RNA–Protein interactions for RNA: YEL038W

UTR4, Transcript of Protein with sequence similarity to acireductone synthases, yeast

Gene UTR4, Length 684 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
UTR4	YEL038W	MDM32	Q12171	622 aa		4.66	□□□□□ -1.66
UTR4	YEL038W	TIR4	Q12218	487 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
UTR4	YEL038W	RLM1	Q12224	676 aa		4.66	□□□□□ -1.66
UTR4	YEL038W	YOS9	Q99220	542 aa		4.66	□□□□□ -1.66
UTR4	YEL038W	TAD3	Q9URQ3	322 aa		4.66	□□□□□ -1.66
UTR4	YEL038W	HIS3	P06633	220 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UTR4	YEL038W	COX9	P07255	59 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UTR4	YEL038W	RPS18A	P0CX55	146 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
UTR4	YEL038W	RPS18B	P0CX56	146 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
UTR4	YEL038W	STE12	P13574	688 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UTR4	YEL038W	RPB8	P20436	146 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UTR4	YEL038W	DIT1	P21623	536 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UTR4	YEL038W	DBF2	P22204	572 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UTR4	YEL038W	ACH1	P32316	526 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UTR4	YEL038W	MRP20	P32387	263 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UTR4	YEL038W	RPD3	P32561	433 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UTR4	YEL038W	PAU2	P32612	120 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UTR4	YEL038W	PAD1	P33751	242 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.65	□□□□□ -1.67	not detected
UTR4	YEL038W	PTH1	P38876	190 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
UTR4	YEL038W	YKE4	P40544	346 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UTR4	YEL038W	PEF1	P53238	335 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UTR4	YEL038W	CUZ1	P53899	274 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UTR4	YEL038W	ACS1	Q01574	713 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UTR4	YEL038W	PLB2	Q03674	706 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UTR4	YEL038W	DPB4	Q04603	196 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
UTR4	YEL038W	RBS1	Q05672	457 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
UTR4	YEL038W	DCR2	Q05924	578 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UTR4	YEL038W	TPO3	Q06451	622 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UTR4	YEL038W	YOR283W	Q12040	230 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
UTR4	YEL038W	BAG7	Q12128	409 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UTR4	YEL038W	CYC1	P00044	109 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
UTR4	YEL038W	URA3	P03962	267 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UTR4	YEL038W	SED4	P25365	1065 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UTR4	YEL038W	PEX32	P38292	413 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UTR4	YEL038W	YER184C	P39961	794 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UTR4	YEL038W	HPA3	P39979	161 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UTR4	YEL038W	NAS2	P40555	220 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UTR4	YEL038W	POP1	P41812	875 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UTR4	YEL038W	RPE1	P46969	238 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UTR4	YEL038W	TAF4	P50105	388 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UTR4	YEL038W	DOC1	P53068	250 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UTR4	YEL038W	ATG4	P53867	494 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UTR4	YEL038W	LSM7	P53905	115 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
UTR4	YEL038W	RSM28	Q03430	361 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UTR4	YEL038W	SSY1	Q03770	852 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UTR4	YEL038W	MRPL51	Q06090	140 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
UTR4	YEL038W	PHO92	Q06390	306 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UTR4	YEL038W	HNT3	Q08702	217 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UTR4	YEL038W	ATG41	Q12048	136 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UTR4	YEL038W	YOR343C	Q12484	108 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UTR4	YEL038W	YOR032W-A	Q8TGS1	66 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UTR4	YEL038W	BLM10	P43583	2143 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UTR4	YEL038W	SOD2	P00447	233 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UTR4	YEL038W	GPM1	P00950	247 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
UTR4	YEL038W	PEP4	P07267	405 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
UTR4	YEL038W	PET54	P10834	293 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UTR4	YEL038W	AIM17	P23180	465 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
UTR4	YEL038W	CPR2	P23285	205 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UTR4	YEL038W	EHD3	P28817	500 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UTR4	YEL038W	ERG9	P29704	444 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UTR4	YEL038W	HYM1	P32464	399 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UTR4	YEL038W	SFK1	P35735	353 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UTR4	YEL038W	MSS4	P38994	779 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UTR4	YEL038W	BUD8	P41698	603 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UTR4	YEL038W	DPB11	P47027	764 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
UTR4	YEL038W	CCC1	P47818	322 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UTR4	YEL038W	ECL1	P48235	211 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UTR4	YEL038W	DIE2	P50076	525 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UTR4	YEL038W	BRR6	P53062	197 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UTR4	YEL038W	NCE103	P53615	221 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UTR4	YEL038W	SNX41	Q04053	625 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UTR4	YEL038W	COX20	Q04935	205 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UTR4	YEL038W	NMA1	Q06178	401 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
UTR4	YEL038W	SSK1	Q07084	712 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UTR4	YEL038W	LUC7	Q07508	261 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
UTR4	YEL038W	IRC19	Q07843	230 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UTR4	YEL038W	OPI3	P05375	206 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UTR4	YEL038W	RPS13	P05756	151 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
UTR4	YEL038W	ADK1	P07170	222 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
UTR4	YEL038W	PPA2	P28239	310 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UTR4	YEL038W	ITR1	P30605	584 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UTR4	YEL038W	PRE4	P30657	266 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UTR4	YEL038W	CLG1	P35190	452 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UTR4	YEL038W	YKR073C	P36153	106 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UTR4	YEL038W	YBR242W	P38331	238 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UTR4	YEL038W	HTD2	P38790	280 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
UTR4	YEL038W	BNA6	P43619	295 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UTR4	YEL038W	LYS5	P50113	272 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UTR4	YEL038W	YGL204C	P53089	101 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UTR4	YEL038W	SCS7	Q03529	384 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UTR4	YEL038W	YDR249C	Q03787	373 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UTR4	YEL038W	BNA7	Q04066	261 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UTR4	YEL038W	LYS21	Q12122	440 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
UTR4	YEL038W	RPL6B	P05739	176 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
UTR4	YEL038W	SPS2	P08459	502 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UTR4	YEL038W	FRS1	P15624	595 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
UTR4	YEL038W	PDA1	P16387	420 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
UTR4	YEL038W	SCO1	P23833	295 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UTR4	YEL038W	ATG22	P25568	528 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UTR4	YEL038W	ATS1	P31386	333 aa		4.61	□□□□□ -1.67

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