RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000506464.5

ABCC3-208, Transcript of ATP binding cassette subfamily C member 3, human

TSL 4

Gene ABCC3, Length 540 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ABCC3-208	ENST00000506464	LONP1	P36776	959 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
ABCC3-208	ENST00000506464	UBA7	P41226	1012 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ABCC3-208	ENST00000506464	MAPK7	Q13164	816 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ABCC3-208	ENST00000506464	PKP1	Q13835	747 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ABCC3-208	ENST00000506464	PTPA	Q15257	358 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ABCC3-208	ENST00000506464	ZNF568	Q3ZCX4	644 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ABCC3-208	ENST00000506464	EEF1DP3	Q658K8	133 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ABCC3-208	ENST00000506464	TMC5	Q6UXY8	1006 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ABCC3-208	ENST00000506464	HFE2	Q6ZVN8	426 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ABCC3-208	ENST00000506464	RTL10	Q7L3V2	364 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ABCC3-208	ENST00000506464	TAS1R1	Q7RTX1	841 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ABCC3-208	ENST00000506464	SUGP1	Q8IWZ8	645 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
ABCC3-208	ENST00000506464	DAW1	Q8N136	415 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ABCC3-208	ENST00000506464	RIN2	Q8WYP3	895 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
ABCC3-208	ENST00000506464	PIK3R5	Q8WYR1	880 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ABCC3-208	ENST00000506464	DDX27	Q96GQ7	796 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
ABCC3-208	ENST00000506464	TTPAL	Q9BTX7	342 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ABCC3-208	ENST00000506464	RUSC1	Q9BVN2	902 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ABCC3-208	ENST00000506464	GPR62	Q9BZJ7	368 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ABCC3-208	ENST00000506464	ODF2L	Q9ULJ1	636 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ABCC3-208	ENST00000506464	CLIC4	Q9Y696	253 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ABCC3-208	ENST00000506464	C2CD4D	B7Z1M9	353 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ABCC3-208	ENST00000506464	TOM1L1	O75674	476 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ABCC3-208	ENST00000506464	PLA2G4B	P0C869	781 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ABCC3-208	ENST00000506464	PDIA4	P13667	645 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
ABCC3-208	ENST00000506464	NUBP1	P53384	320 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ABCC3-208	ENST00000506464	SLC12A3	P55017	1021 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ABCC3-208	ENST00000506464	GRIN1	Q05586	938 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ABCC3-208	ENST00000506464	ZRSR1	Q15695	479 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
ABCC3-208	ENST00000506464	NAB2	Q15742	525 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ABCC3-208	ENST00000506464	KYAT1	Q16773	422 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ABCC3-208	ENST00000506464	TMEM119	Q4V9L6	283 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ABCC3-208	ENST00000506464	XKR4	Q5GH76	650 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ABCC3-208	ENST00000506464	DCLRE1A	Q6PJP8	1040 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ABCC3-208	ENST00000506464	MPZL3	Q6UWV2	235 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ABCC3-208	ENST00000506464	ZPBP2	Q6X784	338 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ABCC3-208	ENST00000506464	PDZRN4	Q6ZMN7	1036 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
ABCC3-208	ENST00000506464	KCNK18	Q7Z418	384 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ABCC3-208	ENST00000506464	C12orf76	Q8N812	135 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
ABCC3-208	ENST00000506464	PBXIP1	Q96AQ6	731 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ABCC3-208	ENST00000506464	PNMA5	Q96PV4	448 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ABCC3-208	ENST00000506464	PPP1R10	Q96QC0	940 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
ABCC3-208	ENST00000506464	USP28	Q96RU2	1077 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ABCC3-208	ENST00000506464	CDT1	Q9H211	546 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ABCC3-208	ENST00000506464	PTPRH	Q9HD43	1115 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ABCC3-208	ENST00000506464	RAPGEFL1	Q9UHV5	662 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ABCC3-208	ENST00000506464	GDA	Q9Y2T3	454 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ABCC3-208	ENST00000506464	PLXNA3	P51805	1871 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ABCC3-208	ENST00000506464	CCDC195	A0A1B0GUA6	201 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ABCC3-208	ENST00000506464	CASTOR2	A6NHX0	329 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ABCC3-208	ENST00000506464	KIF4A	O95239	1232 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ABCC3-208	ENST00000506464	EDN1	P05305	212 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ABCC3-208	ENST00000506464	ZSCAN22	P10073	491 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
ABCC3-208	ENST00000506464	PROZ	P22891	400 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ABCC3-208	ENST00000506464	HOXA9	P31269	272 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ABCC3-208	ENST00000506464	FAM171A1	Q5VUB5	890 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ABCC3-208	ENST00000506464	LILRA6	Q6PI73	481 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ABCC3-208	ENST00000506464	FBXL6	Q8N531	539 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ABCC3-208	ENST00000506464	KREMEN2	Q8NCW0	462 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ABCC3-208	ENST00000506464	NXPE3	Q969Y0	559 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ABCC3-208	ENST00000506464	ACAP3	Q96P50	834 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ABCC3-208	ENST00000506464	TCHP	Q9BT92	498 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ABCC3-208	ENST00000506464	WDR6	Q9NNW5	1121 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
ABCC3-208	ENST00000506464	MORC2	Q9Y6X9	1032 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
ABCC3-208	ENST00000506464	TECTA	O75443	2155 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ABCC3-208	ENST00000506464	SMIM28	A0A1B0GU29	152 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ABCC3-208	ENST00000506464		F8W810	466 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ABCC3-208	ENST00000506464	SLC16A4	O15374	487 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ABCC3-208	ENST00000506464	TGM5	O43548	720 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ABCC3-208	ENST00000506464	B3GAT3	O94766	335 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ABCC3-208	ENST00000506464	F13A1	P00488	732 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ABCC3-208	ENST00000506464	POU2F2	P09086	479 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ABCC3-208	ENST00000506464	HNRNPA1	P09651	372 aa	Known RBP eCLIP	13.39	□□□□□ -0.27
ABCC3-208	ENST00000506464	MAPT	P10636	758 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
ABCC3-208	ENST00000506464	KCNE1	P15382	129 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ABCC3-208	ENST00000506464	NASP	P49321	788 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
ABCC3-208	ENST00000506464	NOLC1	Q14978	699 aa	Known RBP eCLIP	13.39	□□□□□ -0.27
ABCC3-208	ENST00000506464	PSMD5	Q16401	504 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ABCC3-208	ENST00000506464	UPP1	Q16831	310 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ABCC3-208	ENST00000506464	RTP2	Q5QGT7	225 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ABCC3-208	ENST00000506464	LIN9	Q5TKA1	542 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ABCC3-208	ENST00000506464	FOXD4L5	Q5VV16	416 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
ABCC3-208	ENST00000506464	ALKAL1	Q6UXT8	129 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ABCC3-208	ENST00000506464	TMEM161B	Q8NDZ6	487 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ABCC3-208	ENST00000506464	RASSF8	Q8NHQ8	419 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ABCC3-208	ENST00000506464	FOXD4L4	Q8WXT5	416 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
ABCC3-208	ENST00000506464	TSPAN18	Q96SJ8	248 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ABCC3-208	ENST00000506464	TARS2	Q9BW92	718 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
ABCC3-208	ENST00000506464	IRF2BPL	Q9H1B7	796 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ABCC3-208	ENST00000506464	POLD4	Q9HCU8	107 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ABCC3-208	ENST00000506464	CNTN3	Q9P232	1028 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ABCC3-208	ENST00000506464	IGSF9	Q9P2J2	1179 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ABCC3-208	ENST00000506464	FBXO2	Q9UK22	296 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
ABCC3-208	ENST00000506464	ZFP37	Q9Y6Q3	630 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
ABCC3-208	ENST00000506464	C2orf16	Q68DN1	1984 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ABCC3-208	ENST00000506464	CIT	O14578	2027 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ABCC3-208	ENST00000506464	CLUH	O75153	1309 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ABCC3-208	ENST00000506464	CLDN3	O15551	220 aa		13.38	□□□□□ -0.27
ABCC3-208	ENST00000506464	ZMYND10	O75800	440 aa		13.38	□□□□□ -0.27
ABCC3-208	ENST00000506464	WEE2	P0C1S8	567 aa		13.38	□□□□□ -0.27

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.1 ms