RNA–Protein interactions for RNA: YGL017W

ATE1, Transcript of Arginyl-tRNA-protein transferase, yeast

Gene ATE1, Length 1,512 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ATE1	YGL017W	UPS2	P35200	230 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATE1	YGL017W	DTR1	P38125	572 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATE1	YGL017W	ZTA1	P38230	334 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ATE1	YGL017W	RTC2	P38279	296 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATE1	YGL017W	YBR220C	P38318	560 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATE1	YGL017W	LAG1	P38703	411 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATE1	YGL017W	HTD2	P38790	280 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ATE1	YGL017W	HRB1	P38922	454 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.89	□□□□□ -1.63	not detected
ATE1	YGL017W	LSM4	P40070	187 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ATE1	YGL017W	LRO1	P40345	661 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATE1	YGL017W	GLR1	P41921	483 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ATE1	YGL017W	QRI7	P43122	407 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATE1	YGL017W	MOG1	P47123	218 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATE1	YGL017W	MDM34	P53083	459 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATE1	YGL017W	VPS73	P53142	486 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ATE1	YGL017W	YGR026W	P53217	278 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATE1	YGL017W	HCH1	P53834	153 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATE1	YGL017W	PEX30	Q06169	523 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATE1	YGL017W	IPK1	Q06667	281 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATE1	YGL017W	YLR036C	Q07986	203 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATE1	YGL017W	PLB3	Q08108	686 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATE1	YGL017W	NDD1	Q08887	554 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATE1	YGL017W	ATG41	Q12048	136 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATE1	YGL017W	YPR011C	Q12251	326 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATE1	YGL017W	RDI1	Q12434	202 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATE1	YGL017W	HRP1	Q99383	534 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ATE1	YGL017W	SLH1	P53327	1967 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ATE1	YGL017W	OLE1	P21147	510 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ATE1	YGL017W	MIR1	P23641	311 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ATE1	YGL017W	DEG1	P31115	442 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ATE1	YGL017W	LDS1	P31379	325 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATE1	YGL017W	EMC3	P36039	253 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATE1	YGL017W	YHR097C	P38809	366 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ATE1	YGL017W	BDH1	P39714	382 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATE1	YGL017W	YEL068C	P39977	110 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATE1	YGL017W	PMT6	P42934	759 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATE1	YGL017W	GNA1	P43577	159 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ATE1	YGL017W	DPB11	P47027	764 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ATE1	YGL017W	YJR149W	P47177	404 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATE1	YGL017W	COG7	P53195	279 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATE1	YGL017W	GIP3	Q03016	1276 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATE1	YGL017W	GIS1	Q03833	894 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATE1	YGL017W	VBA1	Q04301	562 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATE1	YGL017W	ELP6	Q04868	273 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATE1	YGL017W	RNH202	Q05635	350 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATE1	YGL017W	YDL086W	Q07505	273 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATE1	YGL017W	TEN1	Q07921	160 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATE1	YGL017W	BSC1	Q12140	328 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATE1	YGL017W	PST1	Q12355	444 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATE1	YGL017W	RKM5	Q12367	367 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATE1	YGL017W	PEX11	Q12462	236 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATE1	YGL017W	YLR099W-A	Q3E798	87 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATE1	YGL017W	PET20	Q99373	253 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATE1	YGL017W	RPL1A	P0CX43	217 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ATE1	YGL017W	RPL1B	P0CX44	217 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ATE1	YGL017W	ARF2	P19146	181 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ATE1	YGL017W	SCL1	P21243	252 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ATE1	YGL017W	EXG1	P23776	448 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ATE1	YGL017W	PBN1	P25580	416 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATE1	YGL017W	CTS1	P29029	562 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATE1	YGL017W	AFG1	P32317	509 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATE1	YGL017W	HXT4	P32467	576 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATE1	YGL017W	SCM4	P32564	187 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATE1	YGL017W	SFC1	P33303	322 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATE1	YGL017W	SKN1	P33336	771 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATE1	YGL017W	MCH2	P36032	473 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATE1	YGL017W	YKL070W	P36087	169 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATE1	YGL017W	MRPL4	P36517	319 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATE1	YGL017W	RRN10	P38204	145 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATE1	YGL017W	MED6	P38782	295 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATE1	YGL017W	YHR122W	P38829	231 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATE1	YGL017W	YHR177W	P38867	453 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATE1	YGL017W	IKI1	P38874	309 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATE1	YGL017W	NIT2	P47016	307 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATE1	YGL017W	SOL1	P50278	321 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATE1	YGL017W	ERV14	P53173	138 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATE1	YGL017W	SWC4	P53201	476 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATE1	YGL017W	YGR015C	P53208	328 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATE1	YGL017W	MTL1	P53214	551 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATE1	YGL017W	SAY1	P53324	424 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATE1	YGL017W	ATG4	P53867	494 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATE1	YGL017W	YPL113C	Q02961	396 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATE1	YGL017W	HRD1	Q08109	551 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATE1	YGL017W	RDR1	Q08904	546 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATE1	YGL017W	SWT1	Q12104	458 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATE1	YGL017W	YLR046C	Q12253	270 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATE1	YGL017W	PCC1	Q3E833	88 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATE1	YGL017W	TOR2	P32600	2474 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ATE1	YGL017W	DFR1	P07807	211 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.87	□□□□□ -1.63	not detected
ATE1	YGL017W	SEC12	P11655	471 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATE1	YGL017W	SEC59	P20048	519 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATE1	YGL017W	ZRC1	P20107	442 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATE1	YGL017W	YCP4	P25349	247 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ATE1	YGL017W	YCR061W	P25639	631 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATE1	YGL017W	SIP1	P32578	815 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATE1	YGL017W	SRY1	P36007	326 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATE1	YGL017W	PAU24	P38155	120 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATE1	YGL017W	COX15	P40086	486 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATE1	YGL017W	BMT5	P40493	336 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATE1	YGL017W	SNM1	P40993	198 aa		4.87	□□□□□ -1.63

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