RNA–Protein interactions for RNA: YGL158W

RCK1, Transcript of Protein kinase involved in the response to oxidative stress, yeast

Gene RCK1, Length 1,539 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RCK1	YGL158W	ADH6	Q04894	360 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
RCK1	YGL158W	FRE8	Q12209	686 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RCK1	YGL158W	RPS18A	P0CX55	146 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
RCK1	YGL158W	RPS18B	P0CX56	146 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
RCK1	YGL158W	GIT1	P25346	518 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RCK1	YGL158W	YCR090C	P25654	182 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
RCK1	YGL158W	PRS4	P38063	326 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
RCK1	YGL158W	IPT1	P38954	527 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RCK1	YGL158W	UFE1	P41834	346 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RCK1	YGL158W	IDP2	P41939	412 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RCK1	YGL158W	COS4	P43542	379 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RCK1	YGL158W	PMT4	P46971	762 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RCK1	YGL158W	SNX41	Q04053	625 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RCK1	YGL158W	RTN1	Q04947	295 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
RCK1	YGL158W	NEJ1	Q06148	342 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RCK1	YGL158W	GPI11	Q06636	219 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RCK1	YGL158W	PAM18	Q07914	168 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RCK1	YGL158W	RDL2	Q08742	149 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
RCK1	YGL158W	POM33	Q12164	279 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RCK1	YGL158W	RTR2	Q12378	196 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RCK1	YGL158W	YDL199C	Q12407	687 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RCK1	YGL158W	MHF1	Q3E835	90 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RCK1	YGL158W	REV1	P12689	985 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RCK1	YGL158W	NSP1	P14907	823 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
RCK1	YGL158W	ASF2	P32448	525 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
RCK1	YGL158W	ARN2	P38724	620 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RCK1	YGL158W	MTW1	P39731	289 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RCK1	YGL158W	AIM10	P39965	576 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
RCK1	YGL158W	DDI1	P40087	428 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RCK1	YGL158W	YIL067C	P40514	678 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RCK1	YGL158W	OTU1	P43558	301 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RCK1	YGL158W	KTR6	P54070	446 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RCK1	YGL158W	PRP38	Q00723	242 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
RCK1	YGL158W	SDO1	Q07953	250 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
RCK1	YGL158W	YLR031W	Q07978	186 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RCK1	YGL158W	SLD7	Q08457	257 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RCK1	YGL158W	UTP23	Q12339	254 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
RCK1	YGL158W	COS2	P0CX12	379 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RCK1	YGL158W	COS3	P0CX13	379 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RCK1	YGL158W	MRP1	P10662	321 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
RCK1	YGL158W	NAM2	P11325	894 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RCK1	YGL158W	CTA1	P15202	515 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RCK1	YGL158W	HSP26	P15992	214 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.79	□□□□□ -1.64	not detected
RCK1	YGL158W	FPR1	P20081	114 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
RCK1	YGL158W	BUB2	P26448	306 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
RCK1	YGL158W	RPL16B	P26785	198 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
RCK1	YGL158W	SPT14	P32363	452 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RCK1	YGL158W	MRPL6	P32904	214 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RCK1	YGL158W	SGE1	P33335	543 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RCK1	YGL158W	SDH3	P33421	198 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RCK1	YGL158W	IPI1	P38803	334 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
RCK1	YGL158W	HEM14	P40012	539 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RCK1	YGL158W	MST27	P53176	234 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RCK1	YGL158W	CGR1	P53188	120 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RCK1	YGL158W	SWC4	P53201	476 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RCK1	YGL158W	PEX31	P53203	462 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RCK1	YGL158W	GTR2	P53290	341 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RCK1	YGL158W	YLR283W	Q05867	314 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RCK1	YGL158W	ICT1	Q12385	394 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RCK1	YGL158W	GTT2	Q12390	233 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RCK1	YGL158W	YPL119C-A	Q3E751	87 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RCK1	YGL158W	RIB3	Q99258	208 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RCK1	YGL158W	LAA1	P39526	2014 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RCK1	YGL158W	MSI1	P13712	422 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RCK1	YGL158W	GRX2	P17695	143 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
RCK1	YGL158W	MCH2	P36032	473 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RCK1	YGL158W	ERG10	P41338	398 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
RCK1	YGL158W	YJR085C	P47131	105 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
RCK1	YGL158W	TIS11	P47977	285 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RCK1	YGL158W	CPD1	P53314	239 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RCK1	YGL158W	RMI1	Q02685	241 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RCK1	YGL158W	VBA1	Q04301	562 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RCK1	YGL158W	GRS2	Q06817	618 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RCK1	YGL158W	YOR214C	Q12282	236 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RCK1	YGL158W	YBR298C-A	Q8TGK4	73 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RCK1	YGL158W	YCL021W-A	Q96VH3	125 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RCK1	YGL158W	TDH2	P00358	332 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
RCK1	YGL158W	HIS1	P00498	297 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
RCK1	YGL158W	SPS100	P13130	326 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RCK1	YGL158W	RPL24B	P24000	155 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
RCK1	YGL158W	TAF14	P35189	244 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RCK1	YGL158W	URA8	P38627	578 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
RCK1	YGL158W	GDS1	P41913	522 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RCK1	YGL158W	PRP24	P49960	444 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
RCK1	YGL158W	SUR7	P54003	302 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RCK1	YGL158W	DID2	P69771	204 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RCK1	YGL158W	GAS3	Q03655	524 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RCK1	YGL158W	OST6	Q03723	332 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RCK1	YGL158W	ATG38	Q05789	226 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
RCK1	YGL158W	RIF2	Q06208	395 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RCK1	YGL158W	NDD1	Q08887	554 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RCK1	YGL158W	PST2	Q12335	198 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
RCK1	YGL158W	YPL247C	Q12523	523 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RCK1	YGL158W	EFG1	Q3E705	233 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
RCK1	YGL158W	ERD1	P16151	362 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RCK1	YGL158W	CAF4	P36130	643 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RCK1	YGL158W	MRPL17	P36528	281 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RCK1	YGL158W	RIB1	P38066	345 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RCK1	YGL158W	EDC3	P39998	551 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
RCK1	YGL158W	YIA6	P40556	373 aa		4.77	□□□□□ -1.65

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