□□□□□ -2.28
EFR3	YMR212C	SYC1	Q08553	188 aa	Predicted RBP	0.8	□□□□□ -2.28
EFR3	YMR212C	SIR4	P11978	1358 aa		0.8	□□□□□ -2.28
EFR3	YMR212C	CYR1	P08678	2026 aa	Known RBP	0.8	□□□□□ -2.28
EFR3	YMR212C	EBP2	P36049	427 aa	Known RBP	0.8	□□□□□ -2.28
EFR3	YMR212C	YHB1	P39676	399 aa	Known RBP	0.8	□□□□□ -2.28
EFR3	YMR212C	YER135C	P40082	130 aa		0.8	□□□□□ -2.28
EFR3	YMR212C	RPA43	P46669	326 aa		0.8	□□□□□ -2.28
EFR3	YMR212C	ASI3	P53983	676 aa		0.8	□□□□□ -2.28
EFR3	YMR212C	SPG4	Q04438	115 aa		0.8	□□□□□ -2.28
EFR3	YMR212C	YDR124W	Q04608	324 aa		0.8	□□□□□ -2.28
EFR3	YMR212C	FAR8	Q05040	523 aa		0.8	□□□□□ -2.28
EFR3	YMR212C	YPR147C	Q06522	304 aa	Known RBP	0.8	□□□□□ -2.28
EFR3	YMR212C	YPR172W	Q06608	200 aa		0.8	□□□□□ -2.28
EFR3	YMR212C	SDO1	Q07953	250 aa	Known RBP	0.8	□□□□□ -2.28
EFR3	YMR212C	ATO3	Q12359	275 aa		0.8	□□□□□ -2.28
EFR3	YMR212C	DDI2	P0CH63	225 aa		0.79	□□□□□ -2.28
EFR3	YMR212C	DDI3	P0CH64	225 aa		0.79	□□□□□ -2.28
EFR3	YMR212C	DSF1	P0CX08	502 aa		0.79	□□□□□ -2.28
EFR3	YMR212C	YNR073C	P0CX09	502 aa		0.79	□□□□□ -2.28
EFR3	YMR212C	GRX2	P17695	143 aa	Known RBP	0.79	□□□□□ -2.28
EFR3	YMR212C	ERG24	P32462	438 aa	Known RBP	0.79	□□□□□ -2.28
EFR3	YMR212C	PET100	P38958	111 aa		0.79	□□□□□ -2.28
EFR3	YMR212C	FBA1	P14540	359 aa	Known RBP	0.78	□□□□□ -2.28
EFR3	YMR212C	SSH1	P38353	490 aa	Known RBP	0.78	□□□□□ -2.28
EFR3	YMR212C	PEP8	P40335	379 aa		0.78	□□□□□ -2.28
EFR3	YMR212C	EMC2	P47133	292 aa	Known RBP	0.78	□□□□□ -2.28
EFR3	YMR212C	JHD2	P47156	728 aa	Predicted RBP	0.78	□□□□□ -2.28
EFR3	YMR212C	GTR2	P53290	341 aa		0.78	□□□□□ -2.28
EFR3	YMR212C	ATG17	Q06410	417 aa		0.78	□□□□□ -2.28
EFR3	YMR212C	ARR2	Q06597	130 aa		0.78	□□□□□ -2.28
EFR3	YMR212C	RPL24A	P04449	155 aa	Known RBP	0.78	□□□□□ -2.28
EFR3	YMR212C	DAL82	P21705	255 aa		0.78	□□□□□ -2.28
EFR3	YMR212C	PHO88	P38264	188 aa	Predicted RBP	0.78	□□□□□ -2.28
EFR3	YMR212C	YHR180W	P38868	163 aa		0.78	□□□□□ -2.28
EFR3	YMR212C	BMT5	P40493	336 aa		0.78	□□□□□ -2.28
EFR3	YMR212C	CIS3	P47001	227 aa		0.78	□□□□□ -2.28
EFR3	YMR212C	CYT2	Q00873	224 aa		0.78	□□□□□ -2.28
EFR3	YMR212C	GOT1	Q03554	138 aa		0.78	□□□□□ -2.28

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 10.9 ms