RNA–Protein interactions for RNA: YLL009C

COX17, Transcript of Copper metallochaperone that transfers copper to Sco1p and Cox11p, yeast

Gene COX17, Length 210 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
COX17	YLL009C	MCR1	P36060	302 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
COX17	YLL009C	PAN3	P36102	679 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
COX17	YLL009C	YPC1	P38298	316 aa		4.93	□□□□□ -1.62
COX17	YLL009C	YPT31	P38555	223 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
COX17	YLL009C	MDM31	P38880	579 aa		4.93	□□□□□ -1.62
COX17	YLL009C	AYR1	P40471	297 aa		4.93	□□□□□ -1.62
COX17	YLL009C	YCH1	P42937	148 aa		4.93	□□□□□ -1.62
COX17	YLL009C	IKS1	P47042	667 aa		4.93	□□□□□ -1.62
COX17	YLL009C	LSM8	P47093	109 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
COX17	YLL009C	BXI1	P48558	297 aa		4.93	□□□□□ -1.62
COX17	YLL009C	RPS12	P48589	143 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
COX17	YLL009C	ACT1	P60010	375 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
COX17	YLL009C	YMR010W	Q03687	405 aa		4.93	□□□□□ -1.62
COX17	YLL009C	YMR166C	Q03829	368 aa		4.93	□□□□□ -1.62
COX17	YLL009C	GPI17	Q04080	534 aa		4.93	□□□□□ -1.62
COX17	YLL009C	YOL073C	Q08232	322 aa		4.93	□□□□□ -1.62
COX17	YLL009C	TFC7	Q12415	435 aa		4.93	□□□□□ -1.62
COX17	YLL009C	SPO11	P23179	398 aa		4.92	□□□□□ -1.62
COX17	YLL009C	CPR3	P25719	182 aa		4.92	□□□□□ -1.62
COX17	YLL009C	RPC19	P28000	142 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
COX17	YLL009C	YKL097C	P34245	136 aa		4.92	□□□□□ -1.62
COX17	YLL009C	SHE2	P36068	246 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.92	□□□□□ -1.62	not detected
COX17	YLL009C	MRPL15	P36523	253 aa		4.92	□□□□□ -1.62
COX17	YLL009C	YBR096W	P38256	230 aa		4.92	□□□□□ -1.62
COX17	YLL009C	RPS20	P38701	121 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
COX17	YLL009C	DFG10	P40526	253 aa		4.92	□□□□□ -1.62
COX17	YLL009C	EGT2	P42835	1041 aa		4.92	□□□□□ -1.62
COX17	YLL009C	MIC19	P43594	170 aa		4.92	□□□□□ -1.62
COX17	YLL009C	COQ5	P49017	307 aa		4.92	□□□□□ -1.62
COX17	YLL009C	SOL1	P50278	321 aa		4.92	□□□□□ -1.62
COX17	YLL009C	MRPS35	P53292	345 aa		4.92	□□□□□ -1.62
COX17	YLL009C	YDR391C	Q04170	232 aa		4.92	□□□□□ -1.62
COX17	YLL009C	HPT1	Q04178	221 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
COX17	YLL009C	YET2	Q04210	160 aa		4.92	□□□□□ -1.62
COX17	YLL009C	GMC1	Q04399	608 aa		4.92	□□□□□ -1.62
COX17	YLL009C	RRG7	Q08774	242 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
COX17	YLL009C	DET1	Q99288	334 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
COX17	YLL009C	Q0010	Q9ZZX9	128 aa		4.92	□□□□□ -1.62
COX17	YLL009C	PHO2	P07269	559 aa		4.91	□□□□□ -1.62
COX17	YLL009C	GPA2	P10823	449 aa		4.91	□□□□□ -1.62
COX17	YLL009C	ATG22	P25568	528 aa		4.91	□□□□□ -1.62
COX17	YLL009C	YNK1	P36010	153 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
COX17	YLL009C	DOG2	P38773	246 aa		4.91	□□□□□ -1.62
COX17	YLL009C	DOG1	P38774	246 aa		4.91	□□□□□ -1.62
COX17	YLL009C	YIL029C	P40538	142 aa		4.91	□□□□□ -1.62
COX17	YLL009C	CFD1	P40558	293 aa		4.91	□□□□□ -1.62
COX17	YLL009C	YFL064C	P43540	174 aa		4.91	□□□□□ -1.62
COX17	YLL009C	PMT4	P46971	762 aa		4.91	□□□□□ -1.62
COX17	YLL009C	UBC13	P52490	153 aa		4.91	□□□□□ -1.62
COX17	YLL009C	YPS5	P53057	165 aa		4.91	□□□□□ -1.62
COX17	YLL009C	ARO8	P53090	500 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
COX17	YLL009C	GTF1	P53260	183 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
COX17	YLL009C	BUD32	P53323	261 aa		4.91	□□□□□ -1.62
COX17	YLL009C	CUZ1	P53899	274 aa		4.91	□□□□□ -1.62
COX17	YLL009C	HHT1	P61830	136 aa		4.91	□□□□□ -1.62
COX17	YLL009C	TRS23	Q03784	219 aa		4.91	□□□□□ -1.62
COX17	YLL009C	PEX30	Q06169	523 aa		4.91	□□□□□ -1.62
COX17	YLL009C	YLR012C	Q07927	99 aa		4.91	□□□□□ -1.62
COX17	YLL009C	YPR202W	Q08993	238 aa		4.91	□□□□□ -1.62
COX17	YLL009C	TY1A-NL1	Q12391	440 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
COX17	YLL009C	TRM10	Q12400	293 aa		4.91	□□□□□ -1.62
COX17	YLL009C	PSK1	P31374	1356 aa		4.91	□□□□□ -1.62
COX17	YLL009C	BAR1	P12630	587 aa		4.9	□□□□□ -1.63
COX17	YLL009C	ILV6	P25605	309 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
COX17	YLL009C	LHP1	P33399	275 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
COX17	YLL009C	SFK1	P35735	353 aa		4.9	□□□□□ -1.63
COX17	YLL009C	YPT10	P38146	199 aa		4.9	□□□□□ -1.63
COX17	YLL009C	GEP4	P38812	185 aa		4.9	□□□□□ -1.63
COX17	YLL009C	PEX22	P39718	180 aa		4.9	□□□□□ -1.63
COX17	YLL009C	FAU1	P40099	211 aa		4.9	□□□□□ -1.63
COX17	YLL009C	YNL320W	P42840	284 aa		4.9	□□□□□ -1.63
COX17	YLL009C	AVT4	P50944	713 aa		4.9	□□□□□ -1.63
COX17	YLL009C	TPN1	P53099	579 aa		4.9	□□□□□ -1.63
COX17	YLL009C	FRE4	P53746	719 aa		4.9	□□□□□ -1.63
COX17	YLL009C	HSK3	P69852	69 aa		4.9	□□□□□ -1.63
COX17	YLL009C	TMA23	Q03525	211 aa		4.9	□□□□□ -1.63
COX17	YLL009C	BET5	Q03630	159 aa		4.9	□□□□□ -1.63
COX17	YLL009C	YMR206W	Q03695	313 aa		4.9	□□□□□ -1.63
COX17	YLL009C	YMR317W	Q04893	1140 aa		4.9	□□□□□ -1.63
COX17	YLL009C	ERP1	Q05359	219 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
COX17	YLL009C	FSF1	Q12029	327 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
COX17	YLL009C	NPC2	Q12408	173 aa		4.9	□□□□□ -1.63
COX17	YLL009C	PDR18	P53756	1333 aa		4.9	□□□□□ -1.63
COX17	YLL009C	MHP1	P43638	1398 aa		4.9	□□□□□ -1.63
COX17	YLL009C	SPP41	P38904	1435 aa		4.89	□□□□□ -1.63
COX17	YLL009C	SEC59	P20048	519 aa		4.89	□□□□□ -1.63
COX17	YLL009C	CLB2	P24869	491 aa		4.89	□□□□□ -1.63
COX17	YLL009C	MRPL9	P31334	269 aa		4.89	□□□□□ -1.63
COX17	YLL009C	ALK2	P32789	676 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
COX17	YLL009C	KTI12	P34253	313 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
COX17	YLL009C	YGP1	P38616	354 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
COX17	YLL009C	LAG1	P38703	411 aa		4.89	□□□□□ -1.63
COX17	YLL009C	YHK8	P38776	514 aa		4.89	□□□□□ -1.63
COX17	YLL009C	YEA4	P40004	342 aa		4.89	□□□□□ -1.63
COX17	YLL009C	YIL169C	P40442	995 aa		4.89	□□□□□ -1.63
COX17	YLL009C	BUD13	P46947	266 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
COX17	YLL009C	AIF1	P52923	378 aa		4.89	□□□□□ -1.63
COX17	YLL009C	HHO1	P53551	258 aa		4.89	□□□□□ -1.63
COX17	YLL009C	YNL040W	P53960	456 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
COX17	YLL009C	YPL062W	Q02781	134 aa		4.89	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 21.5 ms