RNA–Protein interactions for RNA: YJL178C

ATG27, Transcript of Type I membrane protein involved in autophagy and the Cvt pathway, yeast

Gene ATG27, Length 816 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ATG27	YJL178C	SOK1	P40317	901 aa		2.7	□□□□□ -1.98
ATG27	YJL178C	EFM3	P47163	339 aa		2.7	□□□□□ -1.98
ATG27	YJL178C	PRM8	P53174	237 aa		2.7	□□□□□ -1.98
ATG27	YJL178C	CDH1	P53197	566 aa		2.7	□□□□□ -1.98
ATG27	YJL178C	GPI17	Q04080	534 aa		2.7	□□□□□ -1.98
ATG27	YJL178C	SSQ1	Q05931	657 aa	Predicted RBP	2.7	□□□□□ -1.98
ATG27	YJL178C	YLR036C	Q07986	203 aa		2.7	□□□□□ -1.98
ATG27	YJL178C	CLP1	Q08685	445 aa	Predicted RBP	2.7	□□□□□ -1.98
ATG27	YJL178C	VIK1	Q12045	647 aa		2.7	□□□□□ -1.98
ATG27	YJL178C	YPR064W	Q12492	139 aa		2.7	□□□□□ -1.98
ATG27	YJL178C	PAR32	Q12515	295 aa	Known RBP	2.7	□□□□□ -1.98
ATG27	YJL178C	RSR1	P13856	272 aa		2.69	□□□□□ -1.98
ATG27	YJL178C	KSS1	P14681	368 aa		2.69	□□□□□ -1.98
ATG27	YJL178C	FAR1	P21268	830 aa		2.69	□□□□□ -1.98
ATG27	YJL178C	PHO84	P25297	587 aa	Known RBP	2.69	□□□□□ -1.98
ATG27	YJL178C	RAD51	P25454	400 aa		2.69	□□□□□ -1.98
ATG27	YJL178C	RPS5	P26783	225 aa	Known RBP	2.69	□□□□□ -1.98
ATG27	YJL178C	IDH1	P28834	360 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.69	□□□□□ -1.98	not detected
ATG27	YJL178C	ARO7	P32178	256 aa		2.69	□□□□□ -1.98
ATG27	YJL178C	MKK1	P32490	508 aa		2.69	□□□□□ -1.98
ATG27	YJL178C	RIB7	P33312	244 aa		2.69	□□□□□ -1.98
ATG27	YJL178C	RTC2	P38279	296 aa		2.69	□□□□□ -1.98
ATG27	YJL178C	PEX18	P38855	283 aa		2.69	□□□□□ -1.98
ATG27	YJL178C	YHR177W	P38867	453 aa		2.69	□□□□□ -1.98
ATG27	YJL178C	BAT1	P38891	393 aa	Known RBP	2.69	□□□□□ -1.98
ATG27	YJL178C	IPT1	P38954	527 aa		2.69	□□□□□ -1.98
ATG27	YJL178C	AST2	P39945	430 aa	Known RBP	2.69	□□□□□ -1.98
ATG27	YJL178C	SPO73	P40031	143 aa		2.69	□□□□□ -1.98
ATG27	YJL178C	OSW5	P40219	148 aa		2.69	□□□□□ -1.98
ATG27	YJL178C	AIM20	P40451	204 aa		2.69	□□□□□ -1.98
ATG27	YJL178C	EGT2	P42835	1041 aa		2.69	□□□□□ -1.98
ATG27	YJL178C	PRM10	P42946	383 aa		2.69	□□□□□ -1.98
ATG27	YJL178C	FAR7	P43592	221 aa		2.69	□□□□□ -1.98
ATG27	YJL178C	AIM24	P47127	394 aa		2.69	□□□□□ -1.98
ATG27	YJL178C	BIR1	P47134	954 aa		2.69	□□□□□ -1.98
ATG27	YJL178C	STE24	P47154	453 aa		2.69	□□□□□ -1.98
ATG27	YJL178C	RBL2	P48606	106 aa	Known RBP	2.69	□□□□□ -1.98
ATG27	YJL178C	BNS1	P50084	137 aa		2.69	□□□□□ -1.98
ATG27	YJL178C	CRH1	P53301	507 aa		2.69	□□□□□ -1.98
ATG27	YJL178C	ZRG17	P53735	605 aa		2.69	□□□□□ -1.98
ATG27	YJL178C	SWP1	Q02795	286 aa		2.69	□□□□□ -1.98
ATG27	YJL178C	YPL107W	Q02873	248 aa		2.69	□□□□□ -1.98
ATG27	YJL178C	RRN5	Q02983	363 aa		2.69	□□□□□ -1.98
ATG27	YJL178C	SPO77	Q06134	477 aa		2.69	□□□□□ -1.98
ATG27	YJL178C	DBP9	Q06218	594 aa	Known RBP	2.69	□□□□□ -1.98
ATG27	YJL178C	NDL1	Q06568	189 aa		2.69	□□□□□ -1.98
ATG27	YJL178C	SAM4	Q08985	325 aa	Known RBP	2.69	□□□□□ -1.98
ATG27	YJL178C	VPS68	Q12016	184 aa		2.69	□□□□□ -1.98
ATG27	YJL178C	MSH5	Q12175	901 aa		2.69	□□□□□ -1.98
ATG27	YJL178C	NFI1	Q12216	726 aa		2.69	□□□□□ -1.98
ATG27	YJL178C	GLE1	Q12315	538 aa		2.69	□□□□□ -1.98
ATG27	YJL178C	PST2	Q12335	198 aa	Known RBP	2.69	□□□□□ -1.98
ATG27	YJL178C	EAF3	Q12432	401 aa		2.69	□□□□□ -1.98
ATG27	YJL178C	MHF1	Q3E835	90 aa		2.69	□□□□□ -1.98
ATG27	YJL178C	RIB3	Q99258	208 aa		2.69	□□□□□ -1.98
ATG27	YJL178C	MED11	Q99278	115 aa		2.69	□□□□□ -1.98
ATG27	YJL178C	MET2	P08465	486 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ATG27	YJL178C	YKR104W	P0CE69	306 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ATG27	YJL178C	PET9	P18239	318 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
ATG27	YJL178C	VMA6	P32366	345 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
ATG27	YJL178C	YEF1	P32622	495 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ATG27	YJL178C	SSO1	P32867	290 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ATG27	YJL178C	VPS21	P36017	210 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
ATG27	YJL178C	WSC4	P38739	605 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ATG27	YJL178C	DFG10	P40526	253 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ATG27	YJL178C	APQ12	P40532	138 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ATG27	YJL178C	YFR057W	P43625	151 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ATG27	YJL178C	YJL055W	P47044	245 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ATG27	YJL178C	RAD17	P48581	401 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ATG27	YJL178C	SHE4	P51534	789 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ATG27	YJL178C	CWC23	P52868	283 aa	Predicted RBP	2.68	□□□□□ -1.98
ATG27	YJL178C	MST27	P53176	234 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ATG27	YJL178C	COG5	P53951	403 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ATG27	YJL178C	TPS1	Q00764	495 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
ATG27	YJL178C	MAK3	Q03503	176 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ATG27	YJL178C	YML096W	Q04489	525 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ATG27	YJL178C	RNH202	Q05635	350 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ATG27	YJL178C	YDL114W	Q07530	308 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ATG27	YJL178C	PLB3	Q08108	686 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ATG27	YJL178C	RRP40	Q08285	240 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
ATG27	YJL178C	TRM10	Q12400	293 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ATG27	YJL178C	SKS1	Q12505	502 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ATG27	YJL178C	YCR024C-B	Q3E7Z8	88 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ATG27	YJL178C	MSB2	P32334	1306 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ATG27	YJL178C	RPS1B	P23248	255 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
ATG27	YJL178C	RRP7	P25368	297 aa	Predicted RBP	2.67	□□□□□ -1.98
ATG27	YJL178C	MID2	P36027	376 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ATG27	YJL178C	GPX2	P38143	162 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ATG27	YJL178C	ARN2	P38724	620 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ATG27	YJL178C	RCY1	P39531	840 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ATG27	YJL178C	OXA1	P39952	402 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ATG27	YJL178C	LYS12	P40495	371 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
ATG27	YJL178C	PAC11	P40960	533 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ATG27	YJL178C	HAC1	P41546	238 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ATG27	YJL178C	STB1	P42845	420 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ATG27	YJL178C	PAM16	P42949	149 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ATG27	YJL178C	YFR018C	P43599	363 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ATG27	YJL178C	JHD2	P47156	728 aa	Predicted RBP	2.67	□□□□□ -1.98
ATG27	YJL178C	PAC10	P48363	199 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ATG27	YJL178C	YIP5	P53108	310 aa		2.67	□□□□□ -1.98

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