RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493441.5

SMYD3-217, Transcript of SET and MYND domain containing 3, humanhuman

TSL 2

Gene SMYD3, Length 823 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD3-217ENST00000493441 ARFIP2P53365 341 aa8.5□□□□□ -1.05
SMYD3-217ENST00000493441 GRM1Q13255 1194 aa8.5□□□□□ -1.05
SMYD3-217ENST00000493441 AOC3Q16853 763 aa8.5□□□□□ -1.05
SMYD3-217ENST00000493441 LYPD4Q6UWN0 246 aa8.5□□□□□ -1.05
SMYD3-217ENST00000493441 BEND4Q6ZU67 534 aa8.5□□□□□ -1.05
SMYD3-217ENST00000493441 GALNT5Q7Z7M9 940 aa8.5□□□□□ -1.05
SMYD3-217ENST00000493441 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa8.5□□□□□ -1.05
SMYD3-217ENST00000493441 SEC14L1Q92503 715 aa8.5□□□□□ -1.05
SMYD3-217ENST00000493441 IQCDQ96DY2 449 aa8.5□□□□□ -1.05
SMYD3-217ENST00000493441 ASIC4Q96FT7 647 aa8.5□□□□□ -1.05
SMYD3-217ENST00000493441 HHIPL1Q96JK4 782 aa8.5□□□□□ -1.05
SMYD3-217ENST00000493441 CLPTM1LQ96KA5 538 aa8.5□□□□□ -1.05
SMYD3-217ENST00000493441 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
SMYD3-217ENST00000493441 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa8.5□□□□□ -1.05
SMYD3-217ENST00000493441 FAM167BQ9BTA0 163 aa8.5□□□□□ -1.05
SMYD3-217ENST00000493441 CNPPD1Q9BV87 410 aa8.5□□□□□ -1.05
SMYD3-217ENST00000493441 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
SMYD3-217ENST00000493441 JMJD4Q9H9V9 463 aa8.5□□□□□ -1.05
SMYD3-217ENST00000493441 RRAGCQ9HB90 399 aa8.5□□□□□ -1.05
SMYD3-217ENST00000493441 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
SMYD3-217ENST00000493441 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa8.5□□□□□ -1.05
SMYD3-217ENST00000493441 ABCF2Q9UG63 623 aa8.5□□□□□ -1.05
SMYD3-217ENST00000493441 U3KQE9 123 aa8.5□□□□□ -1.05
SMYD3-217ENST00000493441 IQGAP2Q13576 1575 aa8.49□□□□□ -1.05
SMYD3-217ENST00000493441 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
SMYD3-217ENST00000493441 SOAT2O75908 522 aa8.49□□□□□ -1.05
SMYD3-217ENST00000493441 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
SMYD3-217ENST00000493441 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP8.49□□□□□ -1.056e-18■■■□□ 19.1
SMYD3-217ENST00000493441 TERF1P54274 439 aa8.49□□□□□ -1.05
SMYD3-217ENST00000493441 CYP27A1Q02318 531 aa8.49□□□□□ -1.05
SMYD3-217ENST00000493441 RAB39AQ14964 217 aa8.49□□□□□ -1.05
SMYD3-217ENST00000493441 GRIK4Q16099 956 aa8.49□□□□□ -1.05
SMYD3-217ENST00000493441 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa8.49□□□□□ -1.05
SMYD3-217ENST00000493441 MOGAT3Q86VF5 341 aa8.49□□□□□ -1.05
SMYD3-217ENST00000493441 HEATR4Q86WZ0 1026 aa8.49□□□□□ -1.05
SMYD3-217ENST00000493441 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
SMYD3-217ENST00000493441 CREG2Q8IUH2 290 aa8.49□□□□□ -1.05
SMYD3-217ENST00000493441 GLB1L2Q8IW92 636 aa8.49□□□□□ -1.05
SMYD3-217ENST00000493441 NKAIN3Q8N8D7 197 aa8.49□□□□□ -1.05
SMYD3-217ENST00000493441 WFDC12Q8WWY7 111 aa8.49□□□□□ -1.05
SMYD3-217ENST00000493441 TBC1D32Q96NH3 1257 aa8.49□□□□□ -1.05
SMYD3-217ENST00000493441 NELL2Q99435 816 aa8.49□□□□□ -1.05
SMYD3-217ENST00000493441 TRIM54Q9BYV2 358 aa8.49□□□□□ -1.05
SMYD3-217ENST00000493441 DPH1Q9BZG8 443 aa8.49□□□□□ -1.05
SMYD3-217ENST00000493441 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
SMYD3-217ENST00000493441 ADAM7Q9H2U9 754 aa8.49□□□□□ -1.05
SMYD3-217ENST00000493441 KCNF1Q9H3M0 494 aa8.49□□□□□ -1.05
SMYD3-217ENST00000493441 TMEM8AQ9HCN3 771 aa8.49□□□□□ -1.05
SMYD3-217ENST00000493441 CNNM1Q9NRU3 951 aa8.49□□□□□ -1.05
SMYD3-217ENST00000493441 HELLSQ9NRZ9 838 aa8.49□□□□□ -1.05
SMYD3-217ENST00000493441 GJB4Q9NTQ9 266 aa8.49□□□□□ -1.05
SMYD3-217ENST00000493441 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
SMYD3-217ENST00000493441 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
SMYD3-217ENST00000493441 USP21Q9UK80 565 aa8.49□□□□□ -1.05
SMYD3-217ENST00000493441 IQSEC2Q5JU85 1478 aa8.49□□□□□ -1.05
SMYD3-217ENST00000493441 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa8.48□□□□□ -1.05
SMYD3-217ENST00000493441 PIK3R2O00459 728 aa8.48□□□□□ -1.05
SMYD3-217ENST00000493441 ITGA5P08648 1049 aa8.48□□□□□ -1.05
SMYD3-217ENST00000493441 FTH1P19P0C7X4 201 aa8.48□□□□□ -1.05
SMYD3-217ENST00000493441 FAHP16930 419 aa8.48□□□□□ -1.05
SMYD3-217ENST00000493441 FUT4P22083 530 aa8.48□□□□□ -1.05
SMYD3-217ENST00000493441 CTSSP25774 331 aa8.48□□□□□ -1.05
SMYD3-217ENST00000493441 DCAF7P61962 342 aa8.48□□□□□ -1.05
SMYD3-217ENST00000493441 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
SMYD3-217ENST00000493441 CREMQ03060 361 aa8.48□□□□□ -1.05
SMYD3-217ENST00000493441 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
SMYD3-217ENST00000493441 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP8.48□□□□□ -1.05
SMYD3-217ENST00000493441 NOMO1Q15155 1222 aa8.48□□□□□ -1.05
SMYD3-217ENST00000493441 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
SMYD3-217ENST00000493441 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa8.48□□□□□ -1.05
SMYD3-217ENST00000493441 LIN54Q6MZP7 749 aa8.48□□□□□ -1.05
SMYD3-217ENST00000493441 FAM180AQ6UWF9 173 aa8.48□□□□□ -1.05
SMYD3-217ENST00000493441 CLEC10AQ8IUN9 316 aa8.48□□□□□ -1.05
SMYD3-217ENST00000493441 CPOQ8IVL8 374 aa8.48□□□□□ -1.05
SMYD3-217ENST00000493441 RHOT1Q8IXI2 618 aa8.48□□□□□ -1.05
SMYD3-217ENST00000493441 GPR156Q8NFN8 814 aa8.48□□□□□ -1.05
SMYD3-217ENST00000493441 CALML6Q8TD86 181 aa8.48□□□□□ -1.05
SMYD3-217ENST00000493441 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
SMYD3-217ENST00000493441 CENPOQ9BU64 300 aa8.48□□□□□ -1.05
SMYD3-217ENST00000493441 WDCPQ9H6R7 721 aa8.48□□□□□ -1.05
SMYD3-217ENST00000493441 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
SMYD3-217ENST00000493441 TDP1Q9NUW8 608 aa8.48□□□□□ -1.05
SMYD3-217ENST00000493441 CPA4Q9UI42 421 aa8.48□□□□□ -1.05
SMYD3-217ENST00000493441 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa8.48□□□□□ -1.05
SMYD3-217ENST00000493441 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa8.48□□□□□ -1.05
SMYD3-217ENST00000493441 WDR7Q9Y4E6 1490 aa8.48□□□□□ -1.05
SMYD3-217ENST00000493441 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa8.48□□□□□ -1.05
SMYD3-217ENST00000493441 A0A087X0M5 115 aa8.47□□□□□ -1.05
SMYD3-217ENST00000493441 A0A1B0GX30 115 aa8.47□□□□□ -1.05
SMYD3-217ENST00000493441 NFIBO00712 420 aa8.47□□□□□ -1.05
SMYD3-217ENST00000493441 ENDOD1O94919 500 aa8.47□□□□□ -1.05
SMYD3-217ENST00000493441 ATP1A3P13637 1013 aa8.47□□□□□ -1.05
SMYD3-217ENST00000493441 TUBP50607 506 aa8.47□□□□□ -1.05
SMYD3-217ENST00000493441 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
SMYD3-217ENST00000493441 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP8.47□□□□□ -1.053e-7■■■■□ 19.9
SMYD3-217ENST00000493441 SLC45A4Q5BKX6 768 aa8.47□□□□□ -1.05
SMYD3-217ENST00000493441 ZNF765Q7L2R6 523 aa8.47□□□□□ -1.05
SMYD3-217ENST00000493441 LSMEM1Q8N8F7 131 aa8.47□□□□□ -1.05
SMYD3-217ENST00000493441 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
SMYD3-217ENST00000493441 EID2BQ96D98 161 aa8.47□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.1 ms