RNA–Protein interactions for RNA: Q0144

Q0144, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene Q0144, Length 330 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
Q0144	Q0144	TCD1	P38756	429 aa		0.53	□□□□□ -2.32
Q0144	Q0144	KEL2	P50090	882 aa		0.53	□□□□□ -2.32
Q0144	Q0144	SLD7	Q08457	257 aa		0.53	□□□□□ -2.32
Q0144	Q0144	MDH3	P32419	343 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.52	□□□□□ -2.33	not detected
Q0144	Q0144	ECM13	P38195	257 aa		0.52	□□□□□ -2.33
Q0144	Q0144	YNR062C	P53748	327 aa		0.52	□□□□□ -2.33
Q0144	Q0144	PML1	Q07930	204 aa	Predicted RBP	0.52	□□□□□ -2.33
Q0144	Q0144	CYR1	P08678	2026 aa	Known RBP	0.51	□□□□□ -2.33
Q0144	Q0144	UPS2	P35200	230 aa		0.51	□□□□□ -2.33
Q0144	Q0144	HUA1	P40325	198 aa		0.51	□□□□□ -2.33
Q0144	Q0144	PDR16	P53860	351 aa	Known RBP	0.51	□□□□□ -2.33
Q0144	Q0144	ASR1	Q06834	288 aa		0.51	□□□□□ -2.33
Q0144	Q0144	CPA1	P07258	411 aa	Known RBP	0.5	□□□□□ -2.33
Q0144	Q0144	SWC5	P38326	303 aa		0.5	□□□□□ -2.33
Q0144	Q0144	SMD3	P43321	101 aa	Known RBP	0.5	□□□□□ -2.33
Q0144	Q0144	IBA57	P47158	497 aa		0.5	□□□□□ -2.33
Q0144	Q0144	EMI1	Q04406	187 aa		0.5	□□□□□ -2.33
Q0144	Q0144	MSS116	P15424	664 aa	Known RBP	0.49	□□□□□ -2.33
Q0144	Q0144	PAA1	Q12447	191 aa	Known RBP	0.49	□□□□□ -2.33
Q0144	Q0144	POT1	P27796	417 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.48	□□□□□ -2.33	not detected
Q0144	Q0144	UIP5	P36137	443 aa		0.48	□□□□□ -2.33
Q0144	Q0144	GTO1	P48239	356 aa		0.48	□□□□□ -2.33
Q0144	Q0144	YAL064W-B	O13512	126 aa		0.47	□□□□□ -2.33
Q0144	Q0144	YHR032W-A	P0C5N6	59 aa		0.47	□□□□□ -2.33
Q0144	Q0144	YMR111C	Q04461	462 aa	Predicted RBP	0.47	□□□□□ -2.33
Q0144	Q0144	CTR3	Q06686	241 aa		0.47	□□□□□ -2.33
Q0144	Q0144	SIA1	Q12212	622 aa		0.47	□□□□□ -2.33
Q0144	Q0144	RPL5	P26321	297 aa	Known RBP	0.46	□□□□□ -2.34
Q0144	Q0144	CWP1	P28319	239 aa		0.46	□□□□□ -2.34
Q0144	Q0144	ATC1	Q04005	294 aa		0.46	□□□□□ -2.34
Q0144	Q0144	ATP6	P00854	259 aa		0.45	□□□□□ -2.34
Q0144	Q0144	PEX3	P28795	441 aa		0.45	□□□□□ -2.34
Q0144	Q0144	YJR079W	P47126	109 aa		0.45	□□□□□ -2.34
Q0144	Q0144	SLX9	P53251	210 aa	Predicted RBP	0.45	□□□□□ -2.34
Q0144	Q0144	DBP6	P53734	629 aa	Known RBP	0.45	□□□□□ -2.34
Q0144	Q0144	POM33	Q12164	279 aa		0.45	□□□□□ -2.34
Q0144	Q0144	RCY1	P39531	840 aa		0.44	□□□□□ -2.34
Q0144	Q0144	ARC15	P40518	154 aa	RIP-Chip data	0.44	□□□□□ -2.34	not detected
Q0144	Q0144	NFI1	Q12216	726 aa		0.44	□□□□□ -2.34
Q0144	Q0144	AKR2	Q12013	749 aa		0.43	□□□□□ -2.34
Q0144	Q0144	RCN1	P36054	211 aa		0.42	□□□□□ -2.34
Q0144	Q0144	ERV15	P38312	142 aa		0.42	□□□□□ -2.34
Q0144	Q0144	YGR219W	P53307	113 aa		0.42	□□□□□ -2.34
Q0144	Q0144	ERV29	P53337	310 aa		0.42	□□□□□ -2.34
Q0144	Q0144	CTF19	Q02732	369 aa		0.42	□□□□□ -2.34
Q0144	Q0144	AIM36	Q03798	255 aa		0.42	□□□□□ -2.34
Q0144	Q0144	SEC10	Q06245	871 aa		0.42	□□□□□ -2.34
Q0144	Q0144	FLO9	P39712	1322 aa		0.41	□□□□□ -2.34
Q0144	Q0144	Q0255	P03881	472 aa		0.41	□□□□□ -2.34
Q0144	Q0144	GPA2	P10823	449 aa		0.41	□□□□□ -2.34
Q0144	Q0144	AIM20	P40451	204 aa		0.41	□□□□□ -2.34
Q0144	Q0144	YKE4	P40544	346 aa		0.41	□□□□□ -2.34
Q0144	Q0144	YGR026W	P53217	278 aa		0.41	□□□□□ -2.34
Q0144	Q0144	VPS20	Q04272	221 aa		0.41	□□□□□ -2.34
Q0144	Q0144	USB1	Q12208	290 aa	Known RBP	0.41	□□□□□ -2.34
Q0144	Q0144	PSY3	Q12318	242 aa		0.41	□□□□□ -2.34
Q0144	Q0144	AI5_BETA	Q9ZZX0	354 aa		0.41	□□□□□ -2.34
Q0144	Q0144	TDA11	P38854	504 aa		0.4	□□□□□ -2.35
Q0144	Q0144	PRM9	P39551	298 aa		0.4	□□□□□ -2.35
Q0144	Q0144	CAR2	P07991	424 aa	Known RBP	0.39	□□□□□ -2.35
Q0144	Q0144	RPL4A	P10664	362 aa	Known RBP	0.39	□□□□□ -2.35
Q0144	Q0144	OAC1	P32332	324 aa		0.39	□□□□□ -2.35
Q0144	Q0144	PRS4	P38063	326 aa	Predicted RBP	0.39	□□□□□ -2.35
Q0144	Q0144	RPL4B	P49626	362 aa	Known RBP	0.39	□□□□□ -2.35
Q0144	Q0144	YNL050C	P53952	270 aa		0.39	□□□□□ -2.35
Q0144	Q0144	YOS9	Q99220	542 aa		0.39	□□□□□ -2.35
Q0144	Q0144	END3	P39013	349 aa		0.38	□□□□□ -2.35
Q0144	Q0144	SER33	P40510	469 aa		0.38	□□□□□ -2.35
Q0144	Q0144	ARP5	P53946	755 aa		0.38	□□□□□ -2.35
Q0144	Q0144	SML1	Q04964	104 aa		0.38	□□□□□ -2.35
Q0144	Q0144	ILV1	P00927	576 aa	Known RBP	0.37	□□□□□ -2.35
Q0144	Q0144	CDC37	P06101	506 aa	Known RBP	0.37	□□□□□ -2.35
Q0144	Q0144	ICL1	P28240	557 aa	Predicted RBP	0.37	□□□□□ -2.35
Q0144	Q0144	COS8	P38723	381 aa		0.37	□□□□□ -2.35
Q0144	Q0144	PEX31	P53203	462 aa		0.37	□□□□□ -2.35
Q0144	Q0144	UGA1	P17649	471 aa		0.36	□□□□□ -2.35
Q0144	Q0144	AGE2	P40529	298 aa		0.36	□□□□□ -2.35
Q0144	Q0144	YMR279C	Q03263	540 aa		0.36	□□□□□ -2.35
Q0144	Q0144	GPN3	Q06543	272 aa		0.36	□□□□□ -2.35
Q0144	Q0144	BBP1	Q12365	385 aa		0.36	□□□□□ -2.35
Q0144	Q0144	CDC40	P40968	455 aa	Predicted RBP	0.35	□□□□□ -2.35
Q0144	Q0144	AGP3	P43548	558 aa		0.35	□□□□□ -2.35
Q0144	Q0144	EMP46	Q12396	444 aa		0.35	□□□□□ -2.35
Q0144	Q0144	SEC22	P22214	214 aa		0.34	□□□□□ -2.36
Q0144	Q0144	YHL049C	P38722	271 aa		0.34	□□□□□ -2.36
Q0144	Q0144	YHR125W	P38831	101 aa		0.34	□□□□□ -2.36
Q0144	Q0144	CTR2	P38865	189 aa		0.34	□□□□□ -2.36
Q0144	Q0144	LOH1	P47055	219 aa		0.34	□□□□□ -2.36
Q0144	Q0144	MPA43	P53583	542 aa	Predicted RBP	0.34	□□□□□ -2.36
Q0144	Q0144	YLR297W	Q05899	129 aa		0.33	□□□□□ -2.36
Q0144	Q0144	RPC40	P07703	335 aa	Known RBP	0.32	□□□□□ -2.36
Q0144	Q0144	YPR011C	Q12251	326 aa		0.32	□□□□□ -2.36
Q0144	Q0144	SVP26	P38869	228 aa		0.31	□□□□□ -2.36
Q0144	Q0144	ERP4	Q12450	207 aa		0.31	□□□□□ -2.36
Q0144	Q0144	QCR8	P08525	94 aa		0.3	□□□□□ -2.36
Q0144	Q0144	HEK2	P38199	381 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.3	□□□□□ -2.36	not detected
Q0144	Q0144	RIB4	P50861	169 aa	Predicted RBP	0.3	□□□□□ -2.36
Q0144	Q0144	YMR007W	Q03675	126 aa		0.3	□□□□□ -2.36
Q0144	Q0144	RCF1	Q03713	159 aa		0.3	□□□□□ -2.36
Q0144	Q0144	BER1	Q06688	274 aa	Known RBP	0.3	□□□□□ -2.36

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 53 ms