Protein–RNA interactions for Protein: P28704

Rxrb, Retinoic acid receptor RXR-beta, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrbP28704 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
RxrbP28704 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
RxrbP28704 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
RxrbP28704 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
RxrbP28704 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
RxrbP28704 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
RxrbP28704 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
RxrbP28704 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
RxrbP28704 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
RxrbP28704 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
RxrbP28704 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
RxrbP28704 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
RxrbP28704 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
RxrbP28704 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
RxrbP28704 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
RxrbP28704 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
RxrbP28704 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
RxrbP28704 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
RxrbP28704 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC30.99■■■□□ 2.55
RxrbP28704 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
RxrbP28704 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
RxrbP28704 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
RxrbP28704 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
RxrbP28704 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
RxrbP28704 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
RxrbP28704 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
RxrbP28704 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
RxrbP28704 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
RxrbP28704 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
RxrbP28704 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
RxrbP28704 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
RxrbP28704 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
RxrbP28704 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
RxrbP28704 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
RxrbP28704 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
RxrbP28704 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
RxrbP28704 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
RxrbP28704 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
RxrbP28704 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
RxrbP28704 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29.76■■■□□ 2.36
RxrbP28704 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
RxrbP28704 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RxrbP28704 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RxrbP28704 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
RxrbP28704 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
RxrbP28704 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
RxrbP28704 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RxrbP28704 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
RxrbP28704 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
RxrbP28704 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
RxrbP28704 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RxrbP28704 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RxrbP28704 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RxrbP28704 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RxrbP28704 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RxrbP28704 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RxrbP28704 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RxrbP28704 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
RxrbP28704 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RxrbP28704 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RxrbP28704 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RxrbP28704 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RxrbP28704 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RxrbP28704 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RxrbP28704 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RxrbP28704 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RxrbP28704 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RxrbP28704 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RxrbP28704 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RxrbP28704 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RxrbP28704 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RxrbP28704 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RxrbP28704 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
RxrbP28704 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RxrbP28704 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RxrbP28704 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RxrbP28704 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RxrbP28704 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RxrbP28704 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RxrbP28704 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RxrbP28704 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RxrbP28704 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
RxrbP28704 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RxrbP28704 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RxrbP28704 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
RxrbP28704 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RxrbP28704 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RxrbP28704 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RxrbP28704 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RxrbP28704 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RxrbP28704 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RxrbP28704 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RxrbP28704 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
RxrbP28704 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RxrbP28704 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RxrbP28704 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RxrbP28704 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RxrbP28704 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RxrbP28704 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
RxrbP28704 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms