RNA–Protein interactions for RNA: YHR139C

SPS100, Transcript of Protein required for spore wall maturation, yeast

Gene SPS100, Length 981 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SPS100	YHR139C	FRE3	Q08905	711 aa		7.56	□□□□□ -1.2
SPS100	YHR139C	FIT3	Q08907	204 aa		7.56	□□□□□ -1.2
SPS100	YHR139C	MSH5	Q12175	901 aa		7.56	□□□□□ -1.2
SPS100	YHR139C	DSF1	P0CX08	502 aa		7.55	□□□□□ -1.2
SPS100	YHR139C	YNR073C	P0CX09	502 aa		7.55	□□□□□ -1.2
SPS100	YHR139C	MATALPHA1	P0CY06	175 aa		7.55	□□□□□ -1.2
SPS100	YHR139C	HMLALPHA1	P0CY07	175 aa		7.55	□□□□□ -1.2
SPS100	YHR139C	MRT4	P33201	236 aa	Known RBP	7.55	□□□□□ -1.2
SPS100	YHR139C	MKS1	P34072	584 aa		7.55	□□□□□ -1.2
SPS100	YHR139C	ZRT3	P34240	503 aa		7.55	□□□□□ -1.2
SPS100	YHR139C	QDR1	P40475	563 aa		7.55	□□□□□ -1.2
SPS100	YHR139C	AVT7	P40501	490 aa		7.55	□□□□□ -1.2
SPS100	YHR139C	ERJ5	P43613	295 aa	Predicted RBP	7.55	□□□□□ -1.2
SPS100	YHR139C	RAI1	P53063	387 aa	Known RBP	7.55	□□□□□ -1.2
SPS100	YHR139C	TGS1	Q12052	315 aa		7.55	□□□□□ -1.2
SPS100	YHR139C	ISA2	Q12425	185 aa		7.55	□□□□□ -1.2
SPS100	YHR139C	TDH3	P00359	332 aa	Known RBP RIP-Chip data	7.54	□□□□□ -1.2	not detected
SPS100	YHR139C	PHO4	P07270	312 aa	Known RBP	7.54	□□□□□ -1.2
SPS100	YHR139C	HOM6	P31116	359 aa	Known RBP	7.54	□□□□□ -1.2
SPS100	YHR139C	PIG2	P40187	538 aa		7.54	□□□□□ -1.2
SPS100	YHR139C	YMR144W	P40214	342 aa	Known RBP	7.54	□□□□□ -1.2
SPS100	YHR139C	CWC23	P52868	283 aa	Predicted RBP	7.54	□□□□□ -1.2
SPS100	YHR139C	POP6	P53218	158 aa		7.54	□□□□□ -1.2
SPS100	YHR139C	GPI17	Q04080	534 aa		7.54	□□□□□ -1.2
SPS100	YHR139C	MRPL35	Q06678	367 aa		7.54	□□□□□ -1.2
SPS100	YHR139C	MRL1	Q06815	381 aa		7.54	□□□□□ -1.2
SPS100	YHR139C	ATG41	Q12048	136 aa		7.54	□□□□□ -1.2
SPS100	YHR139C	RNH203	Q12338	110 aa		7.54	□□□□□ -1.2
SPS100	YHR139C	ORT1	Q12375	292 aa		7.54	□□□□□ -1.2
SPS100	YHR139C	YBL113C	Q7M4S9	792 aa		7.54	□□□□□ -1.2
SPS100	YHR139C	SGA1	P08019	549 aa		7.53	□□□□□ -1.2
SPS100	YHR139C	CNE1	P27825	502 aa		7.53	□□□□□ -1.2
SPS100	YHR139C	MBA1	P38300	278 aa		7.53	□□□□□ -1.2
SPS100	YHR139C	YGP1	P38616	354 aa	Known RBP	7.53	□□□□□ -1.2
SPS100	YHR139C	YHK8	P38776	514 aa		7.53	□□□□□ -1.2
SPS100	YHR139C	ATF1	P40353	525 aa		7.53	□□□□□ -1.2
SPS100	YHR139C	SER2	P42941	309 aa		7.53	□□□□□ -1.2
SPS100	YHR139C	CIN2	P46670	268 aa		7.53	□□□□□ -1.2
SPS100	YHR139C	YNR048W	P53740	393 aa		7.53	□□□□□ -1.2
SPS100	YHR139C	HHT1	P61830	136 aa		7.53	□□□□□ -1.2
SPS100	YHR139C	YDR391C	Q04170	232 aa		7.53	□□□□□ -1.2
SPS100	YHR139C	HEM25	Q07534	307 aa		7.53	□□□□□ -1.2
SPS100	YHR139C	RPL30	P14120	105 aa	Known RBP	7.52	□□□□□ -1.21
SPS100	YHR139C	AFG1	P32317	509 aa		7.52	□□□□□ -1.21
SPS100	YHR139C	CLB6	P32943	380 aa		7.52	□□□□□ -1.21
SPS100	YHR139C	SNC2	P33328	115 aa		7.52	□□□□□ -1.21
SPS100	YHR139C	YBR220C	P38318	560 aa		7.52	□□□□□ -1.21
SPS100	YHR139C	FCY21	P40039	528 aa		7.52	□□□□□ -1.21
SPS100	YHR139C	BNA6	P43619	295 aa		7.52	□□□□□ -1.21
SPS100	YHR139C	PHB2	P50085	310 aa		7.52	□□□□□ -1.21
SPS100	YHR139C	YGL159W	P53110	370 aa		7.52	□□□□□ -1.21
SPS100	YHR139C	MRH4	P53166	561 aa		7.52	□□□□□ -1.21
SPS100	YHR139C	MTL1	P53214	551 aa		7.52	□□□□□ -1.21
SPS100	YHR139C	YPL077C	Q02831	240 aa		7.52	□□□□□ -1.21
SPS100	YHR139C	USB1	Q12208	290 aa	Known RBP	7.52	□□□□□ -1.21
SPS100	YHR139C	SPS100	P13130	326 aa		7.51	□□□□□ -1.21
SPS100	YHR139C	ARO3	P14843	370 aa	Known RBP	7.51	□□□□□ -1.21
SPS100	YHR139C	PDA1	P16387	420 aa	Known RBP	7.51	□□□□□ -1.21
SPS100	YHR139C	PRE4	P30657	266 aa		7.51	□□□□□ -1.21
SPS100	YHR139C	IPI1	P38803	334 aa	Predicted RBP	7.51	□□□□□ -1.21
SPS100	YHR139C	MIT1	P40002	666 aa		7.51	□□□□□ -1.21
SPS100	YHR139C	FLX1	P40464	311 aa		7.51	□□□□□ -1.21
SPS100	YHR139C	YIP5	P53108	310 aa		7.51	□□□□□ -1.21
SPS100	YHR139C	SCW4	P53334	386 aa	Known RBP	7.51	□□□□□ -1.21
SPS100	YHR139C	ERV29	P53337	310 aa		7.51	□□□□□ -1.21
SPS100	YHR139C	RNH201	P53942	307 aa		7.51	□□□□□ -1.21
SPS100	YHR139C	YMR130W	Q04223	302 aa		7.51	□□□□□ -1.21
SPS100	YHR139C	RGC1	Q06108	1083 aa	Known RBP	7.51	□□□□□ -1.21
SPS100	YHR139C	RSC58	Q07979	502 aa		7.51	□□□□□ -1.21
SPS100	YHR139C	FUR4	P05316	633 aa	Known RBP	7.5	□□□□□ -1.21
SPS100	YHR139C	DEG1	P31115	442 aa	Known RBP	7.5	□□□□□ -1.21
SPS100	YHR139C	GLC7	P32598	312 aa	Known RBP	7.5	□□□□□ -1.21
SPS100	YHR139C	PPZ2	P33329	710 aa		7.5	□□□□□ -1.21
SPS100	YHR139C	MTR2	P34232	184 aa	Known RBP	7.5	□□□□□ -1.21
SPS100	YHR139C	MCH2	P36032	473 aa		7.5	□□□□□ -1.21
SPS100	YHR139C	PRS3	P38689	320 aa	Known RBP	7.5	□□□□□ -1.21
SPS100	YHR139C	MSS4	P38994	779 aa		7.5	□□□□□ -1.21
SPS100	YHR139C	BUD8	P41698	603 aa		7.5	□□□□□ -1.21
SPS100	YHR139C	IRC18	P47056	224 aa		7.5	□□□□□ -1.21
SPS100	YHR139C	IMD3	P50095	523 aa	Known RBP	7.5	□□□□□ -1.21
SPS100	YHR139C	AVT4	P50944	713 aa		7.5	□□□□□ -1.21
SPS100	YHR139C	UBC13	P52490	153 aa		7.5	□□□□□ -1.21
SPS100	YHR139C	RRS1	Q08746	203 aa	Known RBP	7.5	□□□□□ -1.21
SPS100	YHR139C	YOR283W	Q12040	230 aa	Known RBP	7.5	□□□□□ -1.21
SPS100	YHR139C	YLR358C	O13565	187 aa		7.49	□□□□□ -1.21
SPS100	YHR139C	MSI1	P13712	422 aa		7.49	□□□□□ -1.21
SPS100	YHR139C	DBF20	P32328	564 aa		7.49	□□□□□ -1.21
SPS100	YHR139C	TCM62	P38228	572 aa	Known RBP	7.49	□□□□□ -1.21
SPS100	YHR139C	ARO9	P38840	513 aa	Predicted RBP	7.49	□□□□□ -1.21
SPS100	YHR139C	SMB1	P40018	196 aa	Known RBP	7.49	□□□□□ -1.21
SPS100	YHR139C	YIL029C	P40538	142 aa		7.49	□□□□□ -1.21
SPS100	YHR139C	OST1	P41543	476 aa	Known RBP	7.49	□□□□□ -1.21
SPS100	YHR139C	CRZ1	P53968	678 aa		7.49	□□□□□ -1.21
SPS100	YHR139C	BUD25	P85052	153 aa		7.49	□□□□□ -1.21
SPS100	YHR139C	LAP3	Q01532	483 aa	Known RBP RIP-Chip data	7.49	□□□□□ -1.21	not detected
SPS100	YHR139C	CTF19	Q02732	369 aa		7.49	□□□□□ -1.21
SPS100	YHR139C	YLR283W	Q05867	314 aa		7.49	□□□□□ -1.21
SPS100	YHR139C	TPO3	Q06451	622 aa		7.49	□□□□□ -1.21
SPS100	YHR139C	YPL199C	Q08954	240 aa		7.49	□□□□□ -1.21
SPS100	YHR139C	SRL2	Q12020	392 aa		7.49	□□□□□ -1.21

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