RNA–Protein interactions for RNA: YJL174W

KRE9, Transcript of Glycoprotein involved in cell wall beta-glucan assembly, yeast

Gene KRE9, Length 831 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
KRE9	YJL174W	QCR7	P00128	127 aa		4.58	□□□□□ -1.68
KRE9	YJL174W	ARO2	P28777	376 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
KRE9	YJL174W	EFM1	P38732	585 aa		4.58	□□□□□ -1.68
KRE9	YJL174W	PTH1	P38876	190 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
KRE9	YJL174W	SEC72	P39742	193 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
KRE9	YJL174W	REE1	P40893	198 aa		4.58	□□□□□ -1.68
KRE9	YJL174W	YJR054W	P47114	497 aa		4.58	□□□□□ -1.68
KRE9	YJL174W	NSA1	P53136	463 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
KRE9	YJL174W	FAR8	Q05040	523 aa		4.58	□□□□□ -1.68
KRE9	YJL174W	HRI1	Q05905	244 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
KRE9	YJL174W	YPR098C	Q06089	161 aa		4.58	□□□□□ -1.68
KRE9	YJL174W	RFM1	Q12192	310 aa		4.58	□□□□□ -1.68
KRE9	YJL174W	IZH2	Q12442	317 aa		4.58	□□□□□ -1.68
KRE9	YJL174W	SPT3	P06844	337 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KRE9	YJL174W	RPL4A	P10664	362 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
KRE9	YJL174W	CDC10	P25342	322 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
KRE9	YJL174W	RFA3	P26755	122 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
KRE9	YJL174W	EHD3	P28817	500 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KRE9	YJL174W	SHE1	P38200	338 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KRE9	YJL174W	MBA1	P38300	278 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KRE9	YJL174W	YHB1	P39676	399 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
KRE9	YJL174W	SER33	P40510	469 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KRE9	YJL174W	RPL4B	P49626	362 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
KRE9	YJL174W	YGR015C	P53208	328 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KRE9	YJL174W	NOP19	P53317	196 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
KRE9	YJL174W	NRM1	P53718	249 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KRE9	YJL174W	TPS1	Q00764	495 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
KRE9	YJL174W	CTF19	Q02732	369 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KRE9	YJL174W	ARC18	Q05933	178 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
KRE9	YJL174W	FDH1	Q08911	376 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KRE9	YJL174W	TIP41	Q12199	356 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KRE9	YJL174W	JLP1	Q12358	412 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KRE9	YJL174W	YCL012C	Q8J0M4	134 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KRE9	YJL174W	FIG2	P25653	1609 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KRE9	YJL174W	BCY1	P07278	416 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
KRE9	YJL174W	SPT15	P13393	240 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
KRE9	YJL174W	CDC13	P32797	924 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
KRE9	YJL174W	NTF2	P33331	125 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
KRE9	YJL174W	GPX1	P36014	167 aa		4.56	□□□□□ -1.68
KRE9	YJL174W	YBR096W	P38256	230 aa		4.56	□□□□□ -1.68
KRE9	YJL174W	TRM5	P38793	499 aa		4.56	□□□□□ -1.68
KRE9	YJL174W	PAN6	P40459	309 aa		4.56	□□□□□ -1.68
KRE9	YJL174W	ELP3	Q02908	557 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
KRE9	YJL174W	FUS2	Q05670	677 aa		4.56	□□□□□ -1.68
KRE9	YJL174W	YLR177W	Q06251	628 aa		4.56	□□□□□ -1.68
KRE9	YJL174W	MIM1	Q08176	113 aa		4.56	□□□□□ -1.68
KRE9	YJL174W	YOR292C	Q08743	309 aa		4.56	□□□□□ -1.68
KRE9	YJL174W	DUR1,2	P32528	1835 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
KRE9	YJL174W	DPB2	P24482	689 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
KRE9	YJL174W	YBL059W	P34224	193 aa		4.55	□□□□□ -1.68
KRE9	YJL174W	RFT1	P38206	574 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
KRE9	YJL174W	YBR062C	P38239	180 aa		4.55	□□□□□ -1.68
KRE9	YJL174W	MED8	P38304	223 aa		4.55	□□□□□ -1.68
KRE9	YJL174W	NUP57	P48837	541 aa		4.55	□□□□□ -1.68
KRE9	YJL174W	COQ10	Q08058	207 aa		4.55	□□□□□ -1.68
KRE9	YJL174W	GSC2	P40989	1895 aa		4.55	□□□□□ -1.68
KRE9	YJL174W	FLO11	P08640	1367 aa		4.54	□□□□□ -1.68
KRE9	YJL174W	RPL28	P02406	149 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
KRE9	YJL174W	SPS19	P32573	292 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
KRE9	YJL174W	GDH2	P33327	1092 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
KRE9	YJL174W	GOS1	P38736	223 aa		4.54	□□□□□ -1.68
KRE9	YJL174W	KRE29	P40026	464 aa		4.54	□□□□□ -1.68
KRE9	YJL174W	YFL064C	P43540	174 aa		4.54	□□□□□ -1.68
KRE9	YJL174W	IRC18	P47056	224 aa		4.54	□□□□□ -1.68
KRE9	YJL174W	ADO1	P47143	340 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
KRE9	YJL174W	NIF3	P53081	288 aa		4.54	□□□□□ -1.68
KRE9	YJL174W	FYV6	P53913	173 aa		4.54	□□□□□ -1.68
KRE9	YJL174W	SDC1	Q03323	175 aa		4.54	□□□□□ -1.68
KRE9	YJL174W	LOA1	Q06508	300 aa		4.54	□□□□□ -1.68
KRE9	YJL174W	YBR298C-A	Q8TGK4	73 aa		4.54	□□□□□ -1.68
KRE9	YJL174W	YMR316C-A	I2HB70	103 aa		4.53	□□□□□ -1.68
KRE9	YJL174W	RPS19A	P07280	144 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
KRE9	YJL174W	RPS19B	P07281	144 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
KRE9	YJL174W	BGL2	P15703	313 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
KRE9	YJL174W	CAM1	P29547	415 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
KRE9	YJL174W	VPH2	P32341	215 aa		4.53	□□□□□ -1.68
KRE9	YJL174W	SGE1	P33335	543 aa		4.53	□□□□□ -1.68
KRE9	YJL174W	SOL2	P37262	315 aa		4.53	□□□□□ -1.68
KRE9	YJL174W	SHE3	P38272	425 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
KRE9	YJL174W	WSC4	P38739	605 aa		4.53	□□□□□ -1.68
KRE9	YJL174W	YHR127W	P38833	243 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
KRE9	YJL174W	ERG10	P41338	398 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
KRE9	YJL174W	MCM22	P47167	239 aa		4.53	□□□□□ -1.68
KRE9	YJL174W	YGL039W	P53183	348 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
KRE9	YJL174W	RHO3	Q00245	231 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
KRE9	YJL174W	CDD1	Q06549	142 aa		4.53	□□□□□ -1.68
KRE9	YJL174W	GPM2	Q12008	311 aa		4.53	□□□□□ -1.68
KRE9	YJL174W	AST1	P35183	429 aa		4.52	□□□□□ -1.69
KRE9	YJL174W	OXA1	P39952	402 aa		4.52	□□□□□ -1.69
KRE9	YJL174W	RNH201	P53942	307 aa		4.52	□□□□□ -1.69
KRE9	YJL174W	MRS2	Q01926	470 aa		4.52	□□□□□ -1.69
KRE9	YJL174W	PEX10	Q05568	337 aa		4.52	□□□□□ -1.69
KRE9	YJL174W	DXO1	Q06349	442 aa		4.52	□□□□□ -1.69
KRE9	YJL174W	HEM25	Q07534	307 aa		4.52	□□□□□ -1.69
KRE9	YJL174W	MMT2	Q08970	484 aa		4.52	□□□□□ -1.69
KRE9	YJL174W	ASP3-2	P0CX77	362 aa		4.51	□□□□□ -1.69
KRE9	YJL174W	ASP3-3	P0CX78	362 aa		4.51	□□□□□ -1.69
KRE9	YJL174W	ASP3-4	P0CX79	362 aa		4.51	□□□□□ -1.69
KRE9	YJL174W	ASP3-1	P0CZ17	362 aa		4.51	□□□□□ -1.69
KRE9	YJL174W	SNA3	P14359	133 aa		4.51	□□□□□ -1.69

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