RNA–Protein interactions for RNA: YHR129C

ARP1, Transcript of Actin-related protein of the dynactin complex, yeast

Gene ARP1, Length 1,155 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ARP1	YHR129C	ORT1	Q12375	292 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARP1	YHR129C	YPR064W	Q12492	139 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARP1	YHR129C	SAM2	P19358	384 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ARP1	YHR129C	NUP1	P20676	1076 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ARP1	YHR129C	MRPS28	P21771	286 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ARP1	YHR129C	HRR25	P29295	494 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ARP1	YHR129C	FUN26	P31381	517 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ARP1	YHR129C	SPT4	P32914	102 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ARP1	YHR129C	RIM2	P38127	377 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ARP1	YHR129C	RCK1	P38622	512 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ARP1	YHR129C	YPT35	P38815	214 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ARP1	YHR129C	LYS1	P38998	373 aa	RIP-Chip data	4.87	□□□□□ -1.63	not detected
ARP1	YHR129C	ARG2	P40360	574 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ARP1	YHR129C	PSA1	P41940	361 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ARP1	YHR129C	PMT4	P46971	762 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ARP1	YHR129C	UBC13	P52490	153 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ARP1	YHR129C	COS1	P53822	381 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ARP1	YHR129C	YNL040W	P53960	456 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ARP1	YHR129C	SPR6	Q01684	191 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ARP1	YHR129C	RNY1	Q02933	434 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ARP1	YHR129C	RAV2	Q03956	351 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ARP1	YHR129C	YLR012C	Q07927	99 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ARP1	YHR129C	GAT3	Q07928	141 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ARP1	YHR129C	YOL024W	Q08172	172 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ARP1	YHR129C	MMT2	Q08970	484 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ARP1	YHR129C	SRL2	Q12020	392 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ARP1	YHR129C	NCA2	Q12374	616 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ARP1	YHR129C	YIR021W-A	Q3E739	70 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ARP1	YHR129C	YPL119C-A	Q3E751	87 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ARP1	YHR129C	YKL068W-A	Q3E826	78 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ARP1	YHR129C	RIB3	Q99258	208 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ARP1	YHR129C	MET2	P08465	486 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ARP1	YHR129C	SPO12	P17123	173 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ARP1	YHR129C	SPO11	P23179	398 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ARP1	YHR129C	RNA14	P25298	677 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ARP1	YHR129C	CPR3	P25719	182 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ARP1	YHR129C	ARC40	P38328	384 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ARP1	YHR129C	LAG1	P38703	411 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ARP1	YHR129C	GLE2	P40066	365 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ARP1	YHR129C	LSM4	P40070	187 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ARP1	YHR129C	MOB2	P43563	287 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ARP1	YHR129C	MCM22	P47167	239 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ARP1	YHR129C	HCH1	P53834	153 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ARP1	YHR129C	TIM8	P57744	87 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ARP1	YHR129C	SAE3	P89114	91 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ARP1	YHR129C	YDR249C	Q03787	373 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ARP1	YHR129C	PRP11	Q07350	266 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ARP1	YHR129C	YLR046C	Q12253	270 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ARP1	YHR129C	YOR214C	Q12282	236 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ARP1	YHR129C	MRX4	Q12467	430 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ARP1	YHR129C	IGO2	Q9P305	131 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ARP1	YHR129C	TCB3	Q03640	1545 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ARP1	YHR129C	YBR137W	P38276	179 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ARP1	YHR129C	YPC1	P38298	316 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ARP1	YHR129C	YBR285W	P38354	144 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ARP1	YHR129C	YHR127W	P38833	243 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ARP1	YHR129C	ECM14	P38836	430 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ARP1	YHR129C	MDM31	P38880	579 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ARP1	YHR129C	YMR144W	P40214	342 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ARP1	YHR129C	SIM1	P40472	476 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ARP1	YHR129C	FAR7	P43592	221 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ARP1	YHR129C	YDR476C	Q03362	224 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ARP1	YHR129C	AHA1	Q12449	350 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ARP1	YHR129C	POM152	P39685	1337 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ARP1	YHR129C	RPL25	P04456	142 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ARP1	YHR129C	MRS1	P07266	363 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ARP1	YHR129C	GCN3	P14741	305 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ARP1	YHR129C	RPS1B	P23248	255 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ARP1	YHR129C	PRE7	P23724	241 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ARP1	YHR129C	SCO1	P23833	295 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ARP1	YHR129C	LSB5	P25369	354 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ARP1	YHR129C	BUB3	P26449	341 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ARP1	YHR129C	MRPL9	P31334	269 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ARP1	YHR129C	OAC1	P32332	324 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ARP1	YHR129C	UGX2	P32772	223 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ARP1	YHR129C	MRPL24	P36525	258 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ARP1	YHR129C	ATG12	P38316	186 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ARP1	YHR129C	GEP4	P38812	185 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ARP1	YHR129C	MST28	P39552	234 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ARP1	YHR129C	RIO2	P40160	425 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ARP1	YHR129C	PGD1	P40356	397 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ARP1	YHR129C	YIL029C	P40538	142 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ARP1	YHR129C	PHO23	P50947	330 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ARP1	YHR129C	YIP1	P53039	248 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ARP1	YHR129C	YPS5	P53057	165 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ARP1	YHR129C	YGR017W	P53210	297 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ARP1	YHR129C	SYF2	P53277	215 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ARP1	YHR129C	BET5	Q03630	159 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ARP1	YHR129C	YDR278C	Q05612	105 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ARP1	YHR129C	TAZ1	Q06510	381 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ARP1	YHR129C	YPL257W	Q08974	193 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ARP1	YHR129C	MDM32	Q12171	622 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ARP1	YHR129C	YDL085C-A	Q3E7B7	68 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ARP1	YHR129C	YER145C-A	A0A023PYF4	145 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ARP1	YHR129C	FRE2	P36033	711 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ARP1	YHR129C	YCR041W	P37265	110 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ARP1	YHR129C	YHK8	P38776	514 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ARP1	YHR129C	RFC2	P40348	353 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ARP1	YHR129C	GLC8	P41818	229 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ARP1	YHR129C	MEP2	P41948	499 aa		4.83	□□□□□ -1.64

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