Protein–RNA interactions for Protein: Q9D593

Atp6v1e2, V-type proton ATPase subunit E 2, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v1e2Q9D593 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC37.14■■■■□ 3.54
Atp6v1e2Q9D593 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Atp6v1e2Q9D593 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Atp6v1e2Q9D593 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Atp6v1e2Q9D593 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Atp6v1e2Q9D593 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Atp6v1e2Q9D593 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Atp6v1e2Q9D593 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
Atp6v1e2Q9D593 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
Atp6v1e2Q9D593 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Atp6v1e2Q9D593 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Atp6v1e2Q9D593 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
Atp6v1e2Q9D593 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC31.89■■■□□ 2.7
Atp6v1e2Q9D593 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Atp6v1e2Q9D593 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Atp6v1e2Q9D593 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
Atp6v1e2Q9D593 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Atp6v1e2Q9D593 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Atp6v1e2Q9D593 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Atp6v1e2Q9D593 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Atp6v1e2Q9D593 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
Atp6v1e2Q9D593 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Atp6v1e2Q9D593 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Atp6v1e2Q9D593 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Atp6v1e2Q9D593 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Atp6v1e2Q9D593 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Atp6v1e2Q9D593 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Atp6v1e2Q9D593 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Atp6v1e2Q9D593 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Atp6v1e2Q9D593 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Atp6v1e2Q9D593 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Atp6v1e2Q9D593 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Atp6v1e2Q9D593 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
Atp6v1e2Q9D593 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Atp6v1e2Q9D593 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Atp6v1e2Q9D593 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Atp6v1e2Q9D593 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Atp6v1e2Q9D593 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Atp6v1e2Q9D593 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Atp6v1e2Q9D593 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Atp6v1e2Q9D593 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
Atp6v1e2Q9D593 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Atp6v1e2Q9D593 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Atp6v1e2Q9D593 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Atp6v1e2Q9D593 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Atp6v1e2Q9D593 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Atp6v1e2Q9D593 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Atp6v1e2Q9D593 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Atp6v1e2Q9D593 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Atp6v1e2Q9D593 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Atp6v1e2Q9D593 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Atp6v1e2Q9D593 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
Atp6v1e2Q9D593 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Atp6v1e2Q9D593 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Atp6v1e2Q9D593 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Atp6v1e2Q9D593 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Atp6v1e2Q9D593 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Atp6v1e2Q9D593 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Atp6v1e2Q9D593 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Atp6v1e2Q9D593 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Atp6v1e2Q9D593 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Atp6v1e2Q9D593 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Atp6v1e2Q9D593 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Atp6v1e2Q9D593 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Atp6v1e2Q9D593 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Atp6v1e2Q9D593 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Atp6v1e2Q9D593 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Atp6v1e2Q9D593 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Atp6v1e2Q9D593 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Atp6v1e2Q9D593 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Atp6v1e2Q9D593 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Atp6v1e2Q9D593 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Atp6v1e2Q9D593 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Atp6v1e2Q9D593 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Atp6v1e2Q9D593 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Atp6v1e2Q9D593 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Atp6v1e2Q9D593 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Atp6v1e2Q9D593 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Atp6v1e2Q9D593 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Atp6v1e2Q9D593 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Atp6v1e2Q9D593 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Atp6v1e2Q9D593 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Atp6v1e2Q9D593 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Atp6v1e2Q9D593 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Atp6v1e2Q9D593 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Atp6v1e2Q9D593 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Atp6v1e2Q9D593 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Atp6v1e2Q9D593 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Atp6v1e2Q9D593 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Atp6v1e2Q9D593 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Atp6v1e2Q9D593 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Atp6v1e2Q9D593 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Atp6v1e2Q9D593 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Atp6v1e2Q9D593 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Atp6v1e2Q9D593 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Atp6v1e2Q9D593 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Atp6v1e2Q9D593 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Atp6v1e2Q9D593 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Atp6v1e2Q9D593 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Atp6v1e2Q9D593 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms