RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568388.5

SPNS1-210, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 3

Gene SPNS1, Length 759 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-210ENST00000568388 SERPINC1P01008 464 aa20.32■□□□□ 0.84
SPNS1-210ENST00000568388 TPM2P07951 284 aa20.32■□□□□ 0.84
SPNS1-210ENST00000568388 SYN1P17600 705 aa20.32■□□□□ 0.84
SPNS1-210ENST00000568388 OSTNP61366 133 aa20.32■□□□□ 0.84
SPNS1-210ENST00000568388 SLC10A6Q3KNW5 377 aa20.32■□□□□ 0.84
SPNS1-210ENST00000568388 FILIP1LQ4L180 1135 aa20.32■□□□□ 0.84
SPNS1-210ENST00000568388 VWA3BQ502W6 1294 aa20.32■□□□□ 0.84
SPNS1-210ENST00000568388 C1orf220Q5T0J3 134 aa20.32■□□□□ 0.84
SPNS1-210ENST00000568388 ALKAL1Q6UXT8 129 aa20.32■□□□□ 0.84
SPNS1-210ENST00000568388 LINC01599Q8WXQ3 324 aa20.32■□□□□ 0.84
SPNS1-210ENST00000568388 TSPAN18Q96SJ8 248 aa20.32■□□□□ 0.84
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SPNS1-210ENST00000568388 SNTG2Q9NY99 539 aa20.32■□□□□ 0.84
SPNS1-210ENST00000568388 TAB2Q9NYJ8 693 aa20.32■□□□□ 0.84
SPNS1-210ENST00000568388 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
SPNS1-210ENST00000568388 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
SPNS1-210ENST00000568388 AP5Z1O43299 807 aa20.31■□□□□ 0.84
SPNS1-210ENST00000568388 STX10O60499 249 aa20.31■□□□□ 0.84
SPNS1-210ENST00000568388 EOMESO95936 686 aa20.31■□□□□ 0.84
SPNS1-210ENST00000568388 GTF2H1P32780 548 aa20.31■□□□□ 0.84
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SPNS1-210ENST00000568388 TCTN1Q2MV58 587 aa20.31■□□□□ 0.84
SPNS1-210ENST00000568388 XKR4Q5GH76 650 aa20.31■□□□□ 0.84
SPNS1-210ENST00000568388 DEFB128Q7Z7B8 93 aa20.31■□□□□ 0.84
SPNS1-210ENST00000568388 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
SPNS1-210ENST00000568388 ECHDC2Q86YB7 292 aa20.31■□□□□ 0.84
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SPNS1-210ENST00000568388 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
SPNS1-210ENST00000568388 GDF15Q99988 308 aa20.31■□□□□ 0.84
SPNS1-210ENST00000568388 VPS16Q9H269 839 aa20.31■□□□□ 0.84
SPNS1-210ENST00000568388 NDST4Q9H3R1 872 aa20.31■□□□□ 0.84
SPNS1-210ENST00000568388 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
SPNS1-210ENST00000568388 PDE11AQ9HCR9 933 aa20.31■□□□□ 0.84
SPNS1-210ENST00000568388 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
SPNS1-210ENST00000568388 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
SPNS1-210ENST00000568388 HES2Q9Y543 173 aa20.31■□□□□ 0.84
SPNS1-210ENST00000568388 LACTBL1A8MY62 500 aa20.3■□□□□ 0.84
SPNS1-210ENST00000568388 PMM2O15305 246 aa20.3■□□□□ 0.84
SPNS1-210ENST00000568388 CBFA2T2O43439 604 aa20.3■□□□□ 0.84
SPNS1-210ENST00000568388 CXCL8P10145 99 aa20.3■□□□□ 0.84
SPNS1-210ENST00000568388 ITGA4P13612 1032 aa20.3■□□□□ 0.84
SPNS1-210ENST00000568388 CSF2RAP15509 400 aa20.3■□□□□ 0.84
SPNS1-210ENST00000568388 AP3M2P53677 418 aa20.3■□□□□ 0.84
SPNS1-210ENST00000568388 DLG4P78352 724 aa20.3■□□□□ 0.84
SPNS1-210ENST00000568388 NT5DC4Q86YG4 428 aa20.3■□□□□ 0.84
SPNS1-210ENST00000568388 CCDC127Q96BQ5 260 aa20.3■□□□□ 0.84
SPNS1-210ENST00000568388 FNBP1Q96RU3 617 aa20.3■□□□□ 0.84
SPNS1-210ENST00000568388 CGRRF1Q99675 332 aa20.3■□□□□ 0.84
SPNS1-210ENST00000568388 RNF39Q9H2S5 420 aa20.3■□□□□ 0.84
SPNS1-210ENST00000568388 IL23AQ9NPF7 189 aa20.3■□□□□ 0.84
SPNS1-210ENST00000568388 UBN1Q9NPG3 1134 aa20.3■□□□□ 0.84
SPNS1-210ENST00000568388 IFNKQ9P0W0 207 aa20.3■□□□□ 0.84
SPNS1-210ENST00000568388 PCDH10Q9P2E7 1040 aa20.3■□□□□ 0.84
SPNS1-210ENST00000568388 GIT1Q9Y2X7 761 aa20.3■□□□□ 0.84
SPNS1-210ENST00000568388 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
SPNS1-210ENST00000568388 LGALS16A8MUM7 142 aa20.29■□□□□ 0.84
SPNS1-210ENST00000568388 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa20.29■□□□□ 0.84
SPNS1-210ENST00000568388 RECQL4O94761 1208 aa20.29■□□□□ 0.84
SPNS1-210ENST00000568388 AFPP02771 609 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
SPNS1-210ENST00000568388 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
SPNS1-210ENST00000568388 WNT7BP56706 349 aa20.29■□□□□ 0.84
SPNS1-210ENST00000568388 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP20.29■□□□□ 0.847e-11■■■■■ 39.8
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SPNS1-210ENST00000568388 TCERG1LQ5VWI1 586 aa20.29■□□□□ 0.84
SPNS1-210ENST00000568388 WDR49Q8IV35 697 aa20.29■□□□□ 0.84
SPNS1-210ENST00000568388 SNX27Q96L92 541 aa20.29■□□□□ 0.84
SPNS1-210ENST00000568388 TRIM5Q9C035 493 aa20.29■□□□□ 0.84
SPNS1-210ENST00000568388 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
SPNS1-210ENST00000568388 CNTN3Q9P232 1028 aa20.29■□□□□ 0.84
SPNS1-210ENST00000568388 PARP2Q9UGN5 583 aa20.29■□□□□ 0.84
SPNS1-210ENST00000568388 DERAQ9Y315 318 aa20.29■□□□□ 0.84
SPNS1-210ENST00000568388 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
SPNS1-210ENST00000568388 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa20.28■□□□□ 0.84
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SPNS1-210ENST00000568388 P4HA2O15460 535 aa20.28■□□□□ 0.84
SPNS1-210ENST00000568388 EFCAB14O75071 495 aa20.28■□□□□ 0.84
SPNS1-210ENST00000568388 TRIM49P0CI25 452 aa20.28■□□□□ 0.84
SPNS1-210ENST00000568388 TRIM49CP0CI26 452 aa20.28■□□□□ 0.84
SPNS1-210ENST00000568388 AKAP5P24588 427 aa20.28■□□□□ 0.84
SPNS1-210ENST00000568388 PPP3CAQ08209 521 aa20.28■□□□□ 0.84
SPNS1-210ENST00000568388 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
SPNS1-210ENST00000568388 AGMOQ6ZNB7 445 aa20.28■□□□□ 0.84
SPNS1-210ENST00000568388 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa20.28■□□□□ 0.84
SPNS1-210ENST00000568388 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
SPNS1-210ENST00000568388 TMEM161AQ9NX61 479 aa20.28■□□□□ 0.84
SPNS1-210ENST00000568388 C2CD2Q9Y426 696 aa20.28■□□□□ 0.84
SPNS1-210ENST00000568388 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
SPNS1-210ENST00000568388 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
SPNS1-210ENST00000568388 INPPL1O15357 1258 aa20.27■□□□□ 0.84
SPNS1-210ENST00000568388 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
SPNS1-210ENST00000568388 TPM3P06753 285 aa20.27■□□□□ 0.84
SPNS1-210ENST00000568388 DLATP10515 647 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
SPNS1-210ENST00000568388 KCNE1P15382 129 aa20.27■□□□□ 0.84
SPNS1-210ENST00000568388 TNNI1P19237 187 aa20.27■□□□□ 0.84
SPNS1-210ENST00000568388 FMO5P49326 533 aa20.27■□□□□ 0.84
SPNS1-210ENST00000568388 PLCB2Q00722 1185 aa20.27■□□□□ 0.84
SPNS1-210ENST00000568388 FPGSQ05932 587 aa20.27■□□□□ 0.84
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