RNA–Protein interactions for RNA: Q0143

Q0143, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene Q0143, Length 153 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
Q0143Q0143 YNR068CP53754 272 aa-2.64□□□□□ -2.83
Q0143Q0143 RPL9AP05738 191 aaKnown RBP-2.65□□□□□ -2.83
Q0143Q0143 VMA11P32842 164 aa-2.65□□□□□ -2.83
Q0143Q0143 YHR125WP38831 101 aa-2.65□□□□□ -2.83
Q0143Q0143 RPL9BP51401 191 aaKnown RBP-2.65□□□□□ -2.83
Q0143Q0143 UBC13P52490 153 aa-2.65□□□□□ -2.83
Q0143Q0143 EMI1Q04406 187 aa-2.65□□□□□ -2.83
Q0143Q0143 RGS2Q99188 309 aa-2.65□□□□□ -2.83
Q0143Q0143 EBP2P36049 427 aaKnown RBP-2.66□□□□□ -2.84
Q0143Q0143 BTT1P40314 149 aaPredicted RBP-2.66□□□□□ -2.84
Q0143Q0143 ARO8P53090 500 aaKnown RBP-2.66□□□□□ -2.84
Q0143Q0143 ARP5P53946 755 aa-2.66□□□□□ -2.84
Q0143Q0143 RCE1Q03530 315 aa-2.66□□□□□ -2.84
Q0143Q0143 YML018CQ03730 393 aa-2.66□□□□□ -2.84
Q0143Q0143 YMR310CQ04867 317 aaPredicted RBP-2.66□□□□□ -2.84
Q0143Q0143 YLR287CQ05881 355 aa-2.66□□□□□ -2.84
Q0143Q0143 THR4P16120 514 aaKnown RBP-2.67□□□□□ -2.84
Q0143Q0143 YHL042WP38729 150 aa-2.67□□□□□ -2.84
Q0143Q0143 YHR122WP38829 231 aa-2.67□□□□□ -2.84
Q0143Q0143 MSW1P04803 379 aa-2.68□□□□□ -2.84
Q0143Q0143 PDX1P16451 410 aa-2.68□□□□□ -2.84
Q0143Q0143 TIR3P40552 269 aa-2.68□□□□□ -2.84
Q0143Q0143 GPM3Q12326 303 aa-2.68□□□□□ -2.84
Q0143Q0143 BBP1Q12365 385 aa-2.68□□□□□ -2.84
Q0143Q0143 COX5AP00424 153 aa-2.69□□□□□ -2.84
Q0143Q0143 PRS4P38063 326 aaPredicted RBP-2.69□□□□□ -2.84
Q0143Q0143 SIP3P38717 1229 aa-2.69□□□□□ -2.84
Q0143Q0143 COS8P38723 381 aa-2.69□□□□□ -2.84
Q0143Q0143 PEX17P40155 199 aa-2.69□□□□□ -2.84
Q0143Q0143 YIL102CP40488 101 aa-2.69□□□□□ -2.84
Q0143Q0143 SPP2Q02521 185 aa-2.69□□□□□ -2.84
Q0143Q0143 SPE3Q12074 293 aaKnown RBP-2.69□□□□□ -2.84
Q0143Q0143 YMR316C-AI2HB70 103 aa-2.7□□□□□ -2.84
Q0143Q0143 YLL053CP0CD98 152 aa-2.7□□□□□ -2.84
Q0143Q0143 RPL1AP0CX43 217 aaKnown RBP-2.7□□□□□ -2.84
Q0143Q0143 RPL1BP0CX44 217 aaKnown RBP-2.7□□□□□ -2.84
Q0143Q0143 NPT1P39683 429 aaKnown RBP-2.7□□□□□ -2.84
Q0143Q0143 FLX1P40464 311 aa-2.7□□□□□ -2.84
Q0143Q0143 RPL33BP41056 107 aaKnown RBP-2.7□□□□□ -2.84
Q0143Q0143 MGA1P53050 456 aa-2.7□□□□□ -2.84
Q0143Q0143 MET5P47169 1442 aa-2.7□□□□□ -2.84
Q0143Q0143 FMP27Q06179 2628 aa-2.71□□□□□ -2.84
Q0143Q0143 CWP1P28319 239 aa-2.71□□□□□ -2.84
Q0143Q0143 GAA1P39012 614 aa-2.71□□□□□ -2.84
Q0143Q0143 SWC4P53201 476 aa-2.71□□□□□ -2.84
Q0143Q0143 RVB1Q03940 463 aaKnown RBP-2.71□□□□□ -2.84
Q0143Q0143 ARR2Q06597 130 aa-2.71□□□□□ -2.84
Q0143Q0143 YOR114WQ12219 294 aa-2.71□□□□□ -2.84
Q0143Q0143 CAM1P29547 415 aaKnown RBP-2.72□□□□□ -2.84
Q0143Q0143 VMA5P31412 392 aaKnown RBP-2.72□□□□□ -2.84
Q0143Q0143 FET3P38993 636 aa-2.72□□□□□ -2.84
Q0143Q0143 AIF1P52923 378 aa-2.72□□□□□ -2.84
Q0143Q0143 BOL2P53082 120 aa-2.72□□□□□ -2.84
Q0143Q0143 CUS2P53830 285 aaPredicted RBP-2.72□□□□□ -2.84
Q0143Q0143 CWC27Q02770 301 aa-2.72□□□□□ -2.84
Q0143Q0143 RMT2Q03305 412 aa-2.72□□□□□ -2.84
Q0143Q0143 DPP1Q05521 289 aa-2.72□□□□□ -2.84
Q0143Q0143 YFH1Q07540 174 aa-2.73□□□□□ -2.85
Q0143Q0143 YNL217WP40152 326 aa-2.74□□□□□ -2.85
Q0143Q0143 RRP42Q12277 265 aaPredicted RBP-2.74□□□□□ -2.85
Q0143Q0143 YPR064WQ12492 139 aa-2.74□□□□□ -2.85
Q0143Q0143 TOR2P32600 2474 aaKnown RBP-2.74□□□□□ -2.85
Q0143Q0143 SUA5P32579 426 aa-2.75□□□□□ -2.85
Q0143Q0143 RXT2P38255 430 aa-2.75□□□□□ -2.85
Q0143Q0143 SAY1P53324 424 aa-2.75□□□□□ -2.85
Q0143Q0143 SDC1Q03323 175 aa-2.75□□□□□ -2.85
Q0143Q0143 SEC22P22214 214 aa-2.76□□□□□ -2.85
Q0143Q0143 VPS60Q03390 229 aa-2.76□□□□□ -2.85
Q0143Q0143 TSR2Q06672 205 aaKnown RBP-2.76□□□□□ -2.85
Q0143Q0143 RRS1Q08746 203 aaKnown RBP-2.76□□□□□ -2.85
Q0143Q0143 ERJ5P43613 295 aaPredicted RBP-2.77□□□□□ -2.85
Q0143Q0143 YPR117WQ06116 2489 aa-2.77□□□□□ -2.85
Q0143Q0143 RPS0AP32905 252 aaKnown RBP-2.78□□□□□ -2.85
Q0143Q0143 YMR209CQ03648 457 aa-2.78□□□□□ -2.85
Q0143Q0143 LOA1Q06508 300 aa-2.78□□□□□ -2.85
Q0143Q0143 HEM25Q07534 307 aa-2.78□□□□□ -2.85
Q0143Q0143 SIR4P11978 1358 aa-2.78□□□□□ -2.85
Q0143Q0143 PEX3P28795 441 aa-2.79□□□□□ -2.86
Q0143Q0143 GLG2P47011 380 aa-2.79□□□□□ -2.86
Q0143Q0143 EMP46Q12396 444 aa-2.79□□□□□ -2.86
Q0143Q0143 IZH4Q99393 312 aa-2.79□□□□□ -2.86
Q0143Q0143 GRX2P17695 143 aaKnown RBP-2.8□□□□□ -2.86
Q0143Q0143 FUR1P18562 216 aaKnown RBP-2.8□□□□□ -2.86
Q0143Q0143 RRF1P38771 230 aa-2.8□□□□□ -2.86
Q0143Q0143 VPS45P38932 577 aa-2.8□□□□□ -2.86
Q0143Q0143 MNT4P53745 580 aa-2.8□□□□□ -2.86
Q0143Q0143 CCW12Q12127 133 aa-2.8□□□□□ -2.86
Q0143Q0143 YCL042WP25572 119 aa-2.81□□□□□ -2.86
Q0143Q0143 ATC1Q04005 294 aa-2.81□□□□□ -2.86
Q0143Q0143 PET494P07390 489 aaPredicted RBP-2.82□□□□□ -2.86
Q0143Q0143 RPL27BP0C2H7 136 aaKnown RBP-2.82□□□□□ -2.86
Q0143Q0143 RPL31AP0C2H8 113 aaKnown RBP-2.82□□□□□ -2.86
Q0143Q0143 TFC1P32367 649 aa-2.82□□□□□ -2.86
Q0143Q0143 BUD27P43573 796 aaKnown RBP RIP-Chip data-2.82□□□□□ -2.86not detected
Q0143Q0143 VBA1Q04301 562 aa-2.82□□□□□ -2.86
Q0143Q0143 YPR011CQ12251 326 aa-2.82□□□□□ -2.86
Q0143Q0143 SPO24Q3E752 67 aa-2.82□□□□□ -2.86
Q0143Q0143 CDC36P06100 191 aaPredicted RBP-2.83□□□□□ -2.86
Q0143Q0143 CUE3P53137 624 aaKnown RBP-2.83□□□□□ -2.86
Q0143Q0143 OKP1P53298 406 aa-2.83□□□□□ -2.86
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 24.5 ms