RNA–Protein interactions for RNA: YCL057W

PRD1, Transcript of Zinc metalloendopeptidase, yeastyeast

Gene PRD1, Length 2,139 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PRD1YCL057W OCA2P53949 197 aa4.16□□□□□ -1.74
PRD1YCL057W HXT11P54862 567 aa4.16□□□□□ -1.74
PRD1YCL057W YPL113CQ02961 396 aa4.16□□□□□ -1.74
PRD1YCL057W YMR279CQ03263 540 aa4.16□□□□□ -1.74
PRD1YCL057W YMR252CQ04814 134 aa4.16□□□□□ -1.74
PRD1YCL057W SCP1Q08873 200 aa4.16□□□□□ -1.74
PRD1YCL057W PEX11Q12462 236 aa4.16□□□□□ -1.74
PRD1YCL057W PAR32Q12515 295 aaKnown RBP4.16□□□□□ -1.74
PRD1YCL057W PCC1Q3E833 88 aa4.16□□□□□ -1.74
PRD1YCL057W YPR096CO13587 100 aa4.15□□□□□ -1.74
PRD1YCL057W MCK1P21965 375 aaKnown RBP4.15□□□□□ -1.74
PRD1YCL057W TRX3P25372 127 aa4.15□□□□□ -1.74
PRD1YCL057W NAM9P27929 486 aa4.15□□□□□ -1.74
PRD1YCL057W SFC1P33303 322 aa4.15□□□□□ -1.74
PRD1YCL057W SKN1P33336 771 aa4.15□□□□□ -1.74
PRD1YCL057W SHE2P36068 246 aaKnown RBP RIP-Chip data4.15□□□□□ -1.74not detected
PRD1YCL057W YHR177WP38867 453 aa4.15□□□□□ -1.74
PRD1YCL057W CAT5P41735 233 aa4.15□□□□□ -1.74
PRD1YCL057W LSM8P47093 109 aaKnown RBP4.15□□□□□ -1.74
PRD1YCL057W GOR1P53839 350 aa4.15□□□□□ -1.74
PRD1YCL057W ELP6Q04868 273 aa4.15□□□□□ -1.74
PRD1YCL057W RNH202Q05635 350 aa4.15□□□□□ -1.74
PRD1YCL057W SKI7Q08491 747 aaPredicted RBP4.15□□□□□ -1.74
PRD1YCL057W PRB1P09232 635 aa4.15□□□□□ -1.75
PRD1YCL057W PRE7P23724 241 aaKnown RBP4.15□□□□□ -1.75
PRD1YCL057W MKK1P32490 508 aa4.15□□□□□ -1.75
PRD1YCL057W SOL2P37262 315 aa4.15□□□□□ -1.75
PRD1YCL057W RRN10P38204 145 aa4.15□□□□□ -1.75
PRD1YCL057W INM1P38710 295 aa4.15□□□□□ -1.75
PRD1YCL057W RCY1P39531 840 aa4.15□□□□□ -1.75
PRD1YCL057W MEP1P40260 492 aa4.15□□□□□ -1.75
PRD1YCL057W GLR1P41921 483 aaKnown RBP4.15□□□□□ -1.75
PRD1YCL057W YGL159WP53110 370 aa4.15□□□□□ -1.75
PRD1YCL057W OST6Q03723 332 aa4.15□□□□□ -1.75
PRD1YCL057W YOR387CQ08910 206 aa4.15□□□□□ -1.75
PRD1YCL057W YOR289WQ12012 251 aaPredicted RBP4.15□□□□□ -1.75
PRD1YCL057W SFM1Q12314 213 aa4.15□□□□□ -1.75
PRD1YCL057W ORT1Q12375 292 aa4.15□□□□□ -1.75
PRD1YCL057W VPS13Q07878 3144 aa4.14□□□□□ -1.75
PRD1YCL057W ILV5P06168 395 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
PRD1YCL057W KIN28P06242 306 aa4.14□□□□□ -1.75
PRD1YCL057W ARG80P07249 177 aa4.14□□□□□ -1.75
PRD1YCL057W REV1P12689 985 aa4.14□□□□□ -1.75
PRD1YCL057W ERD1P16151 362 aa4.14□□□□□ -1.75
PRD1YCL057W APA2P22108 325 aa4.14□□□□□ -1.75
PRD1YCL057W AHC2P25649 128 aa4.14□□□□□ -1.75
PRD1YCL057W FUN26P31381 517 aa4.14□□□□□ -1.75
PRD1YCL057W SUR1P33300 382 aa4.14□□□□□ -1.75
PRD1YCL057W YPT52P36018 234 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
PRD1YCL057W VPS51P36116 164 aa4.14□□□□□ -1.75
PRD1YCL057W PAU24P38155 120 aa4.14□□□□□ -1.75
PRD1YCL057W PTH1P38876 190 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
PRD1YCL057W ALP1P38971 573 aa4.14□□□□□ -1.75
PRD1YCL057W YAL037WP39728 267 aa4.14□□□□□ -1.75
PRD1YCL057W RTT105P40063 208 aa4.14□□□□□ -1.75
PRD1YCL057W UTP25P40498 721 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
PRD1YCL057W YJL213WP40896 331 aa4.14□□□□□ -1.75
PRD1YCL057W UFE1P41834 346 aa4.14□□□□□ -1.75
PRD1YCL057W NSE4P43124 402 aa4.14□□□□□ -1.75
PRD1YCL057W YJL016WP47072 561 aa4.14□□□□□ -1.75
PRD1YCL057W YJR111CP47148 283 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
PRD1YCL057W RRN11Q04712 507 aa4.14□□□□□ -1.75
PRD1YCL057W YLR456WQ06199 204 aa4.14□□□□□ -1.75
PRD1YCL057W YLR012CQ07927 99 aa4.14□□□□□ -1.75
PRD1YCL057W PSF1Q12488 208 aa4.14□□□□□ -1.75
PRD1YCL057W SNF6P18888 332 aa4.13□□□□□ -1.75
PRD1YCL057W EXG1P23776 448 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
PRD1YCL057W ITR1P30605 584 aa4.13□□□□□ -1.75
PRD1YCL057W KRE6P32486 720 aa4.13□□□□□ -1.75
PRD1YCL057W SUA5P32579 426 aa4.13□□□□□ -1.75
PRD1YCL057W CDC13P32797 924 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
PRD1YCL057W MDL1P33310 695 aa4.13□□□□□ -1.75
PRD1YCL057W MRPL40P36534 297 aa4.13□□□□□ -1.75
PRD1YCL057W GTT1P40582 234 aa4.13□□□□□ -1.75
PRD1YCL057W RPE1P46969 238 aa4.13□□□□□ -1.75
PRD1YCL057W DOC1P53068 250 aa4.13□□□□□ -1.75
PRD1YCL057W YGR015CP53208 328 aa4.13□□□□□ -1.75
PRD1YCL057W YNR048WP53740 393 aa4.13□□□□□ -1.75
PRD1YCL057W ASI3P53983 676 aa4.13□□□□□ -1.75
PRD1YCL057W MRP51Q02950 344 aa4.13□□□□□ -1.75
PRD1YCL057W IPK1Q06667 281 aa4.13□□□□□ -1.75
PRD1YCL057W RRP42Q12277 265 aaPredicted RBP4.13□□□□□ -1.75
PRD1YCL057W MED4Q12343 284 aa4.13□□□□□ -1.75
PRD1YCL057W PCL9Q12477 304 aa4.13□□□□□ -1.75
PRD1YCL057W YMR230W-AQ3E7B5 62 aa4.13□□□□□ -1.75
PRD1YCL057W ZWF1P11412 505 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
PRD1YCL057W TIP1P27654 210 aaPredicted RBP4.13□□□□□ -1.75
PRD1YCL057W YBL010CP32788 280 aa4.13□□□□□ -1.75
PRD1YCL057W EMP24P32803 203 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
PRD1YCL057W ARC19P33204 171 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
PRD1YCL057W FMP46P36141 133 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
PRD1YCL057W COS8P38723 381 aa4.13□□□□□ -1.75
PRD1YCL057W TVP23P38962 199 aa4.13□□□□□ -1.75
PRD1YCL057W LYS1P38998 373 aaRIP-Chip data4.13□□□□□ -1.75not detected
PRD1YCL057W AIM2P39721 246 aa4.13□□□□□ -1.75
PRD1YCL057W PMT5P52867 743 aa4.13□□□□□ -1.75
PRD1YCL057W SDT1P53078 280 aa4.13□□□□□ -1.75
PRD1YCL057W MNT4P53745 580 aa4.13□□□□□ -1.75
PRD1YCL057W MTQ1P53944 314 aa4.13□□□□□ -1.75
PRD1YCL057W GPI15P53961 229 aa4.13□□□□□ -1.75
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