RNA–Protein interactions for RNA: YEL038W

UTR4, Transcript of Protein with sequence similarity to acireductone synthases, yeast

Gene UTR4, Length 684 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
UTR4	YEL038W	RNP1	P32385	249 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UTR4	YEL038W	ERG24	P32462	438 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
UTR4	YEL038W	PPQ1	P32945	549 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UTR4	YEL038W	SPT10	P35208	640 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UTR4	YEL038W	SRP102	P36057	244 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
UTR4	YEL038W	SDS24	P38314	527 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UTR4	YEL038W	PSD1	P39006	500 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UTR4	YEL038W	ATF1	P40353	525 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UTR4	YEL038W	LYS20	P48570	428 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
UTR4	YEL038W	APM1	Q00776	475 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
UTR4	YEL038W	CGI121	Q03705	181 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
UTR4	YEL038W	YMR130W	Q04223	302 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UTR4	YEL038W	MRX8	Q05473	314 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UTR4	YEL038W	PEX30	Q06169	523 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UTR4	YEL038W	YPR147C	Q06522	304 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
UTR4	YEL038W	ASR1	Q06834	288 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UTR4	YEL038W	RDL2	Q08742	149 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
UTR4	YEL038W	RTC5	Q12108	567 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
UTR4	YEL038W	SWM1	Q12379	170 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UTR4	YEL038W	STE18	P18852	110 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UTR4	YEL038W	SAR1	P20606	190 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
UTR4	YEL038W	ERG4	P25340	473 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UTR4	YEL038W	CNE1	P27825	502 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UTR4	YEL038W	RPC34	P32910	317 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UTR4	YEL038W	UTP30	P36144	274 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
UTR4	YEL038W	CDS1	P38221	457 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UTR4	YEL038W	GRE3	P38715	327 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.6	□□□□□ -1.67	not detected
UTR4	YEL038W	VMA22	P38784	181 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UTR4	YEL038W	PKP1	P40530	394 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UTR4	YEL038W	PGU1	P47180	361 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UTR4	YEL038W	GLO1	P50107	326 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UTR4	YEL038W	YGR126W	P53274	230 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UTR4	YEL038W	MTM1	P53320	366 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UTR4	YEL038W	ERV25	P54837	211 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
UTR4	YEL038W	MRPS16	Q02608	121 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UTR4	YEL038W	AIM36	Q03798	255 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UTR4	YEL038W	MIM1	Q08176	113 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UTR4	YEL038W	INP53	Q12271	1107 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UTR4	YEL038W	YRM1	Q12340	786 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UTR4	YEL038W	HTZ1	Q12692	134 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
UTR4	YEL038W	MTR10	Q99189	972 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UTR4	YEL038W	YAL064W-B	O13512	126 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UTR4	YEL038W	MSW1	P04803	379 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UTR4	YEL038W	RAD52	P06778	471 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
UTR4	YEL038W	YHR214C-D	P0CX93	97 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UTR4	YEL038W	PET122	P10355	254 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UTR4	YEL038W	STF2	P16965	84 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UTR4	YEL038W	GRX2	P17695	143 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
UTR4	YEL038W	MAK32	P23060	363 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UTR4	YEL038W	DAL80	P26343	269 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UTR4	YEL038W	MTC7	P32633	139 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UTR4	YEL038W	DAD2	P36162	133 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UTR4	YEL038W	YHR122W	P38829	231 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UTR4	YEL038W	SHO1	P40073	367 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UTR4	YEL038W	CAT5	P41735	233 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UTR4	YEL038W	MNN5	P46982	586 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UTR4	YEL038W	AIM25	P47140	327 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UTR4	YEL038W	RMD9	P53140	646 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
UTR4	YEL038W	VHT1	P53241	593 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UTR4	YEL038W	ASI3	P53983	676 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UTR4	YEL038W	YLR152C	P54072	576 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UTR4	YEL038W	PET191	Q02772	108 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UTR4	YEL038W	YPL108W	Q02872	168 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
UTR4	YEL038W	YPL039W	Q03080	316 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UTR4	YEL038W	GIS1	Q03833	894 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UTR4	YEL038W	VBA4	Q04602	768 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
UTR4	YEL038W	NNT1	Q05874	261 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UTR4	YEL038W	KEI1	Q06346	221 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UTR4	YEL038W	SYC1	Q08553	188 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
UTR4	YEL038W	HMS1	Q12398	434 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UTR4	YEL038W	ERG27	Q12452	347 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
UTR4	YEL038W	MATALPHA1	P0CY06	175 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UTR4	YEL038W	HMLALPHA1	P0CY07	175 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UTR4	YEL038W	CTA1	P15202	515 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UTR4	YEL038W	ERG8	P24521	451 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UTR4	YEL038W	MEK1	P24719	497 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
UTR4	YEL038W	CAM1	P29547	415 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
UTR4	YEL038W	COS9	P36034	407 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UTR4	YEL038W	MRPL3	P36516	390 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UTR4	YEL038W	SMB1	P40018	196 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
UTR4	YEL038W	RFC4	P40339	323 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
UTR4	YEL038W	XBP1	P40489	647 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UTR4	YEL038W	TIR3	P40552	269 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UTR4	YEL038W	REE1	P40893	198 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UTR4	YEL038W	ECO1	P43605	281 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UTR4	YEL038W	MTL1	P53214	551 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UTR4	YEL038W	ORM1	P53224	222 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UTR4	YEL038W	YGR066C	P53242	292 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UTR4	YEL038W	NGL2	Q03264	515 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
UTR4	YEL038W	YAP6	Q03935	383 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UTR4	YEL038W	CTS2	Q06350	511 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UTR4	YEL038W	MCH4	Q08268	501 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UTR4	YEL038W	NIP7	Q08962	181 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
UTR4	YEL038W	ORT1	Q12375	292 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UTR4	YEL038W	YJR112W-A	Q3E743	109 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UTR4	YEL038W	SCEI	P03882	235 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UTR4	YEL038W	DFR1	P07807	211 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.57	□□□□□ -1.68	not detected
UTR4	YEL038W	NHP6B	P11633	99 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
UTR4	YEL038W	CDC23	P16522	626 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UTR4	YEL038W	RNA14	P25298	677 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68

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