Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYI0

Protein Njmu-R1, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CYI0 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC42,26■■■■■ 4,36
Q9CYI0 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC39,06■■■■□ 3,84
Q9CYI0 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,59■■■■□ 3,77
Q9CYI0 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,13■■■■□ 3,53
Q9CYI0 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC36,9■■■■□ 3,5
Q9CYI0 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC36,62■■■■□ 3,45
Q9CYI0 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,35■■■■□ 3,41
Q9CYI0 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC36,08■■■■□ 3,37
Q9CYI0 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,98■■■■□ 3,35
Q9CYI0 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,83■■■■□ 3,33
Q9CYI0 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,7■■■■□ 3,31
Q9CYI0 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC35,54■■■■□ 3,28
Q9CYI0 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC35,32■■■■□ 3,24
Q9CYI0 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,12■■■■□ 3,21
Q9CYI0 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,87■■■■□ 3,17
Q9CYI0 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,49■■■■□ 3,11
Q9CYI0 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC34,43■■■■□ 3,1
Q9CYI0 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC34,36■■■■□ 3,09
Q9CYI0 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,22■■■■□ 3,07
Q9CYI0 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC34,14■■■■□ 3,06
Q9CYI0 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC34,14■■■■□ 3,06
Q9CYI0 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,08■■■■□ 3,05
Q9CYI0 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,01■■■■□ 3,04
Q9CYI0 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,93■■■■□ 3,02
Q9CYI0 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC33,89■■■■□ 3,02
Q9CYI0 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33,78■■■■□ 3
Q9CYI0 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,74■■■□□ 2,99
Q9CYI0 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33,68■■■□□ 2,98
Q9CYI0 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,67■■■□□ 2,98
Q9CYI0 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC33,66■■■□□ 2,98
Q9CYI0 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,65■■■□□ 2,98
Q9CYI0 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,62■■■□□ 2,97
Q9CYI0 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,52■■■□□ 2,96
Q9CYI0 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,51■■■□□ 2,95
Q9CYI0 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC33,4■■■□□ 2,94
Q9CYI0 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,39■■■□□ 2,94
Q9CYI0 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC33,37■■■□□ 2,93
Q9CYI0 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,31■■■□□ 2,92
Q9CYI0 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,28■■■□□ 2,92
Q9CYI0 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,25■■■□□ 2,91
Q9CYI0 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC33,18■■■□□ 2,9
Q9CYI0 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,99■■■□□ 2,87
Q9CYI0 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,9■■■□□ 2,86
Q9CYI0 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32,77■■■□□ 2,84
Q9CYI0 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,63■■■□□ 2,81
Q9CYI0 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC32,62■■■□□ 2,81
Q9CYI0 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC32,56■■■□□ 2,8
Q9CYI0 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,5■■■□□ 2,79
Q9CYI0 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,5■■■□□ 2,79
Q9CYI0 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC32,47■■■□□ 2,79
Q9CYI0 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,46■■■□□ 2,79
Q9CYI0 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,46■■■□□ 2,79
Q9CYI0 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC32,41■■■□□ 2,78
Q9CYI0 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32,39■■■□□ 2,78
Q9CYI0 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC32,37■■■□□ 2,77
Q9CYI0 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,26■■■□□ 2,75
Q9CYI0 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,19■■■□□ 2,74
Q9CYI0 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC32,19■■■□□ 2,74
Q9CYI0 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC32,18■■■□□ 2,74
Q9CYI0 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC32,05■■■□□ 2,72
Q9CYI0 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC32,01■■■□□ 2,71
Q9CYI0 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2,71
Q9CYI0 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC31,95■■■□□ 2,71
Q9CYI0 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,89■■■□□ 2,7
Q9CYI0 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,89■■■□□ 2,7
Q9CYI0 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC31,86■■■□□ 2,69
Q9CYI0 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,8■■■□□ 2,68
Q9CYI0 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC31,8■■■□□ 2,68
Q9CYI0 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,8■■■□□ 2,68
Q9CYI0 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,78■■■□□ 2,68
Q9CYI0 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,72■■■□□ 2,67
Q9CYI0 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC31,71■■■□□ 2,67
Q9CYI0 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31,69■■■□□ 2,66
Q9CYI0 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,67■■■□□ 2,66
Q9CYI0 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31,6■■■□□ 2,65
Q9CYI0 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,59■■■□□ 2,65
Q9CYI0 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC31,55■■■□□ 2,64
Q9CYI0 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC31,53■■■□□ 2,64
Q9CYI0 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,51■■■□□ 2,63
Q9CYI0 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC31,45■■■□□ 2,62
Q9CYI0 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC31,44■■■□□ 2,62
Q9CYI0 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC31,41■■■□□ 2,62
Q9CYI0 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,38■■■□□ 2,61
Q9CYI0 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,36■■■□□ 2,61
Q9CYI0 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC31,35■■■□□ 2,61
Q9CYI0 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31,33■■■□□ 2,61
Q9CYI0 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC31,32■■■□□ 2,6
Q9CYI0 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,32■■■□□ 2,6
Q9CYI0 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,31■■■□□ 2,6
Q9CYI0 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC31,3■■■□□ 2,6
Q9CYI0 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,25■■■□□ 2,59
Q9CYI0 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,24■■■□□ 2,59
Q9CYI0 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC31,22■■■□□ 2,59
Q9CYI0 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC31,14■■■□□ 2,58
Q9CYI0 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,13■■■□□ 2,57
Q9CYI0 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,1■■■□□ 2,57
Q9CYI0 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC31,08■■■□□ 2,57
Q9CYI0 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,02■■■□□ 2,56
Q9CYI0 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC31,01■■■□□ 2,55
Q9CYI0 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,01■■■□□ 2,55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9,4 ms