RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000065330.7

Clk3-201, Transcript of Dual specificity protein kinase CLK3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Clk3, Length 2,496 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk3-201ENSMUST00000065330 Daam2Q80U19 1115 aa20.2■□□□□ 0.82
Clk3-201ENSMUST00000065330 Tnpo2Q99LG2 887 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
Clk3-201ENSMUST00000065330 Mrpl2Q9D773 306 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
Clk3-201ENSMUST00000065330 Ftsj3Q9DBE9 838 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
Clk3-201ENSMUST00000065330 Gm1661E9Q963 441 aa20.2■□□□□ 0.82
Clk3-201ENSMUST00000065330 PrkceP16054 737 aa20.2■□□□□ 0.82
Clk3-201ENSMUST00000065330 Krt19P19001 403 aa20.2■□□□□ 0.82
Clk3-201ENSMUST00000065330 Fmr1P35922 614 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
Clk3-201ENSMUST00000065330 Msh2P43247 935 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
Clk3-201ENSMUST00000065330 UrosP51163 265 aa20.2■□□□□ 0.82
Clk3-201ENSMUST00000065330 Fam193bQ3U2K0 892 aa20.2■□□□□ 0.82
Clk3-201ENSMUST00000065330 Syne3Q4FZC9 975 aa20.2■□□□□ 0.82
Clk3-201ENSMUST00000065330 Znf697Q569E7 569 aa20.2■□□□□ 0.82
Clk3-201ENSMUST00000065330 Trim21Q62191 470 aa20.2■□□□□ 0.82
Clk3-201ENSMUST00000065330 Myef2Q8C854 591 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
Clk3-201ENSMUST00000065330 BrdtQ91Y44 956 aa20.2■□□□□ 0.82
Clk3-201ENSMUST00000065330 Polr3fQ921X6 316 aa20.2■□□□□ 0.82
Clk3-201ENSMUST00000065330 Gtf2ird1Q9JI57 1104 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
Clk3-201ENSMUST00000065330 Ptgdr2Q9Z2J6 382 aa20.2■□□□□ 0.82
Clk3-201ENSMUST00000065330 Sbf2E9PXF8 1872 aa20.2■□□□□ 0.82
Clk3-201ENSMUST00000065330 Bcat1P24288 386 aa20.19■□□□□ 0.82
Clk3-201ENSMUST00000065330 Marcksl1P28667 200 aa20.19■□□□□ 0.82
Clk3-201ENSMUST00000065330 RxrbP28704 520 aa20.19■□□□□ 0.82
Clk3-201ENSMUST00000065330 Mmp20P57748 482 aa20.19■□□□□ 0.82
Clk3-201ENSMUST00000065330 Xlr3bQ6P205 226 aa20.19■□□□□ 0.82
Clk3-201ENSMUST00000065330 Rnf139Q7TMV1 668 aa20.19■□□□□ 0.82
Clk3-201ENSMUST00000065330 Q9CYI0 393 aa20.19■□□□□ 0.82
Clk3-201ENSMUST00000065330 Rab11fip1Q9D620 645 aa20.19■□□□□ 0.82
Clk3-201ENSMUST00000065330 Pdk2Q9JK42 407 aa20.19■□□□□ 0.82
Clk3-201ENSMUST00000065330 Mmrn2A6H6E2 943 aa20.19■□□□□ 0.82
Clk3-201ENSMUST00000065330 Tnfrsf18O35714 228 aa20.19■□□□□ 0.82
Clk3-201ENSMUST00000065330 Klra3Q64329 266 aa20.19■□□□□ 0.82
Clk3-201ENSMUST00000065330 Dnm1lQ8K1M6 742 aa20.19■□□□□ 0.82
Clk3-201ENSMUST00000065330 Wrap53Q8VC51 532 aa20.19■□□□□ 0.82
Clk3-201ENSMUST00000065330 1700109H08RikQ9D9C0 210 aa20.19■□□□□ 0.82
Clk3-201ENSMUST00000065330 Rnf25Q9QZR0 456 aa20.19■□□□□ 0.82
Clk3-201ENSMUST00000065330 SfnO70456 248 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
Clk3-201ENSMUST00000065330 Akr1b8P45377 316 aa20.18■□□□□ 0.82
Clk3-201ENSMUST00000065330 Frg1P97376 258 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
Clk3-201ENSMUST00000065330 Casp7P97864 303 aa20.18■□□□□ 0.82
Clk3-201ENSMUST00000065330 Q3UTZ3 580 aa20.18■□□□□ 0.82
Clk3-201ENSMUST00000065330 Dync1li2Q6PDL0 492 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
Clk3-201ENSMUST00000065330 Spns2Q91VM4 549 aa20.18■□□□□ 0.82
Clk3-201ENSMUST00000065330 PawrQ925B0 333 aa20.18■□□□□ 0.82
Clk3-201ENSMUST00000065330 4930550L24RikQ99PA7 320 aa20.18■□□□□ 0.82
Clk3-201ENSMUST00000065330 Patl2A2ARM1 529 aa20.18■□□□□ 0.82
Clk3-201ENSMUST00000065330 Eftud2O08810 971 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
Clk3-201ENSMUST00000065330 Rhox5P52651 210 aa20.18■□□□□ 0.82
Clk3-201ENSMUST00000065330 Actr2P61161 394 aa20.18■□□□□ 0.82
Clk3-201ENSMUST00000065330 Slc26a7Q8R2Z3 656 aa20.18■□□□□ 0.82
Clk3-201ENSMUST00000065330 Olfr1499Q8VG65 314 aa20.18■□□□□ 0.82
Clk3-201ENSMUST00000065330 Acot11Q8VHQ9 594 aa20.18■□□□□ 0.82
Clk3-201ENSMUST00000065330 1700016D06RikQ9DAA5 166 aa20.18■□□□□ 0.82
Clk3-201ENSMUST00000065330 Gm11549A0A286YD83 63 aa20.17■□□□□ 0.82
Clk3-201ENSMUST00000065330 Casq2O09161 415 aa20.17■□□□□ 0.82
Clk3-201ENSMUST00000065330 CaluO35887 315 aa20.17■□□□□ 0.82
Clk3-201ENSMUST00000065330 TxkP42682 527 aa20.17■□□□□ 0.82
Clk3-201ENSMUST00000065330 NsfP46460 744 aa20.17■□□□□ 0.82
Clk3-201ENSMUST00000065330 Tulp2P46686 562 aa20.17■□□□□ 0.82
Clk3-201ENSMUST00000065330 Agbl1Q09M05 972 aa20.17■□□□□ 0.82
Clk3-201ENSMUST00000065330 ZufspQ3T9Z9 577 aa20.17■□□□□ 0.82
Clk3-201ENSMUST00000065330 Ccdc33Q3ULW6 985 aa20.17■□□□□ 0.82
Clk3-201ENSMUST00000065330 StilQ60988 1262 aa20.17■□□□□ 0.82
Clk3-201ENSMUST00000065330 Iffo1Q8BXL9 562 aa20.17■□□□□ 0.82
Clk3-201ENSMUST00000065330 Vmn1r64Q8R2B8 320 aa20.17■□□□□ 0.82
Clk3-201ENSMUST00000065330 SerhlQ9EPB5 311 aa20.17■□□□□ 0.82
Clk3-201ENSMUST00000065330 Serpinb6cW4VSP4 379 aa20.17■□□□□ 0.82
Clk3-201ENSMUST00000065330 Serpina1eQ00898 413 aa20.17■□□□□ 0.82
Clk3-201ENSMUST00000065330 Tex11Q14AT2 947 aa20.17■□□□□ 0.82
Clk3-201ENSMUST00000065330 Wdr18Q4VBE8 431 aa20.17■□□□□ 0.82
Clk3-201ENSMUST00000065330 Krt12Q64291 487 aa20.17■□□□□ 0.82
Clk3-201ENSMUST00000065330 C8aQ8K182 587 aa20.17■□□□□ 0.82
Clk3-201ENSMUST00000065330 Pcdha2Q91Y17 948 aa20.17■□□□□ 0.82
Clk3-201ENSMUST00000065330 Phf2Q9WTU0 1096 aa20.17■□□□□ 0.82
Clk3-201ENSMUST00000065330 Pds5aQ6A026 1332 aa20.17■□□□□ 0.82
Clk3-201ENSMUST00000065330 PatjQ63ZW7 1834 aa20.17■□□□□ 0.82
Clk3-201ENSMUST00000065330 Grm2Q14BI2 872 aa20.16■□□□□ 0.82
Clk3-201ENSMUST00000065330 Kmt5aQ2YDW7 349 aa20.16■□□□□ 0.82
Clk3-201ENSMUST00000065330 Tmprss11eQ5S248 423 aa20.16■□□□□ 0.82
Clk3-201ENSMUST00000065330 ErfeQ6PGN1 340 aa20.16■□□□□ 0.82
Clk3-201ENSMUST00000065330 Lman1lQ8VCD3 505 aa20.16■□□□□ 0.82
Clk3-201ENSMUST00000065330 Zmynd10Q99ML0 440 aa20.16■□□□□ 0.82
Clk3-201ENSMUST00000065330 PigoQ9JJI6 1093 aa20.16■□□□□ 0.82
Clk3-201ENSMUST00000065330 Ddx20Q9JJY4 825 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
Clk3-201ENSMUST00000065330 Ecel1Q9JMI0 775 aa20.16■□□□□ 0.82
Clk3-201ENSMUST00000065330 Znf394Q9Z1D9 521 aa20.16■□□□□ 0.82
Clk3-201ENSMUST00000065330 Cacna1fQ9JIS7 1985 aa20.16■□□□□ 0.82
Clk3-201ENSMUST00000065330 Taf1Q80UV9 1891 aa20.16■□□□□ 0.82
Clk3-201ENSMUST00000065330 Prdm12A2AJ77 365 aa20.16■□□□□ 0.82
Clk3-201ENSMUST00000065330 Gpr161B2RPY5 545 aa20.16■□□□□ 0.82
Clk3-201ENSMUST00000065330 Rnaseh1O70338 285 aa20.16■□□□□ 0.82
Clk3-201ENSMUST00000065330 RalaP63321 206 aa20.16■□□□□ 0.82
Clk3-201ENSMUST00000065330 Creb1Q01147 341 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
Clk3-201ENSMUST00000065330 TraddQ3U0V2 310 aa20.16■□□□□ 0.82
Clk3-201ENSMUST00000065330 Ddx49Q4FZF3 480 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
Clk3-201ENSMUST00000065330 Sema5bQ60519 1093 aa20.16■□□□□ 0.82
Clk3-201ENSMUST00000065330 Dsg1aQ61495 1057 aa20.16■□□□□ 0.82
Clk3-201ENSMUST00000065330 Mapk4Q6P5G0 583 aa20.16■□□□□ 0.82
Clk3-201ENSMUST00000065330 Atp6v1e2Q9D593 226 aa20.16■□□□□ 0.82
Clk3-201ENSMUST00000065330 Wnk4Q80UE6 1222 aa20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 27.5 ms