RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557549.5

RBM23-231, Transcript of RNA binding motif protein 23, human

TSL 3

Gene RBM23, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM23-231	ENST00000557549	TMEM175	Q9BSA9	504 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RBM23-231	ENST00000557549	TARS2	Q9BW92	718 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
RBM23-231	ENST00000557549	ZBP1	Q9H171	429 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RBM23-231	ENST00000557549	SNTG2	Q9NY99	539 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RBM23-231	ENST00000557549	CHMP5	Q9NZZ3	219 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RBM23-231	ENST00000557549	TBX20	Q9UMR3	447 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RBM23-231	ENST00000557549	C5orf42	Q9H799	3197 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RBM23-231	ENST00000557549	PVALEF	A0A1B0GWK0	134 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RBM23-231	ENST00000557549		F8W810	466 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RBM23-231	ENST00000557549	CLASP2	O75122	1294 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
RBM23-231	ENST00000557549	PPP1R37	O75864	691 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RBM23-231	ENST00000557549	CTSA	P10619	480 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RBM23-231	ENST00000557549	IDE	P14735	1019 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RBM23-231	ENST00000557549	PFKFB1	P16118	471 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RBM23-231	ENST00000557549	GRM5	P41594	1212 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RBM23-231	ENST00000557549	OR1G1	P47890	313 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RBM23-231	ENST00000557549	DSC1	Q08554	894 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RBM23-231	ENST00000557549	COASY	Q13057	564 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RBM23-231	ENST00000557549	SMAD4	Q13485	552 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
RBM23-231	ENST00000557549	SMAD2	Q15796	467 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
RBM23-231	ENST00000557549	ZNF568	Q3ZCX4	644 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RBM23-231	ENST00000557549	HERC4	Q5GLZ8	1057 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
RBM23-231	ENST00000557549	STXBP4	Q6ZWJ1	553 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RBM23-231	ENST00000557549	SFR1	Q86XK3	245 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RBM23-231	ENST00000557549	MAP4K3	Q8IVH8	894 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RBM23-231	ENST00000557549	GJD3	Q8N144	294 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RBM23-231	ENST00000557549	CCDC34	Q96HJ3	373 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RBM23-231	ENST00000557549	CDCA3	Q99618	268 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
RBM23-231	ENST00000557549	TCHP	Q9BT92	498 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RBM23-231	ENST00000557549	STRA6	Q9BX79	667 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RBM23-231	ENST00000557549	TOPORS	Q9NS56	1045 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
RBM23-231	ENST00000557549	PANK4	Q9NVE7	773 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RBM23-231	ENST00000557549	MARCH5	Q9NX47	278 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RBM23-231	ENST00000557549	EXOC7	Q9UPT5	735 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RBM23-231	ENST00000557549	PRG3	Q9Y2Y8	225 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
RBM23-231	ENST00000557549	PCDHB13	Q9Y5F0	798 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RBM23-231	ENST00000557549	ZC3H11B	A0A1B0GUI2	810 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
RBM23-231	ENST00000557549		A0A1B0GVL5	298 aa		13.48	□□□□□ -0.25
RBM23-231	ENST00000557549	ABLIM1	O14639	778 aa		13.48	□□□□□ -0.25
RBM23-231	ENST00000557549	CLDN3	O15551	220 aa		13.48	□□□□□ -0.25
RBM23-231	ENST00000557549	SYK	P43405	635 aa		13.48	□□□□□ -0.25
RBM23-231	ENST00000557549	POU5F1	Q01860	360 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
RBM23-231	ENST00000557549	MCL1	Q07820	350 aa		13.48	□□□□□ -0.25
RBM23-231	ENST00000557549	GRIK3	Q13003	919 aa		13.48	□□□□□ -0.25
RBM23-231	ENST00000557549	SLFN12L	Q6IEE8	588 aa		13.48	□□□□□ -0.25
RBM23-231	ENST00000557549	TMEM184A	Q6ZMB5	413 aa		13.48	□□□□□ -0.25
RBM23-231	ENST00000557549	TAS1R1	Q7RTX1	841 aa		13.48	□□□□□ -0.25
RBM23-231	ENST00000557549	SMRP1	Q8NCR6	262 aa		13.48	□□□□□ -0.25
RBM23-231	ENST00000557549	RABGGTA	Q92696	567 aa		13.48	□□□□□ -0.25
RBM23-231	ENST00000557549	RPS6KC1	Q96S38	1066 aa		13.48	□□□□□ -0.25
RBM23-231	ENST00000557549	CCDC94	Q9BW85	323 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
RBM23-231	ENST00000557549	APOL5	Q9BWW9	433 aa		13.48	□□□□□ -0.25
RBM23-231	ENST00000557549	CDT1	Q9H211	546 aa		13.48	□□□□□ -0.25
RBM23-231	ENST00000557549	EPHX3	Q9H6B9	360 aa		13.48	□□□□□ -0.25
RBM23-231	ENST00000557549	MRPL44	Q9H9J2	332 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
RBM23-231	ENST00000557549	CACNG4	Q9UBN1	327 aa		13.48	□□□□□ -0.25
RBM23-231	ENST00000557549	FAM50B	Q9Y247	325 aa		13.48	□□□□□ -0.25
RBM23-231	ENST00000557549	GTF3C5	Q9Y5Q8	519 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
RBM23-231	ENST00000557549	PDCD11	Q14690	1871 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
RBM23-231	ENST00000557549	GOLGA6L4	A6NEF3	574 aa		13.47	□□□□□ -0.25
RBM23-231	ENST00000557549	PTGES	O14684	152 aa		13.47	□□□□□ -0.25
RBM23-231	ENST00000557549	HNRNPDL	O14979	420 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
RBM23-231	ENST00000557549	ACTN4	O43707	911 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
RBM23-231	ENST00000557549	NR1I2	O75469	434 aa		13.47	□□□□□ -0.25
RBM23-231	ENST00000557549	RECQL4	O94761	1208 aa		13.47	□□□□□ -0.25
RBM23-231	ENST00000557549	NMT1	P30419	496 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
RBM23-231	ENST00000557549	SSTR3	P32745	418 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
RBM23-231	ENST00000557549	LIG4	P49917	911 aa		13.47	□□□□□ -0.25
RBM23-231	ENST00000557549	YARS	P54577	528 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
RBM23-231	ENST00000557549	ASIC1	P78348	528 aa		13.47	□□□□□ -0.25
RBM23-231	ENST00000557549	ZP2	Q05996	745 aa		13.47	□□□□□ -0.25
RBM23-231	ENST00000557549	NOLC1	Q14978	699 aa	Known RBP eCLIP	13.47	□□□□□ -0.25
RBM23-231	ENST00000557549	POSTN	Q15063	836 aa		13.47	□□□□□ -0.25
RBM23-231	ENST00000557549	ANKRD54	Q6NXT1	300 aa		13.47	□□□□□ -0.25
RBM23-231	ENST00000557549	KANK3	Q6NY19	840 aa		13.47	□□□□□ -0.25
RBM23-231	ENST00000557549	SYCE2	Q6PIF2	218 aa		13.47	□□□□□ -0.25
RBM23-231	ENST00000557549	UNC13D	Q70J99	1090 aa		13.47	□□□□□ -0.25
RBM23-231	ENST00000557549	BICD1	Q96G01	975 aa		13.47	□□□□□ -0.25
RBM23-231	ENST00000557549	CHAMP1	Q96JM3	812 aa		13.47	□□□□□ -0.25
RBM23-231	ENST00000557549	TSPAN18	Q96SJ8	248 aa		13.47	□□□□□ -0.25
RBM23-231	ENST00000557549	PAAF1	Q9BRP4	392 aa		13.47	□□□□□ -0.25
RBM23-231	ENST00000557549	S1PR5	Q9H228	398 aa		13.47	□□□□□ -0.25
RBM23-231	ENST00000557549	TMEM206	Q9H813	350 aa		13.47	□□□□□ -0.25
RBM23-231	ENST00000557549	PRKAG3	Q9UGI9	489 aa		13.47	□□□□□ -0.25
RBM23-231	ENST00000557549	GDA	Q9Y2T3	454 aa		13.47	□□□□□ -0.25
RBM23-231	ENST00000557549	USP15	Q9Y4E8	981 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
RBM23-231	ENST00000557549	HCFC2	Q9Y5Z7	792 aa		13.47	□□□□□ -0.25
RBM23-231	ENST00000557549	IRAK3	Q9Y616	596 aa		13.47	□□□□□ -0.25
RBM23-231	ENST00000557549	STYXL1	Q9Y6J8	313 aa		13.47	□□□□□ -0.25
RBM23-231	ENST00000557549	FSD2	A1L4K1	749 aa		13.46	□□□□□ -0.25
RBM23-231	ENST00000557549	C19orf67	A6NJJ6	358 aa		13.46	□□□□□ -0.25
RBM23-231	ENST00000557549	LILRB3	O75022	631 aa		13.46	□□□□□ -0.25
RBM23-231	ENST00000557549	EFEMP2	O95967	443 aa		13.46	□□□□□ -0.25
RBM23-231	ENST00000557549	TH	P07101	528 aa		13.46	□□□□□ -0.25
RBM23-231	ENST00000557549	NDUFA8	P51970	172 aa		13.46	□□□□□ -0.25
RBM23-231	ENST00000557549	EHHADH	Q08426	723 aa		13.46	□□□□□ -0.25
RBM23-231	ENST00000557549	BMS1	Q14692	1282 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25
RBM23-231	ENST00000557549	PTPN14	Q15678	1187 aa		13.46	□□□□□ -0.25
RBM23-231	ENST00000557549	XKR4	Q5GH76	650 aa		13.46	□□□□□ -0.25
RBM23-231	ENST00000557549	L1TD1	Q5T7N2	865 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25

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